Protein–RNA interactions for Protein: P12319

FCER1A, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCER1AP12319 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FCER1AP12319 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FCER1AP12319 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FCER1AP12319 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FCER1AP12319 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FCER1AP12319 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FCER1AP12319 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FCER1AP12319 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FCER1AP12319 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FCER1AP12319 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FCER1AP12319 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FCER1AP12319 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FCER1AP12319 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FCER1AP12319 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FCER1AP12319 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FCER1AP12319 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FCER1AP12319 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FCER1AP12319 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FCER1AP12319 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FCER1AP12319 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FCER1AP12319 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FCER1AP12319 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FCER1AP12319 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FCER1AP12319 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FCER1AP12319 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FCER1AP12319 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FCER1AP12319 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FCER1AP12319 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FCER1AP12319 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FCER1AP12319 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FCER1AP12319 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FCER1AP12319 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FCER1AP12319 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FCER1AP12319 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms