Protein–RNA interactions for Protein: Q96B42

TMEM18, Transmembrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM18Q96B42 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM18Q96B42 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM18Q96B42 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM18Q96B42 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM18Q96B42 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM18Q96B42 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM18Q96B42 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM18Q96B42 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM18Q96B42 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM18Q96B42 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM18Q96B42 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM18Q96B42 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM18Q96B42 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM18Q96B42 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM18Q96B42 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM18Q96B42 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM18Q96B42 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM18Q96B42 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM18Q96B42 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM18Q96B42 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM18Q96B42 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM18Q96B42 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms