Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEC24CP53992 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24CP53992 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms