Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVL5

Uncharacterized protein FLJ43738 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVL5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1B0GVL5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms