Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8D1

PDCD7, Programmed cell death protein 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD7Q8N8D1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCD7Q8N8D1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD7Q8N8D1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms