Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC93Q567U6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms