Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
R3hdm1E9Q9Q2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
R3hdm1E9Q9Q2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
R3hdm1E9Q9Q2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
R3hdm1E9Q9Q2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
R3hdm1E9Q9Q2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
R3hdm1E9Q9Q2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
R3hdm1E9Q9Q2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
R3hdm1E9Q9Q2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
R3hdm1E9Q9Q2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
R3hdm1E9Q9Q2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
R3hdm1E9Q9Q2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
R3hdm1E9Q9Q2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
R3hdm1E9Q9Q2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
R3hdm1E9Q9Q2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
R3hdm1E9Q9Q2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
R3hdm1E9Q9Q2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
R3hdm1E9Q9Q2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
R3hdm1E9Q9Q2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
R3hdm1E9Q9Q2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
R3hdm1E9Q9Q2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
R3hdm1E9Q9Q2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
R3hdm1E9Q9Q2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
R3hdm1E9Q9Q2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
R3hdm1E9Q9Q2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
R3hdm1E9Q9Q2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
R3hdm1E9Q9Q2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
R3hdm1E9Q9Q2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
R3hdm1E9Q9Q2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
R3hdm1E9Q9Q2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
R3hdm1E9Q9Q2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
R3hdm1E9Q9Q2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
R3hdm1E9Q9Q2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
R3hdm1E9Q9Q2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
R3hdm1E9Q9Q2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
R3hdm1E9Q9Q2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
R3hdm1E9Q9Q2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
R3hdm1E9Q9Q2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
R3hdm1E9Q9Q2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
R3hdm1E9Q9Q2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
R3hdm1E9Q9Q2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
R3hdm1E9Q9Q2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
R3hdm1E9Q9Q2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
R3hdm1E9Q9Q2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
R3hdm1E9Q9Q2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
R3hdm1E9Q9Q2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
R3hdm1E9Q9Q2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
R3hdm1E9Q9Q2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
R3hdm1E9Q9Q2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
R3hdm1E9Q9Q2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
R3hdm1E9Q9Q2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
R3hdm1E9Q9Q2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
R3hdm1E9Q9Q2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
R3hdm1E9Q9Q2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
R3hdm1E9Q9Q2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
R3hdm1E9Q9Q2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
R3hdm1E9Q9Q2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
R3hdm1E9Q9Q2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
R3hdm1E9Q9Q2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
R3hdm1E9Q9Q2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
R3hdm1E9Q9Q2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
R3hdm1E9Q9Q2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
R3hdm1E9Q9Q2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
R3hdm1E9Q9Q2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
R3hdm1E9Q9Q2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
R3hdm1E9Q9Q2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
R3hdm1E9Q9Q2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
R3hdm1E9Q9Q2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
R3hdm1E9Q9Q2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
R3hdm1E9Q9Q2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
R3hdm1E9Q9Q2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
R3hdm1E9Q9Q2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
R3hdm1E9Q9Q2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
R3hdm1E9Q9Q2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
R3hdm1E9Q9Q2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
R3hdm1E9Q9Q2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
R3hdm1E9Q9Q2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
R3hdm1E9Q9Q2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
R3hdm1E9Q9Q2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
R3hdm1E9Q9Q2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
R3hdm1E9Q9Q2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
R3hdm1E9Q9Q2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
R3hdm1E9Q9Q2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
R3hdm1E9Q9Q2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
R3hdm1E9Q9Q2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
R3hdm1E9Q9Q2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
R3hdm1E9Q9Q2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
R3hdm1E9Q9Q2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
R3hdm1E9Q9Q2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
R3hdm1E9Q9Q2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
R3hdm1E9Q9Q2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
R3hdm1E9Q9Q2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
R3hdm1E9Q9Q2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
R3hdm1E9Q9Q2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
R3hdm1E9Q9Q2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
R3hdm1E9Q9Q2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
R3hdm1E9Q9Q2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
R3hdm1E9Q9Q2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms