Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF38BQ5VTL8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms