Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODF4Q2M2E3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODF4Q2M2E3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ODF4Q2M2E3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODF4Q2M2E3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODF4Q2M2E3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODF4Q2M2E3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODF4Q2M2E3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODF4Q2M2E3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODF4Q2M2E3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODF4Q2M2E3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF4Q2M2E3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF4Q2M2E3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF4Q2M2E3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF4Q2M2E3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF4Q2M2E3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF4Q2M2E3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF4Q2M2E3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms