Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 YIL024CYIL024C 570 nt2.73□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 EBP2YKL172W 1284 nt2.73□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 YNL035CYNL035C 1170 nt2.73□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 YNR062CYNR062C 984 nt2.73□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 YPR142CYPR142C 564 nt2.73□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 YPR203WYPR203W 309 nt2.73□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 RIX1YHR197W 2292 nt2.73□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 MRS2YOR334W 1413 nt2.73□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 TPO5YKL174C 1857 nt2.73□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 YJR061WYJR061W 2808 nt2.73□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 BPT1YLL015W 4680 nt2.72□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 RPL35BYDL136W 363 nt2.72□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 YGR064WYGR064W 369 nt2.72□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 SLI1YGR212W 1407 nt2.72□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 ESL1YIL151C 3357 nt2.72□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 YLL037WYLL037W 381 nt2.72□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 USB1YLR132C 873 nt2.72□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 RED1YLR263W 2484 nt2.72□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 REC102YLR329W 795 nt2.72□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 YBL028CYBL028C 321 nt2.72□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 RPS10AYOR293W 318 nt2.72□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 SRC1YML034W 2505 nt2.72□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 ECM29YHL030W 5607 nt2.72□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 PKP2YGL059W 1476 nt2.71□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 DIA2YOR080W 2199 nt2.71□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 JSN1YJR091C 3276 nt2.71□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 RPN4YDL020C 1596 nt2.71□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 RIM1YCR028C-A 408 nt2.71□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 YDR193WYDR193W 399 nt2.71□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 PEF1YGR058W 1008 nt2.71□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 YHR097CYHR097C 1101 nt2.71□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 SOL3YHR163W 750 nt2.71□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 RIM9YMR063W 720 nt2.71□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 SPP381YBR152W 876 nt2.71□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt2.71□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 HMF1YER057C 390 nt2.7□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 KEG1YFR042W 603 nt2.7□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt2.7□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 MTD1YKR080W 963 nt2.7□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 ILV5YLR355C 1188 nt2.7□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 YNR068CYNR068C 819 nt2.7□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt2.7□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 TOM1YDR457W 9807 nt2.7□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 YDL026WYDL026W 312 nt2.69□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 YDL050CYDL050C 372 nt2.69□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 TFA2YKR062W 987 nt2.69□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 YLR012CYLR012C 300 nt2.69□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 YLR076CYLR076C 423 nt2.69□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 APC9YLR102C 798 nt2.69□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 EAF7YNL136W 1278 nt2.69□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 RPL33AYPL143W 324 nt2.69□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 NUM1YDR150W 8247 nt2.69□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 SWC4YGR002C 1431 nt2.68□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 PAM1YDR251W 2493 nt2.68□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 RIF1YBR275C 5751 nt2.68□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 YDL186WYDL186W 834 nt2.68□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 RRG1YDR065W 1098 nt2.68□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.68□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 YGR073CYGR073C 372 nt2.68□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 TDA8YAL064C-A 381 nt2.68□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 SIC1YLR079W 855 nt2.68□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 YMR087WYMR087W 855 nt2.68□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 YMR178WYMR178W 825 nt2.68□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 RUF20RUF20 443 nt2.68□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 TAF3YPL011C 1062 nt2.68□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 POL30YBR088C 777 nt2.68□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 VPS9YML097C 1356 nt2.68□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 GYP7YDL234C 2241 nt2.68□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 SOK1YDR006C 2706 nt2.67□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 SPH1YLR313C 1593 nt2.67□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 ARI1YGL157W 1044 nt2.67□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 RPS25AYGR027C 327 nt2.67□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 MTM1YGR257C 1101 nt2.67□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 YJR128WYJR128W 360 nt2.67□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 AAR2YBL074C 1068 nt2.67□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 YOR114WYOR114W 885 nt2.67□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 FIG1YBR040W 897 nt2.67□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 PPT2YPL148C 522 nt2.67□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 YPR027CYPR027C 834 nt2.67□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 APD1YBR151W 951 nt2.67□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 LDH1YBR204C 1128 nt2.67□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 MED1YPR070W 1701 nt2.67□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.66□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 MPS1YDL028C 2295 nt2.66□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 CDC20YGL116W 1833 nt2.66□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 RPS22AYJL190C 393 nt2.66□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 NDL1YLR254C 570 nt2.66□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 EAP1YKL204W 1899 nt2.66□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 POL3YDL102W 3294 nt2.66□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 BNI4YNL233W 2679 nt2.65□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 YCK2YNL154C 1641 nt2.65□□□□□ -1.98
SNF8Q12483 ECM11YDR446W 909 nt2.65□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 PEX14YGL153W 1026 nt2.65□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt2.65□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 RPL15AYLR029C 615 nt2.65□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 JIP3YLR331C 378 nt2.65□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 SAM37YMR060C 984 nt2.65□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 ATP11YNL315C 957 nt2.65□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 TIM12YBR091C 330 nt2.65□□□□□ -1.99
SNF8Q12483 NET1YJL076W 3570 nt2.65□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 61.2 ms