Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 GAP1YKR039W 1809 nt9.52□□□□□ -0.89
SNF8Q12483 PRM5YIL117C 957 nt9.52□□□□□ -0.89
SNF8Q12483 UTR1YJR049C 1593 nt9.51□□□□□ -0.89
SNF8Q12483 THI74YDR438W 1113 nt9.51□□□□□ -0.89
SNF8Q12483 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.5□□□□□ -0.89
SNF8Q12483 YML089CYML089C 369 nt9.47□□□□□ -0.89
SNF8Q12483 PHO89YBR296C 1725 nt9.47□□□□□ -0.89
SNF8Q12483 HIF1YLL022C 1158 nt9.46□□□□□ -0.9
SNF8Q12483 ATG15YCR068W 1563 nt9.46□□□□□ -0.9
SNF8Q12483 NAT4YMR069W 858 nt9.45□□□□□ -0.9
SNF8Q12483 TOM6YOR045W 186 nt9.45□□□□□ -0.9
SNF8Q12483 MSF1YPR047W 1410 nt9.45□□□□□ -0.9
SNF8Q12483 YSR3YKR053C 1215 nt9.44□□□□□ -0.9
SNF8Q12483 ALD4YOR374W 1560 nt9.44□□□□□ -0.9
SNF8Q12483 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.41□□□□□ -0.9
SNF8Q12483 COQ2YNR041C 1119 nt9.41□□□□□ -0.9
SNF8Q12483 DIF1YLR437C 402 nt9.39□□□□□ -0.91
SNF8Q12483 TIF6YPR016C 738 nt9.39□□□□□ -0.91
SNF8Q12483 HIP1YGR191W 1812 nt9.38□□□□□ -0.91
SNF8Q12483 YCR087WYCR087W 516 nt9.37□□□□□ -0.91
SNF8Q12483 PEX2YJL210W 816 nt9.37□□□□□ -0.91
SNF8Q12483 XYL2YLR070C 1071 nt9.37□□□□□ -0.91
SNF8Q12483 YGL034CYGL034C 366 nt9.36□□□□□ -0.91
SNF8Q12483 SAM35YHR083W 990 nt9.36□□□□□ -0.91
SNF8Q12483 YAT1YAR035W 2064 nt9.35□□□□□ -0.91
SNF8Q12483 MRP20YDR405W 792 nt9.34□□□□□ -0.91
SNF8Q12483 AIM45YPR004C 1035 nt9.32□□□□□ -0.92
SNF8Q12483 DBP1YPL119C 1854 nt9.3□□□□□ -0.92
SNF8Q12483 MET28YIR017C 564 nt9.29□□□□□ -0.92
SNF8Q12483 RPL4BYDR012W 1089 nt9.28□□□□□ -0.92
SNF8Q12483 RPL4AYBR031W 1089 nt9.28□□□□□ -0.92
SNF8Q12483 YAR028WYAR028W 705 nt9.26□□□□□ -0.93
SNF8Q12483 RPS14BYJL191W 417 nt9.25□□□□□ -0.93
SNF8Q12483 UTH1YKR042W 1098 nt9.25□□□□□ -0.93
SNF8Q12483 NRT1YOR071C 1797 nt9.24□□□□□ -0.93
SNF8Q12483 ZRT3YKL175W 1512 nt9.24□□□□□ -0.93
SNF8Q12483 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.23□□□□□ -0.93
SNF8Q12483 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.23□□□□□ -0.93
SNF8Q12483 CLB6YGR109C 1143 nt9.23□□□□□ -0.93
SNF8Q12483 MTG2YHR168W 1557 nt9.23□□□□□ -0.93
SNF8Q12483 HXT1YHR094C 1713 nt9.22□□□□□ -0.93
SNF8Q12483 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.2□□□□□ -0.94
SNF8Q12483 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.2□□□□□ -0.94
SNF8Q12483 RBG1YAL036C 1110 nt9.2□□□□□ -0.94
SNF8Q12483 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.2□□□□□ -0.94
SNF8Q12483 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.2□□□□□ -0.94
SNF8Q12483 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.2□□□□□ -0.94
SNF8Q12483 SED1YDR077W 1017 nt9.19□□□□□ -0.94
SNF8Q12483 YBL086CYBL086C 1401 nt9.19□□□□□ -0.94
SNF8Q12483 NDI1YML120C 1542 nt9.19□□□□□ -0.94
SNF8Q12483 RPC82YPR190C 1965 nt9.19□□□□□ -0.94
SNF8Q12483 FIT3YOR383C 615 nt9.18□□□□□ -0.94
SNF8Q12483 ZTA1YBR046C 1005 nt9.18□□□□□ -0.94
SNF8Q12483 SHY1YGR112W 1170 nt9.17□□□□□ -0.94
SNF8Q12483 LIP1YMR298W 453 nt9.17□□□□□ -0.94
SNF8Q12483 CMP2YML057W 1815 nt9.17□□□□□ -0.94
SNF8Q12483 YJL067WYJL067W 351 nt9.16□□□□□ -0.94
SNF8Q12483 INA1YLR413W 2028 nt9.15□□□□□ -0.94
SNF8Q12483 ALP1YNL270C 1722 nt9.15□□□□□ -0.94
SNF8Q12483 AKR2YOR034C 2250 nt9.15□□□□□ -0.95
SNF8Q12483 SPT20YOL148C 1815 nt9.12□□□□□ -0.95
SNF8Q12483 LEU9YOR108W 1815 nt9.12□□□□□ -0.95
SNF8Q12483 YPL251WYPL251W 303 nt9.1□□□□□ -0.95
SNF8Q12483 UFO1YML088W 2007 nt9.1□□□□□ -0.95
SNF8Q12483 YLR279WYLR279W 390 nt9.09□□□□□ -0.95
SNF8Q12483 TSC10YBR265W 963 nt9.09□□□□□ -0.95
SNF8Q12483 URA6YKL024C 615 nt9.07□□□□□ -0.96
SNF8Q12483 SBA1YKL117W 651 nt9.07□□□□□ -0.96
SNF8Q12483 SAM1YLR180W 1149 nt9.06□□□□□ -0.96
SNF8Q12483 BRR1YPR057W 1026 nt9.06□□□□□ -0.96
SNF8Q12483 HSL7YBR133C 2484 nt9.05□□□□□ -0.96
SNF8Q12483 MSB4YOL112W 1479 nt9.03□□□□□ -0.96
SNF8Q12483 YGR012WYGR012W 1182 nt9.03□□□□□ -0.96
SNF8Q12483 TOA2YKL058W 369 nt9.02□□□□□ -0.97
SNF8Q12483 SDH5YOL071W 489 nt9□□□□□ -0.97
SNF8Q12483 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.99□□□□□ -0.97
SNF8Q12483 OYE3YPL171C 1203 nt8.99□□□□□ -0.97
SNF8Q12483 GND2YGR256W 1479 nt8.98□□□□□ -0.97
SNF8Q12483 UGA4YDL210W 1716 nt8.98□□□□□ -0.97
SNF8Q12483 YMR103CYMR103C 363 nt8.98□□□□□ -0.97
SNF8Q12483 MEP3YPR138C 1470 nt8.97□□□□□ -0.97
SNF8Q12483 GLR1YPL091W 1452 nt8.96□□□□□ -0.97
SNF8Q12483 SSN3YPL042C 1668 nt8.95□□□□□ -0.98
SNF8Q12483 CAB5YDR196C 726 nt8.95□□□□□ -0.98
SNF8Q12483 RAD23YEL037C 1197 nt8.95□□□□□ -0.98
SNF8Q12483 PET8YNL003C 855 nt8.95□□□□□ -0.98
SNF8Q12483 FCY21YER060W 1587 nt8.95□□□□□ -0.98
SNF8Q12483 ILV3YJR016C 1758 nt8.94□□□□□ -0.98
SNF8Q12483 FRE6YLL051C 2139 nt8.93□□□□□ -0.98
SNF8Q12483 CWC15YDR163W 528 nt8.91□□□□□ -0.98
SNF8Q12483 APT2YDR441C 546 nt8.91□□□□□ -0.98
SNF8Q12483 YOR325WYOR325W 474 nt8.91□□□□□ -0.98
SNF8Q12483 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.9□□□□□ -0.98
SNF8Q12483 YMR244WYMR244W 1068 nt8.9□□□□□ -0.98
SNF8Q12483 HOL1YNR055C 1761 nt8.89□□□□□ -0.99
SNF8Q12483 FMS1YMR020W 1527 nt8.89□□□□□ -0.99
SNF8Q12483 FLR1YBR008C 1647 nt8.88□□□□□ -0.99
SNF8Q12483 ACH1YBL015W 1581 nt8.88□□□□□ -0.99
SNF8Q12483 OXA1YER154W 1209 nt8.88□□□□□ -0.99
SNF8Q12483 RIB3YDR487C 627 nt8.87□□□□□ -0.99
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