Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF1P21675 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF1P21675 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF1P21675 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF1P21675 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF1P21675 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF1P21675 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF1P21675 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF1P21675 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF1P21675 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF1P21675 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF1P21675 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF1P21675 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF1P21675 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF1P21675 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF1P21675 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF1P21675 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF1P21675 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF1P21675 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF1P21675 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF1P21675 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF1P21675 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF1P21675 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAF1P21675 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAF1P21675 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAF1P21675 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAF1P21675 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAF1P21675 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAF1P21675 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAF1P21675 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAF1P21675 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAF1P21675 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TAF1P21675 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TAF1P21675 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TAF1P21675 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TAF1P21675 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TAF1P21675 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TAF1P21675 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TAF1P21675 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TAF1P21675 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TAF1P21675 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF1P21675 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF1P21675 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF1P21675 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF1P21675 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF1P21675 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF1P21675 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF1P21675 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF1P21675 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF1P21675 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF1P21675 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF1P21675 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF1P21675 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF1P21675 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF1P21675 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF1P21675 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF1P21675 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF1P21675 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF1P21675 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF1P21675 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF1P21675 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF1P21675 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF1P21675 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF1P21675 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF1P21675 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF1P21675 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF1P21675 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF1P21675 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF1P21675 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF1P21675 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF1P21675 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF1P21675 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF1P21675 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF1P21675 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF1P21675 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF1P21675 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF1P21675 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF1P21675 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF1P21675 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF1P21675 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF1P21675 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF1P21675 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF1P21675 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF1P21675 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF1P21675 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TAF1P21675 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TAF1P21675 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TAF1P21675 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TAF1P21675 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TAF1P21675 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TAF1P21675 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TAF1P21675 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TAF1P21675 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TAF1P21675 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TAF1P21675 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TAF1P21675 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TAF1P21675 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TAF1P21675 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TAF1P21675 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TAF1P21675 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms