Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TSEN34Q9BSV6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms