Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 UTP23YOR004W 765 nt4.14□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 YPL261CYPL261C 309 nt4.14□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 ARL1YBR164C 552 nt4.14□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 MON1YGL124C 1935 nt4.14□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 YGL140CYGL140C 3660 nt4.14□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 CDC45YLR103C 1953 nt4.14□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 SEC6YIL068C 2418 nt4.14□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 GCN5YGR252W 1320 nt4.14□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 DAD1YDR016C 285 nt4.13□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 TVP15YDR100W 432 nt4.13□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 YIP1YGR172C 747 nt4.13□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 YJL175WYJL175W 513 nt4.13□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 SAS2YMR127C 1017 nt4.13□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 MIC27YNL100W 705 nt4.13□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 CSI2YOL007C 1026 nt4.13□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 RNR1YER070W 2667 nt4.13□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 ISM1YPL040C 3009 nt4.13□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 YDL163WYDL163W 303 nt4.12□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 YDR018CYDR018C 1191 nt4.12□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt4.12□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 YGR114CYGR114C 390 nt4.12□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 CMS1YLR003C 876 nt4.12□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 YMR144WYMR144W 1029 nt4.12□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 YOR082CYOR082C 342 nt4.12□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 MCA1YOR197W 1299 nt4.12□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 YPL088WYPL088W 1029 nt4.12□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 NIP7YPL211W 546 nt4.12□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 ADF1YCL058W-A 342 nt4.12□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 SPT10YJL127C 1923 nt4.12□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 PMT6YGR199W 2280 nt4.12□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 GCD2YGR083C 1956 nt4.12□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt4.12□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt4.12□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt4.12□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 GPI1YGR216C 1830 nt4.11□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 IMD4YML056C 1575 nt4.11□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 PWP2YCR057C 2772 nt4.11□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 LRS4YDR439W 1044 nt4.11□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 MPC3YGR243W 441 nt4.11□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 YLR334CYLR334C 381 nt4.11□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 MRPL44YMR225C 297 nt4.11□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 YNL122CYNL122C 348 nt4.11□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 TSR4YOL022C 1227 nt4.11□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 RBL2YOR265W 321 nt4.11□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 KRE2YDR483W 1329 nt4.11□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 KIN3YAR018C 1308 nt4.11□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 GLC3YEL011W 2115 nt4.1□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 RPO31YOR116C 4383 nt4.1□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 AML1YGR001C 747 nt4.1□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 YGR045CYGR045C 363 nt4.1□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt4.1□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 YIR014WYIR014W 729 nt4.1□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 VMA5YKL080W 1179 nt4.1□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 ERP1YAR002C-A 660 nt4.1□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 YLR290CYLR290C 834 nt4.1□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 AIM36YMR157C 768 nt4.1□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 YNL203CYNL203C 612 nt4.1□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 KAR4YCL055W 1008 nt4.1□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 MLH2YLR035C 2088 nt4.1□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 RAD4YER162C 2265 nt4.1□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 RAD2YGR258C 3096 nt4.1□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 MCM7YBR202W 2538 nt4.1□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 PPZ1YML016C 2079 nt4.09□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 snR5snR5 204 nt4.09□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 THO1YER063W 657 nt4.09□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 MTM1YGR257C 1101 nt4.09□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 POG1YIL122W 1056 nt4.09□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 YJL007CYJL007C 315 nt4.09□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 YAL004WYAL004W 648 nt4.09□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 MAK16YAL025C 921 nt4.09□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt4.09□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 RLP7YNL002C 969 nt4.09□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 YPR012WYPR012W 255 nt4.09□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 ESA1YOR244W 1338 nt4.09□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 CHK1YBR274W 1584 nt4.09□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 CAF130YGR134W 3369 nt4.09□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 ARO1YDR127W 4767 nt4.09□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 PEX1YKL197C 3132 nt4.08□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 YDR271CYDR271C 372 nt4.08□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 YDR340WYDR340W 303 nt4.08□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 XRS2YDR369C 2565 nt4.08□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt4.08□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt4.08□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 YGR190CYGR190C 366 nt4.08□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 ENT3YJR125C 1227 nt4.08□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 KAP95YLR347C 2586 nt4.08□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 UBX4YMR067C 1251 nt4.08□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt4.08□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt4.08□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 DIB1YPR082C 432 nt4.08□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 YPR136CYPR136C 513 nt4.08□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 YCL020WYCL020W 1317 nt4.08□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 JEN1YKL217W 1851 nt4.07□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 SWH1YAR042W 3567 nt4.07□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 ETP1YHL010C 1758 nt4.07□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 YER084W-AYER084W-A 513 nt4.07□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 YHR213WYHR213W 597 nt4.07□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 CFD1YIL003W 882 nt4.07□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 ILM1YJR118C 612 nt4.07□□□□□ -1.76
CLF1Q12309 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt4.07□□□□□ -1.76
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