Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD1Q15797 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms