Protein–RNA interactions for Protein: Q04599

MRPL1, 54S ribosomal protein L1, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 285 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPL1	Q04599	PPX1	YHR201C	1194 nt		3.93	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	RSM25	YIL093C	795 nt		3.93	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	SWD2	YKL018W	990 nt		3.93	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	YLR364C-A	YLR364C-A	123 nt		3.93	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	YMR187C	YMR187C	1296 nt		3.93	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	YBL059W	YBL059W	582 nt		3.93	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	SNF8	YPL002C	702 nt		3.93	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	YPR074W-A	YPR074W-A	171 nt		3.93	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	PCI8	YIL071C	1335 nt		3.93	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	PSY4	YBL046W	1326 nt		3.93	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	KAP114	YGL241W	3015 nt		3.92	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	PUB1	YNL016W	1362 nt		3.92	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	JHD2	YJR119C	2187 nt		3.92	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	YMR221C	YMR221C	1515 nt		3.92	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	DPH6	YLR143W	2058 nt		3.92	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	RVS161	YCR009C	798 nt		3.92	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	CBS1	YDL069C	690 nt		3.92	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	SNU23	YDL098C	585 nt		3.92	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	SHU2	YDR078C	672 nt		3.92	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	PDS1	YDR113C	1122 nt		3.92	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	RPL24A	YGL031C	468 nt		3.92	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	COX18	YGR062C	951 nt		3.92	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	COG2	YGR120C	789 nt		3.92	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	GLG2	YJL137C	1143 nt		3.92	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	YLR347W-A	YLR347W-A	141 nt		3.92	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	YML047W-A	YML047W-A	366 nt		3.92	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	YMR158C-A	YMR158C-A	138 nt		3.92	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	RRN9	YMR270C	1098 nt		3.92	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	YNL057W	YNL057W	333 nt		3.92	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	EOS1	YNL080C	1101 nt		3.92	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	TUM1	YOR251C	915 nt		3.92	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	FIG1	YBR040W	897 nt		3.92	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	CBP3	YPL215W	1008 nt		3.92	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	SPB4	YFL002C	1821 nt		3.92	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	MNR2	YKL064W	2910 nt		3.91	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	YDR179W-A	YDR179W-A	1392 nt		3.91	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	YCR108C	YCR108C	192 nt		3.91	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	ATP5	YDR298C	639 nt		3.91	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	PRE1	YER012W	597 nt		3.91	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	LYS5	YGL154C	819 nt		3.91	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	YJR157W	YJR157W	363 nt		3.91	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	ATG38	YLR211C	681 nt		3.91	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	YNL013C	YNL013C	378 nt		3.91	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	RPL18B	YNL301C	561 nt		3.91	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	RPL18A	YOL120C	561 nt		3.91	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	YCL007C	YCL007C	393 nt		3.91	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	DIP2	YLR129W	2832 nt		3.91	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	MAL12	YGR292W	1755 nt		3.91	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	MAL32	YBR299W	1755 nt		3.91	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	YLR152C	YLR152C	1731 nt		3.9	□□□□□ -1.78
MRPL1	Q04599	CIK1	YMR198W	1785 nt		3.9	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	YCL076W	YCL076W	744 nt		3.9	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	NHP10	YDL002C	612 nt		3.9	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	BET1	YIL004C	429 nt		3.9	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	YIR023C-A	YIR023C-A	324 nt		3.9	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	ACP1	YKL192C	378 nt		3.9	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	YAL065C	YAL065C	387 nt		3.9	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	NKP2	YLR315W	462 nt		3.9	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	GAL7	YBR018C	1101 nt		3.9	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	RRG7	YOR305W	729 nt		3.9	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	PEP7	YDR323C	1548 nt		3.9	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	NUG1	YER006W	1563 nt		3.89	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	YCL068C	YCL068C	783 nt		3.89	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	RPL27A	YHR010W	411 nt		3.89	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	PEX18	YHR160C	852 nt		3.89	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	YHR214C-D	YHR214C-D	294 nt		3.89	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	MNN11	YJL183W	1269 nt		3.89	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	BAT2	YJR148W	1131 nt		3.89	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	AUR1	YKL004W	1206 nt		3.89	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	RAD27	YKL113C	1149 nt		3.89	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	YPT52	YKR014C	705 nt		3.89	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	YAR069C	YAR069C	294 nt		3.89	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	SAM37	YMR060C	984 nt		3.89	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	NRK1	YNL129W	723 nt		3.89	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	UAF30	YOR295W	687 nt		3.89	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	ICY2	YPL250C	411 nt		3.89	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	YCL021W-A	YCL021W-A	378 nt		3.89	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	TRE2	YOR256C	2430 nt		3.89	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	MIC60	YKR016W	1623 nt		3.88	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	GAT2	YMR136W	1683 nt		3.88	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	AIM14	YGL160W	1713 nt		3.88	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	YHR173C	YHR173C	339 nt		3.88	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	SVP26	YHR181W	687 nt		3.88	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	MMF1	YIL051C	438 nt		3.88	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	ARG80	YMR042W	534 nt		3.88	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	TOM7	YNL070W	183 nt		3.88	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	YNL144W-A	YNL144W-A	84 nt		3.88	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	SUR1	YPL057C	1149 nt		3.88	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	YPL278C	YPL278C	303 nt		3.88	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	APL4	YPR029C	2499 nt		3.88	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	LYS2	YBR115C	4179 nt		3.87	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	RRN11	YML043C	1524 nt		3.87	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	RXT3	YDL076C	885 nt		3.87	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	YDR535C	YDR535C	501 nt		3.87	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	BUD13	YGL174W	801 nt		3.87	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	PTI1	YGR156W	1278 nt		3.87	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	GTR2	YGR163W	1026 nt		3.87	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	tR(ACG)Q2	tR(ACG)Q2	74 nt		3.87	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	GVP36	YIL041W	981 nt		3.87	□□□□□ -1.79
MRPL1	Q04599	FMP41	YNL168C	780 nt		3.87	□□□□□ -1.79

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.5 ms