Protein–RNA interactions for Protein: Q12255

NYV1, Vacuolar v-SNARE NYV1, yeastyeast

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NYV1Q12255 NKP1YDR383C 717 nt4.23□□□□□ -1.73
NYV1Q12255 OST5YGL226C-A 261 nt4.23□□□□□ -1.73
NYV1Q12255 YGR283CYGR283C 1026 nt4.23□□□□□ -1.73
NYV1Q12255 YHR180WYHR180W 492 nt4.23□□□□□ -1.73
NYV1Q12255 SVP26YHR181W 687 nt4.23□□□□□ -1.73
NYV1Q12255 EMC2YJR088C 879 nt4.23□□□□□ -1.73
NYV1Q12255 RPC25YKL144C 639 nt4.23□□□□□ -1.73
NYV1Q12255 SRT1YMR101C 1032 nt4.23□□□□□ -1.73
NYV1Q12255 GPI12YMR281W 915 nt4.23□□□□□ -1.73
NYV1Q12255 MIC27YNL100W 705 nt4.23□□□□□ -1.73
NYV1Q12255 ISM1YPL040C 3009 nt4.23□□□□□ -1.73
NYV1Q12255 SEA4YBL104C 3117 nt4.23□□□□□ -1.73
NYV1Q12255 PIN4YBL051C 2007 nt4.22□□□□□ -1.73
NYV1Q12255 VAC7YNL054W 3498 nt4.22□□□□□ -1.73
NYV1Q12255 HOM2YDR158W 1098 nt4.22□□□□□ -1.73
NYV1Q12255 HTB1YDR224C 396 nt4.22□□□□□ -1.73
NYV1Q12255 GUK1YDR454C 564 nt4.22□□□□□ -1.73
NYV1Q12255 YDR491CYDR491C 492 nt4.22□□□□□ -1.73
NYV1Q12255 APC9YLR102C 798 nt4.22□□□□□ -1.73
NYV1Q12255 PBA1YLR199C 831 nt4.22□□□□□ -1.73
NYV1Q12255 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt4.22□□□□□ -1.73
NYV1Q12255 TRS120YDR407C 3870 nt4.22□□□□□ -1.73
NYV1Q12255 KIC1YHR102W 3243 nt4.21□□□□□ -1.73
NYV1Q12255 VAC8YEL013W 1737 nt4.21□□□□□ -1.73
NYV1Q12255 YNR063WYNR063W 1824 nt4.21□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt4.21□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 LRS4YDR439W 1044 nt4.21□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt4.21□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt4.21□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt4.21□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt4.21□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt4.21□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt4.21□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt4.21□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 PTI1YGR156W 1278 nt4.21□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 COX6YHR051W 447 nt4.21□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 PPT2YPL148C 522 nt4.21□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 CDC14YFR028C 1656 nt4.21□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 WHI3YNL197C 1986 nt4.21□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 EMC1YCL045C 2283 nt4.21□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 SLM2YNL047C 1971 nt4.2□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 VPS9YML097C 1356 nt4.2□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 SPT2YER161C 1002 nt4.2□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 YGL242CYGL242C 546 nt4.2□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 YGR114CYGR114C 390 nt4.2□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 YOL153CYOL153C 1746 nt4.2□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 SAG1YJR004C 1953 nt4.2□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 PKP2YGL059W 1476 nt4.19□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 YCR099CYCR099C 468 nt4.19□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 MRH1YDR033W 963 nt4.19□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt4.19□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt4.19□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 MPS2YGL075C 1164 nt4.19□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 YHR097CYHR097C 1101 nt4.19□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 RIB5YBR256C 717 nt4.19□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 RRN11YML043C 1524 nt4.19□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 BUD27YFL023W 2391 nt4.19□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 YPP1YGR198W 2454 nt4.18□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 EXO5YBR163W 1758 nt4.18□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 EBS1YDR206W 2655 nt4.18□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 TRX3YCR083W 384 nt4.18□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 RPL13AYDL082W 600 nt4.18□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 YGL108CYGL108C 423 nt4.18□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 SRP40YKR092C 1221 nt4.18□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 SMD2YLR275W 333 nt4.18□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 RPA43YOR340C 981 nt4.18□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 SUC2YIL162W 1599 nt4.18□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 FUN12YAL035W 3009 nt4.18□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 YLR152CYLR152C 1731 nt4.18□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 MIS1YBR084W 2928 nt4.18□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 ITT1YML068W 1395 nt4.17□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 YDR089WYDR089W 2610 nt4.17□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 RRP42YDL111C 798 nt4.17□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 DTD1YDL219W 453 nt4.17□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt4.17□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 COA4YLR218C 453 nt4.17□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 YMR087WYMR087W 855 nt4.17□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt4.17□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 RLP7YNL002C 969 nt4.17□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 DIM1YPL266W 957 nt4.17□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 ASI1YMR119W 1875 nt4.17□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 MSR1YHR091C 1932 nt4.17□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 AI4Q0065 1671 nt4.16□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 PHO81YGR233C 3537 nt4.16□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 SEC27YGL137W 2670 nt4.16□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 GAC1YOR178C 2382 nt4.16□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 YDL158CYDL158C 309 nt4.16□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 TGL2YDR058C 981 nt4.16□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 CGR1YGL029W 363 nt4.16□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 MIG2YGL209W 1149 nt4.16□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 ERP1YAR002C-A 660 nt4.16□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 TEM1YML064C 738 nt4.16□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 YOR238WYOR238W 912 nt4.16□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 POL30YBR088C 777 nt4.16□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 CDC5YMR001C 2118 nt4.16□□□□□ -1.74
NYV1Q12255 YCF1YDR135C 4548 nt4.15□□□□□ -1.75
NYV1Q12255 BTN2YGR142W 1233 nt4.15□□□□□ -1.75
NYV1Q12255 YJR111CYJR111C 852 nt4.15□□□□□ -1.75
NYV1Q12255 RNH203YLR154C 333 nt4.15□□□□□ -1.75
NYV1Q12255 COQ9YLR201C 783 nt4.15□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 40.9 ms