Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 TEX1YNL253W 1269 nt2.79□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 RSM19YNR037C 276 nt2.79□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt2.79□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 YOR385WYOR385W 873 nt2.79□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 MRP2YPR166C 348 nt2.79□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 RAX2YLR084C 3663 nt2.79□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 PUF6YDR496C 1971 nt2.79□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 BEM4YPL161C 1902 nt2.79□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 MDM1YML104C 3384 nt2.79□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 RCY1YJL204C 2523 nt2.79□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 CET1YPL228W 1650 nt2.79□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 MET5YJR137C 4329 nt2.79□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 SEC7YDR170C 6030 nt2.78□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 DYN1YKR054C 12279 nt2.78□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 EXO70YJL085W 1872 nt2.78□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 TLC1TLC1 1301 nt2.78□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 RDS2YPL133C 1341 nt2.78□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 HTA1YDR225W 399 nt2.78□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 YGR039WYGR039W 312 nt2.78□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 DCG1YIR030C 735 nt2.78□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 DID4YKL002W 699 nt2.78□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 YNL109WYNL109W 546 nt2.78□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 YAT2YER024W 2772 nt2.78□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 YKL222CYKL222C 2118 nt2.78□□□□□ -1.96
SNF8Q12483 ILS1YBL076C 3219 nt2.77□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 MTL1YGR023W 1656 nt2.77□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 NHP10YDL002C 612 nt2.77□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 MRH1YDR033W 963 nt2.77□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 RRT13YER066W 558 nt2.77□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 AIM11YER093C-A 414 nt2.77□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 ATG27YJL178C 816 nt2.77□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 GLO1YML004C 981 nt2.77□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 TEM1YML064C 738 nt2.77□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt2.77□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 GPI2YPL076W 843 nt2.77□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 TFC4YGR047C 3078 nt2.77□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 EXO84YBR102C 2262 nt2.76□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 ARF1YDL192W 546 nt2.76□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 YDL241WYDL241W 372 nt2.76□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 RAD55YDR076W 1221 nt2.76□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 THO1YER063W 657 nt2.76□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 TAN1YGL232W 870 nt2.76□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 POP6YGR030C 477 nt2.76□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 MRPL6YHR147C 645 nt2.76□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 PCL7YIL050W 858 nt2.76□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 ATP12YJL180C 978 nt2.76□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 SWD2YKL018W 990 nt2.76□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 VMA5YKL080W 1179 nt2.76□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 YLR230WYLR230W 306 nt2.76□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 YML047W-AYML047W-A 366 nt2.76□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 RPL19BYBL027W 570 nt2.76□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 YBL096CYBL096C 309 nt2.76□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 YOR062CYOR062C 807 nt2.76□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 PFY1YOR122C 381 nt2.76□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 TPK2YPL203W 1143 nt2.76□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 MRPL27YBR282W 441 nt2.76□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 CIK1YMR198W 1785 nt2.76□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 MOT1YPL082C 5604 nt2.76□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 MMS1YPR164W 4224 nt2.76□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 RSM23YGL129C 1353 nt2.75□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 NDT80YHR124W 1884 nt2.75□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 FRE2YKL220C 2136 nt2.75□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 RRP42YDL111C 798 nt2.75□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 RDI1YDL135C 609 nt2.75□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 YGR190CYGR190C 366 nt2.75□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt2.75□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 SPO20YMR017W 1194 nt2.75□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt2.75□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 BUD21YOR078W 645 nt2.75□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 SYC1YOR179C 567 nt2.75□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 YPR050CYPR050C 414 nt2.75□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 STE23YLR389C 3084 nt2.75□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 CLN2YPL256C 1638 nt2.75□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 YCG1YDR325W 3108 nt2.75□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 RPA190YOR341W 4995 nt2.74□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 TAF2YCR042C 4224 nt2.74□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 YME2YMR302C 2553 nt2.74□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 PDC2YDR081C 2778 nt2.74□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 MNT3YIL014W 1893 nt2.74□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 YEL075CYEL075C 369 nt2.74□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 GLG2YJL137C 1143 nt2.74□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 SMA2YML066C 1110 nt2.74□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 TRM112YNR046W 408 nt2.74□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt2.74□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt2.74□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 YBR116CYBR116C 528 nt2.74□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 GRX1YCL035C 333 nt2.74□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 YIL169CYIL169C 2988 nt2.74□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 GYL1YMR192W 2163 nt2.74□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 YGR067CYGR067C 2415 nt2.73□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 RSN1YMR266W 2862 nt2.73□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 PSK1YAL017W 4071 nt2.73□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 TSC13YDL015C 933 nt2.73□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 YDR491CYDR491C 492 nt2.73□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 RPL23BYER117W 414 nt2.73□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 ISC10YER180C 804 nt2.73□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt2.73□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 YGL118CYGL118C 438 nt2.73□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 YGR114CYGR114C 390 nt2.73□□□□□ -1.97
SNF8Q12483 EFG1YGR271C-A 702 nt2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.4 ms