Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCN11AQ9UI33 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms