Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHA12Q9UN75 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms