Protein–RNA interactions for Protein: P48304

REG1B, Lithostathine-1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG1BP48304 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
REG1BP48304 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
REG1BP48304 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
REG1BP48304 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
REG1BP48304 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
REG1BP48304 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
REG1BP48304 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
REG1BP48304 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
REG1BP48304 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
REG1BP48304 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
REG1BP48304 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
REG1BP48304 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
REG1BP48304 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
REG1BP48304 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
REG1BP48304 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
REG1BP48304 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
REG1BP48304 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
REG1BP48304 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
REG1BP48304 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
REG1BP48304 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
REG1BP48304 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
REG1BP48304 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
REG1BP48304 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
REG1BP48304 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
REG1BP48304 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
REG1BP48304 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
REG1BP48304 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
REG1BP48304 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
REG1BP48304 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
REG1BP48304 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
REG1BP48304 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
REG1BP48304 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
REG1BP48304 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
REG1BP48304 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
REG1BP48304 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
REG1BP48304 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
REG1BP48304 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
REG1BP48304 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
REG1BP48304 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
REG1BP48304 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
REG1BP48304 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
REG1BP48304 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
REG1BP48304 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
REG1BP48304 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
REG1BP48304 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
REG1BP48304 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
REG1BP48304 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
REG1BP48304 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
REG1BP48304 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
REG1BP48304 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
REG1BP48304 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
REG1BP48304 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
REG1BP48304 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
REG1BP48304 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
REG1BP48304 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
REG1BP48304 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
REG1BP48304 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
REG1BP48304 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
REG1BP48304 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
REG1BP48304 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
REG1BP48304 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
REG1BP48304 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
REG1BP48304 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
REG1BP48304 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
REG1BP48304 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
REG1BP48304 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
REG1BP48304 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
REG1BP48304 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
REG1BP48304 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
REG1BP48304 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
REG1BP48304 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
REG1BP48304 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
REG1BP48304 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
REG1BP48304 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
REG1BP48304 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
REG1BP48304 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
REG1BP48304 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
REG1BP48304 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
REG1BP48304 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
REG1BP48304 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
REG1BP48304 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
REG1BP48304 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
REG1BP48304 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
REG1BP48304 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
REG1BP48304 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
REG1BP48304 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
REG1BP48304 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
REG1BP48304 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
REG1BP48304 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
REG1BP48304 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
REG1BP48304 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
REG1BP48304 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
REG1BP48304 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
REG1BP48304 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
REG1BP48304 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
REG1BP48304 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
REG1BP48304 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
REG1BP48304 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
REG1BP48304 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
REG1BP48304 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms