Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPB1P53618 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPB1P53618 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPB1P53618 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPB1P53618 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPB1P53618 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPB1P53618 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPB1P53618 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPB1P53618 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPB1P53618 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPB1P53618 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPB1P53618 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB1P53618 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB1P53618 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB1P53618 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB1P53618 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB1P53618 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB1P53618 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB1P53618 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB1P53618 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB1P53618 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB1P53618 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB1P53618 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB1P53618 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB1P53618 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB1P53618 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB1P53618 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB1P53618 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPB1P53618 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPB1P53618 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPB1P53618 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPB1P53618 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
COPB1P53618 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPB1P53618 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPB1P53618 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
COPB1P53618 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPB1P53618 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPB1P53618 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
COPB1P53618 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPB1P53618 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPB1P53618 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COPB1P53618 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COPB1P53618 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COPB1P53618 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COPB1P53618 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COPB1P53618 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPB1P53618 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPB1P53618 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPB1P53618 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPB1P53618 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPB1P53618 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPB1P53618 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPB1P53618 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPB1P53618 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPB1P53618 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPB1P53618 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPB1P53618 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPB1P53618 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPB1P53618 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPB1P53618 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPB1P53618 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPB1P53618 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPB1P53618 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPB1P53618 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPB1P53618 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPB1P53618 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPB1P53618 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPB1P53618 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPB1P53618 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
COPB1P53618 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPB1P53618 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPB1P53618 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPB1P53618 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPB1P53618 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPB1P53618 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPB1P53618 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPB1P53618 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPB1P53618 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPB1P53618 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPB1P53618 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPB1P53618 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPB1P53618 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPB1P53618 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPB1P53618 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPB1P53618 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPB1P53618 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPB1P53618 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
COPB1P53618 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPB1P53618 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
COPB1P53618 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPB1P53618 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPB1P53618 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPB1P53618 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPB1P53618 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPB1P53618 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPB1P53618 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPB1P53618 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPB1P53618 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPB1P53618 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPB1P53618 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms