Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC52.64■■■■■ 6.02
Abcc8B2RUS7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC52.64■■■■■ 6.02
Abcc8B2RUS7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC52.63■■■■■ 6.02
Abcc8B2RUS7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.62■■■■■ 6.01
Abcc8B2RUS7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.62■■■■■ 6.01
Abcc8B2RUS7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC52.6■■■■■ 6.01
Abcc8B2RUS7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC52.59■■■■■ 6.01
Abcc8B2RUS7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC52.55■■■■■ 6
Abcc8B2RUS7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC52.54■■■■■ 6
Abcc8B2RUS7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC52.51■■■■■ 6
Abcc8B2RUS7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC52.51■■■■■ 6
Abcc8B2RUS7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.51■■■■■ 6
Abcc8B2RUS7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.49■■■■■ 5.99
Abcc8B2RUS7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC52.47■■■■■ 5.99
Abcc8B2RUS7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC52.42■■■■■ 5.98
Abcc8B2RUS7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC52.41■■■■■ 5.98
Abcc8B2RUS7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC52.4■■■■■ 5.98
Abcc8B2RUS7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC52.38■■■■■ 5.98
Abcc8B2RUS7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.37■■■■■ 5.97
Abcc8B2RUS7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC52.37■■■■■ 5.97
Abcc8B2RUS7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC52.37■■■■■ 5.97
Abcc8B2RUS7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.36■■■■■ 5.97
Abcc8B2RUS7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC52.35■■■■■ 5.97
Abcc8B2RUS7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.34■■■■■ 5.97
Abcc8B2RUS7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.33■■■■■ 5.97
Abcc8B2RUS7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.31■■■■■ 5.96
Abcc8B2RUS7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.31■■■■■ 5.96
Abcc8B2RUS7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.3■■■■■ 5.96
Abcc8B2RUS7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.29■■■■■ 5.96
Abcc8B2RUS7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.29■■■■■ 5.96
Abcc8B2RUS7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC52.29■■■■■ 5.96
Abcc8B2RUS7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC52.28■■■■■ 5.96
Abcc8B2RUS7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.28■■■■■ 5.96
Abcc8B2RUS7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.27■■■■■ 5.96
Abcc8B2RUS7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC52.27■■■■■ 5.96
Abcc8B2RUS7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC52.26■■■■■ 5.96
Abcc8B2RUS7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC52.25■■■■■ 5.95
Abcc8B2RUS7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.25■■■■■ 5.95
Abcc8B2RUS7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC52.21■■■■■ 5.95
Abcc8B2RUS7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC52.21■■■■■ 5.95
Abcc8B2RUS7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.21■■■■■ 5.95
Abcc8B2RUS7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC52.18■■■■■ 5.94
Abcc8B2RUS7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC52.17■■■■■ 5.94
Abcc8B2RUS7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.17■■■■■ 5.94
Abcc8B2RUS7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.17■■■■■ 5.94
Abcc8B2RUS7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC52.16■■■■■ 5.94
Abcc8B2RUS7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC52.15■■■■■ 5.94
Abcc8B2RUS7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.14■■■■■ 5.94
Abcc8B2RUS7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC52.14■■■■■ 5.94
Abcc8B2RUS7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.14■■■■■ 5.94
Abcc8B2RUS7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC52.13■■■■■ 5.93
Abcc8B2RUS7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC52.11■■■■■ 5.93
Abcc8B2RUS7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC52.1■■■■■ 5.93
Abcc8B2RUS7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC52.09■■■■■ 5.93
Abcc8B2RUS7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.02■■■■■ 5.92
Abcc8B2RUS7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC52.01■■■■■ 5.92
Abcc8B2RUS7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.01■■■■■ 5.92
Abcc8B2RUS7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.99■■■■■ 5.91
Abcc8B2RUS7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC51.97■■■■■ 5.91
Abcc8B2RUS7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC51.96■■■■■ 5.91
Abcc8B2RUS7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC51.95■■■■■ 5.91
Abcc8B2RUS7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC51.95■■■■■ 5.91
Abcc8B2RUS7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.94■■■■■ 5.91
Abcc8B2RUS7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.94■■■■■ 5.91
Abcc8B2RUS7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.93■■■■■ 5.9
Abcc8B2RUS7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC51.92■■■■■ 5.9
Abcc8B2RUS7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC51.91■■■■■ 5.9
Abcc8B2RUS7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC51.9■■■■■ 5.9
Abcc8B2RUS7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC51.89■■■■■ 5.9
Abcc8B2RUS7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.88■■■■■ 5.9
Abcc8B2RUS7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC51.87■■■■■ 5.89
Abcc8B2RUS7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC51.85■■■■■ 5.89
Abcc8B2RUS7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC51.84■■■■■ 5.89
Abcc8B2RUS7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC51.83■■■■■ 5.89
Abcc8B2RUS7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC51.82■■■■■ 5.89
Abcc8B2RUS7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.8■■■■■ 5.88
Abcc8B2RUS7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.8■■■■■ 5.88
Abcc8B2RUS7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC51.78■■■■■ 5.88
Abcc8B2RUS7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC51.77■■■■■ 5.88
Abcc8B2RUS7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC51.77■■■■■ 5.88
Abcc8B2RUS7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.76■■■■■ 5.88
Abcc8B2RUS7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC51.76■■■■■ 5.88
Abcc8B2RUS7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC51.74■■■■■ 5.87
Abcc8B2RUS7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.73■■■■■ 5.87
Abcc8B2RUS7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC51.73■■■■■ 5.87
Abcc8B2RUS7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.72■■■■■ 5.87
Abcc8B2RUS7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.72■■■■■ 5.87
Abcc8B2RUS7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.71■■■■■ 5.87
Abcc8B2RUS7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.68■■■■■ 5.86
Abcc8B2RUS7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC51.67■■■■■ 5.86
Abcc8B2RUS7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC51.66■■■■■ 5.86
Abcc8B2RUS7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC51.66■■■■■ 5.86
Abcc8B2RUS7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC51.65■■■■■ 5.86
Abcc8B2RUS7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC51.64■■■■■ 5.86
Abcc8B2RUS7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC51.61■■■■■ 5.85
Abcc8B2RUS7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.61■■■■■ 5.85
Abcc8B2RUS7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC51.6■■■■■ 5.85
Abcc8B2RUS7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC51.56■■■■■ 5.84
Abcc8B2RUS7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC51.56■■■■■ 5.84
Abcc8B2RUS7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC51.56■■■■■ 5.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms