Protein–RNA interactions for Protein: Q07807

PUF3, mRNA-binding protein PUF3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF3Q07807 YML133W-BYML133W-B 483 nt4.81□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt4.81□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt4.81□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 GRX7YBR014C 612 nt4.81□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 MRM1YOR201C 1239 nt4.81□□□□□ -1.64 RIP-Chip
PUF3Q07807 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt4.81□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt4.81□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt4.81□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 SAC1YKL212W 1872 nt4.81□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 GCD2YGR083C 1956 nt4.8□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 YCR013CYCR013C 648 nt4.8□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 YDL012CYDL012C 324 nt4.8□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 SNA2YDR525W-A 240 nt4.8□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 RPS25AYGR027C 327 nt4.8□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 YHL049CYHL049C 816 nt4.8□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 RPL13BYMR142C 600 nt4.8□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 INA17YPL099C 549 nt4.8□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 YPL114WYPL114W 420 nt4.8□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 snR24snR24 89 nt4.8□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 TFB2YPL122C 1542 nt4.8□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 CLF1YLR117C 2064 nt4.8□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 YGR125WYGR125W 3111 nt4.79□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 YPR148CYPR148C 1308 nt4.79□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 MEF2YJL102W 2460 nt4.79□□□□□ -1.64 RIP-Chip
PUF3Q07807 NGL3YML118W 1518 nt4.79□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 PRM1YNL279W 1986 nt4.79□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 GPP1YIL053W 753 nt4.79□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 YJR111CYJR111C 852 nt4.79□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 MRPL31YKL138C 396 nt4.79□□□□□ -1.64 RIP-Chip
PUF3Q07807 TPK3YKL166C 1197 nt4.79□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt4.79□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 SAP30YMR263W 606 nt4.79□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 RPS19AYOL121C 435 nt4.79□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 SPN1YPR133C 1233 nt4.79□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 PCA1YBR295W 3651 nt4.79□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 SLY41YOR307C 1362 nt4.78□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 ECM32YER176W 3366 nt4.78□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 GAT2YMR136W 1683 nt4.78□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 FMN1YDR236C 657 nt4.78□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 YER076CYER076C 909 nt4.78□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 YGR017WYGR017W 894 nt4.78□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 RTS3YGR161C 792 nt4.78□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 YJR079WYJR079W 330 nt4.78□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 BSC3YLR465C 309 nt4.78□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 TPO2YGR138C 1845 nt4.78□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 SIF2YBR103W 1608 nt4.78□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 GPB1YOR371C 2694 nt4.78□□□□□ -1.64
PUF3Q07807 MEF1YLR069C 2286 nt4.77□□□□□ -1.65 RIP-Chip
PUF3Q07807 YER158CYER158C 1722 nt4.77□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 BUD13YGL174W 801 nt4.77□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 ATG33YLR356W 594 nt4.77□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 MCM1YMR043W 861 nt4.77□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 YNL296WYNL296W 315 nt4.77□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt4.77□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 FAR8YMR029C 1572 nt4.77□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 MCP2YLR253W 1710 nt4.77□□□□□ -1.65 RIP-Chip
PUF3Q07807 MAG2YLR427W 2013 nt4.77□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 MSC2YDR205W 2175 nt4.77□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 TGL4YKR089C 2733 nt4.76□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 VID22YLR373C 2706 nt4.76□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 SKO1YNL167C 1944 nt4.76□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 NHP2YDL208W 471 nt4.76□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 LAG1YHL003C 1236 nt4.76□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt4.76□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 YHR097CYHR097C 1101 nt4.76□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt4.76□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 COA3YJL062W-A 258 nt4.76□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 YJL220WYJL220W 453 nt4.76□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 YAR029WYAR029W 225 nt4.76□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 YML108WYML108W 318 nt4.76□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 YMR320WYMR320W 306 nt4.76□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 TRM112YNR046W 408 nt4.76□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 NSL1YPL233W 651 nt4.76□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 OPY2YPR075C 1083 nt4.76□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 GEM1YAL048C 1989 nt4.76□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 PEX29YDR479C 1665 nt4.76□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 EGT2YNL327W 3126 nt4.76□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 TRM12YML005W 1389 nt4.76□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 PIG2YIL045W 1617 nt4.75□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 HIS4YCL030C 2400 nt4.75□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 DBP3YGL078C 1572 nt4.75□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 YJR098CYJR098C 1971 nt4.75□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 FAR7YFR008W 666 nt4.75□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 MAK16YAL025C 921 nt4.75□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt4.75□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 RIO2YNL207W 1278 nt4.75□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 AIM4YBR194W 372 nt4.75□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 YGR266WYGR266W 2106 nt4.75□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 POL12YBL035C 2118 nt4.75□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 HFA1YMR207C 6372 nt4.75□□□□□ -1.65 RIP-Chip
PUF3Q07807 ATM1YMR301C 2073 nt4.74□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 RKM3YBR030W 1659 nt4.74□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 ARF2YDL137W 546 nt4.74□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 RRP45YDR280W 918 nt4.74□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 YGR069WYGR069W 336 nt4.74□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 YGR269WYGR269W 327 nt4.74□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 RPL8AYHL033C 771 nt4.74□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 PDP3YLR455W 915 nt4.74□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 YNL198CYNL198C 303 nt4.74□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 POP3YNL282W 588 nt4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 33.6 ms