Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NPAS3Q8IXF0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NPAS3Q8IXF0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPAS3Q8IXF0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms