Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms