Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FancfE9Q5Z5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FancfE9Q5Z5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FancfE9Q5Z5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
FancfE9Q5Z5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FancfE9Q5Z5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FancfE9Q5Z5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
FancfE9Q5Z5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FancfE9Q5Z5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FancfE9Q5Z5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FancfE9Q5Z5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FancfE9Q5Z5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
FancfE9Q5Z5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FancfE9Q5Z5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FancfE9Q5Z5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FancfE9Q5Z5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FancfE9Q5Z5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FancfE9Q5Z5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FancfE9Q5Z5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FancfE9Q5Z5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FancfE9Q5Z5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FancfE9Q5Z5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FancfE9Q5Z5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FancfE9Q5Z5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
FancfE9Q5Z5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
FancfE9Q5Z5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FancfE9Q5Z5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FancfE9Q5Z5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FancfE9Q5Z5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FancfE9Q5Z5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FancfE9Q5Z5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FancfE9Q5Z5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FancfE9Q5Z5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FancfE9Q5Z5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FancfE9Q5Z5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FancfE9Q5Z5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FancfE9Q5Z5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FancfE9Q5Z5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FancfE9Q5Z5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FancfE9Q5Z5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FancfE9Q5Z5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FancfE9Q5Z5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FancfE9Q5Z5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FancfE9Q5Z5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FancfE9Q5Z5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
FancfE9Q5Z5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FancfE9Q5Z5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FancfE9Q5Z5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FancfE9Q5Z5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FancfE9Q5Z5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FancfE9Q5Z5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FancfE9Q5Z5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FancfE9Q5Z5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FancfE9Q5Z5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FancfE9Q5Z5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FancfE9Q5Z5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FancfE9Q5Z5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FancfE9Q5Z5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FancfE9Q5Z5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FancfE9Q5Z5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FancfE9Q5Z5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FancfE9Q5Z5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FancfE9Q5Z5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FancfE9Q5Z5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FancfE9Q5Z5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FancfE9Q5Z5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FancfE9Q5Z5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FancfE9Q5Z5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FancfE9Q5Z5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FancfE9Q5Z5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FancfE9Q5Z5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FancfE9Q5Z5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FancfE9Q5Z5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FancfE9Q5Z5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FancfE9Q5Z5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FancfE9Q5Z5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FancfE9Q5Z5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FancfE9Q5Z5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FancfE9Q5Z5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FancfE9Q5Z5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FancfE9Q5Z5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FancfE9Q5Z5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FancfE9Q5Z5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FancfE9Q5Z5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FancfE9Q5Z5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FancfE9Q5Z5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FancfE9Q5Z5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FancfE9Q5Z5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FancfE9Q5Z5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FancfE9Q5Z5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FancfE9Q5Z5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FancfE9Q5Z5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FancfE9Q5Z5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FancfE9Q5Z5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FancfE9Q5Z5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FancfE9Q5Z5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FancfE9Q5Z5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FancfE9Q5Z5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FancfE9Q5Z5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FancfE9Q5Z5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
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