Protein–RNA interactions for Protein: Q99797

MIPEP, Mitochondrial intermediate peptidase, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPEPQ99797 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MIPEPQ99797 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MIPEPQ99797 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MIPEPQ99797 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MIPEPQ99797 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MIPEPQ99797 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MIPEPQ99797 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MIPEPQ99797 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MIPEPQ99797 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MIPEPQ99797 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIPEPQ99797 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIPEPQ99797 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIPEPQ99797 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIPEPQ99797 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIPEPQ99797 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIPEPQ99797 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIPEPQ99797 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIPEPQ99797 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIPEPQ99797 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MIPEPQ99797 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIPEPQ99797 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIPEPQ99797 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIPEPQ99797 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MIPEPQ99797 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
MIPEPQ99797 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MIPEPQ99797 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MIPEPQ99797 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MIPEPQ99797 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MIPEPQ99797 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MIPEPQ99797 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MIPEPQ99797 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MIPEPQ99797 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIPEPQ99797 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms