Protein–RNA interactions for Protein: Q12234

RUD3, GRIP domain-containing protein RUD3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RUD3Q12234 THI80YOR143C 960 nt2.85□□□□□ -1.95
RUD3Q12234 TRA1YHR099W 11235 nt2.85□□□□□ -1.95
RUD3Q12234 TOP2YNL088W 4287 nt2.85□□□□□ -1.95
RUD3Q12234 ESC1YMR219W 4977 nt2.85□□□□□ -1.95
RUD3Q12234 SMY2YBR172C 2223 nt2.84□□□□□ -1.95
RUD3Q12234 SKO1YNL167C 1944 nt2.84□□□□□ -1.95
RUD3Q12234 SMX2YFL017W-A 234 nt2.84□□□□□ -1.95
RUD3Q12234 MRPL6YHR147C 645 nt2.84□□□□□ -1.95
RUD3Q12234 RPL15AYLR029C 615 nt2.84□□□□□ -1.95
RUD3Q12234 APC9YLR102C 798 nt2.84□□□□□ -1.95
RUD3Q12234 JIP3YLR331C 378 nt2.84□□□□□ -1.95
RUD3Q12234 DSE3YOR264W 1293 nt2.84□□□□□ -1.95
RUD3Q12234 RRG7YOR305W 729 nt2.84□□□□□ -1.95
RUD3Q12234 BCK1YJL095W 4437 nt2.84□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 SLI1YGR212W 1407 nt2.84□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 YKU80YMR106C 1890 nt2.84□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 CTH1YDR151C 978 nt2.83□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 PRP18YGR006W 756 nt2.83□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 YGR064WYGR064W 369 nt2.83□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 DID4YKL002W 699 nt2.83□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 YLR012CYLR012C 300 nt2.83□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 RPS10AYOR293W 318 nt2.83□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 ATG29YPL166W 642 nt2.83□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 MRD1YPR112C 2664 nt2.83□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.82□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 SUL1YBR294W 2580 nt2.82□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 SIN3YOL004W 4611 nt2.82□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 RDI1YDL135C 609 nt2.82□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 YDR535CYDR535C 501 nt2.82□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 IRC6YFR043C 714 nt2.82□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 MST27YGL051W 705 nt2.82□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 YGR190CYGR190C 366 nt2.82□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 RIM9YMR063W 720 nt2.82□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 RPL23AYBL087C 414 nt2.82□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 PKP2YGL059W 1476 nt2.82□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 AI2Q0055 2565 nt2.82□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 SPH1YLR313C 1593 nt2.82□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.81□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 YIL024CYIL024C 570 nt2.81□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt2.81□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 DCG1YIR030C 735 nt2.81□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 ERG20YJL167W 1059 nt2.81□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 PSY3YLR376C 729 nt2.81□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 SAM37YMR060C 984 nt2.81□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 POL30YBR088C 777 nt2.81□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 SAD1YFR005C 1347 nt2.81□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 VPS9YML097C 1356 nt2.81□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 NMA111YNL123W 2994 nt2.8□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 RIM13YMR154C 2184 nt2.8□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 ORC2YBR060C 1863 nt2.8□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 SAS4YDR181C 1446 nt2.8□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 RPL23BYER117W 414 nt2.8□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 BRR6YGL247W 594 nt2.8□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 MRPL9YGR220C 810 nt2.8□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 SSN2YDR443C 4263 nt2.8□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 CWH41YGL027C 2502 nt2.8□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 NAB3YPL190C 2409 nt2.8□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.8□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.8□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.8□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.8□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.8□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 YCL019WYCL019W 5313 nt2.8□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 MPS1YDL028C 2295 nt2.8□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 PSD2YGR170W 3417 nt2.8□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 SLP1YOR154W 1764 nt2.79□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 YLR001CYLR001C 2589 nt2.79□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 PIS1YPR113W 663 nt2.79□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 TIM12YBR091C 330 nt2.79□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 MRPL27YBR282W 441 nt2.79□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 SIR3YLR442C 2937 nt2.79□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 SAK1YER129W 3429 nt2.79□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 YKR078WYKR078W 1758 nt2.79□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 AVT2YEL064C 1443 nt2.78□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 HMF1YER057C 390 nt2.78□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 YER147C-AYER147C-A 411 nt2.78□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 YGR114CYGR114C 390 nt2.78□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 LSM8YJR022W 330 nt2.78□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 YJR056CYJR056C 711 nt2.78□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 TRM112YNR046W 408 nt2.78□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 ATG34YOL083W 1239 nt2.78□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 HSP10YOR020C 321 nt2.78□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 ENP2YGR145W 2124 nt2.78□□□□□ -1.96
RUD3Q12234 YIL080WYIL080W 4722 nt2.77□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 PHO2YDL106C 1680 nt2.77□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 RNH202YDR279W 1053 nt2.77□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 ERP6YGL002W 651 nt2.77□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 RLI1YDR091C 1827 nt2.77□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 snR57snR57 88 nt2.76□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 MTD1YKR080W 963 nt2.76□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 YLR400WYLR400W 474 nt2.76□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 YMR087WYMR087W 855 nt2.76□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 KTI11YBL071W-A 249 nt2.76□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt2.76□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 RPO41YFL036W 4056 nt2.76□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 TMA64YDR117C 1698 nt2.76□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 CET1YPL228W 1650 nt2.76□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 VHR1YIL056W 1923 nt2.76□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 MSH4YFL003C 2637 nt2.75□□□□□ -1.97
RUD3Q12234 SEC26YDR238C 2922 nt2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 54.9 ms