Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdzd2E9Q1M1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdzd2E9Q1M1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdzd2E9Q1M1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdzd2E9Q1M1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdzd2E9Q1M1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdzd2E9Q1M1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdzd2E9Q1M1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdzd2E9Q1M1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdzd2E9Q1M1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd2E9Q1M1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd2E9Q1M1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd2E9Q1M1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd2E9Q1M1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd2E9Q1M1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzd2E9Q1M1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzd2E9Q1M1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd2E9Q1M1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd2E9Q1M1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzd2E9Q1M1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd2E9Q1M1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd2E9Q1M1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzd2E9Q1M1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pdzd2E9Q1M1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzd2E9Q1M1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzd2E9Q1M1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzd2E9Q1M1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzd2E9Q1M1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzd2E9Q1M1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzd2E9Q1M1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzd2E9Q1M1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzd2E9Q1M1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzd2E9Q1M1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzd2E9Q1M1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzd2E9Q1M1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzd2E9Q1M1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzd2E9Q1M1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzd2E9Q1M1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzd2E9Q1M1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzd2E9Q1M1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzd2E9Q1M1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzd2E9Q1M1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdzd2E9Q1M1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzd2E9Q1M1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzd2E9Q1M1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzd2E9Q1M1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzd2E9Q1M1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzd2E9Q1M1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzd2E9Q1M1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzd2E9Q1M1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdzd2E9Q1M1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdzd2E9Q1M1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdzd2E9Q1M1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdzd2E9Q1M1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdzd2E9Q1M1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdzd2E9Q1M1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdzd2E9Q1M1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdzd2E9Q1M1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdzd2E9Q1M1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdzd2E9Q1M1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdzd2E9Q1M1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdzd2E9Q1M1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd2E9Q1M1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd2E9Q1M1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd2E9Q1M1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd2E9Q1M1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd2E9Q1M1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd2E9Q1M1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzd2E9Q1M1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd2E9Q1M1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd2E9Q1M1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd2E9Q1M1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd2E9Q1M1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd2E9Q1M1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd2E9Q1M1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd2E9Q1M1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd2E9Q1M1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd2E9Q1M1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzd2E9Q1M1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdzd2E9Q1M1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdzd2E9Q1M1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdzd2E9Q1M1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdzd2E9Q1M1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdzd2E9Q1M1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdzd2E9Q1M1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdzd2E9Q1M1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzd2E9Q1M1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzd2E9Q1M1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdzd2E9Q1M1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzd2E9Q1M1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzd2E9Q1M1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzd2E9Q1M1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzd2E9Q1M1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdzd2E9Q1M1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdzd2E9Q1M1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdzd2E9Q1M1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzd2E9Q1M1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzd2E9Q1M1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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