Protein–RNA interactions for Protein: Q96LP6

C12orf42, Uncharacterized protein C12orf42, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf42Q96LP6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C12orf42Q96LP6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C12orf42Q96LP6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C12orf42Q96LP6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C12orf42Q96LP6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C12orf42Q96LP6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C12orf42Q96LP6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C12orf42Q96LP6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C12orf42Q96LP6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C12orf42Q96LP6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms