Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDK12Q9NYV4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CDK12Q9NYV4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDK12Q9NYV4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.5 ms