Protein–RNA interactions for Protein: Q12317

MSB4, GTPase-activating protein MSB4, yeastyeast

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSB4Q12317 NVJ2YPR091C 2313 nt12.94□□□□□ -0.34
MSB4Q12317 PTK1YKL198C 1989 nt12.94□□□□□ -0.34
MSB4Q12317 LYS4YDR234W 2082 nt12.93□□□□□ -0.34
MSB4Q12317 BOP3YNL042W 1191 nt12.91□□□□□ -0.34
MSB4Q12317 KTR3YBR205W 1215 nt12.91□□□□□ -0.34
MSB4Q12317 GDH3YAL062W 1374 nt12.91□□□□□ -0.34
MSB4Q12317 SKG1YKR100C 1068 nt12.88□□□□□ -0.35
MSB4Q12317 BNA2YJR078W 1362 nt12.88□□□□□ -0.35
MSB4Q12317 COQ2YNR041C 1119 nt12.87□□□□□ -0.35
MSB4Q12317 NCP1YHR042W 2076 nt12.86□□□□□ -0.35
MSB4Q12317 NEM1YHR004C 1341 nt12.84□□□□□ -0.35
MSB4Q12317 YNR029CYNR029C 1290 nt12.81□□□□□ -0.36
MSB4Q12317 MIC12YBR262C 321 nt12.8□□□□□ -0.36
MSB4Q12317 STE4YOR212W 1272 nt12.78□□□□□ -0.36
MSB4Q12317 YPL168WYPL168W 1293 nt12.78□□□□□ -0.36
MSB4Q12317 SDH5YOL071W 489 nt12.76□□□□□ -0.37
MSB4Q12317 PHO92YDR374C 921 nt12.74□□□□□ -0.37
MSB4Q12317 RPL4BYDR012W 1089 nt12.73□□□□□ -0.37
MSB4Q12317 YGR201CYGR201C 678 nt12.73□□□□□ -0.37
MSB4Q12317 YLR349WYLR349W 507 nt12.73□□□□□ -0.37
MSB4Q12317 RPL4AYBR031W 1089 nt12.73□□□□□ -0.37
MSB4Q12317 SFA1YDL168W 1161 nt12.72□□□□□ -0.37
MSB4Q12317 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.72□□□□□ -0.37
MSB4Q12317 HHO1YPL127C 777 nt12.72□□□□□ -0.37
MSB4Q12317 RAD23YEL037C 1197 nt12.7□□□□□ -0.38
MSB4Q12317 AVT6YER119C 1347 nt12.69□□□□□ -0.38
MSB4Q12317 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt12.68□□□□□ -0.38
MSB4Q12317 CLB6YGR109C 1143 nt12.67□□□□□ -0.38
MSB4Q12317 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt12.67□□□□□ -0.38
MSB4Q12317 RAX1YOR301W 1308 nt12.66□□□□□ -0.38
MSB4Q12317 ADH7YCR105W 1086 nt12.66□□□□□ -0.38
MSB4Q12317 PAU15YIR041W 375 nt12.65□□□□□ -0.38
MSB4Q12317 RPS14BYJL191W 417 nt12.64□□□□□ -0.39
MSB4Q12317 YCR102CYCR102C 1107 nt12.63□□□□□ -0.39
MSB4Q12317 TOM20YGR082W 552 nt12.63□□□□□ -0.39
MSB4Q12317 FUN14YAL008W 597 nt12.63□□□□□ -0.39
MSB4Q12317 AST1YBL069W 1290 nt12.62□□□□□ -0.39
MSB4Q12317 URE2YNL229C 1065 nt12.62□□□□□ -0.39
MSB4Q12317 GOR1YNL274C 1053 nt12.62□□□□□ -0.39
MSB4Q12317 YFL054CYFL054C 1941 nt12.59□□□□□ -0.39
MSB4Q12317 YHL044WYHL044W 708 nt12.59□□□□□ -0.39
MSB4Q12317 STD1YOR047C 1335 nt12.59□□□□□ -0.39
MSB4Q12317 YLR279WYLR279W 390 nt12.58□□□□□ -0.4
MSB4Q12317 CAB5YDR196C 726 nt12.57□□□□□ -0.4
MSB4Q12317 YJL195CYJL195C 702 nt12.57□□□□□ -0.4
MSB4Q12317 RIB3YDR487C 627 nt12.55□□□□□ -0.4
MSB4Q12317 UTH1YKR042W 1098 nt12.55□□□□□ -0.4
MSB4Q12317 MET8YBR213W 825 nt12.55□□□□□ -0.4
MSB4Q12317 TSC10YBR265W 963 nt12.54□□□□□ -0.4
MSB4Q12317 YGR012WYGR012W 1182 nt12.53□□□□□ -0.4
MSB4Q12317 YPL071CYPL071C 471 nt12.52□□□□□ -0.41
MSB4Q12317 HMT1YBR034C 1047 nt12.48□□□□□ -0.41
MSB4Q12317 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt12.46□□□□□ -0.41
MSB4Q12317 SHH4YLR164W 507 nt12.46□□□□□ -0.41
MSB4Q12317 TOM6YOR045W 186 nt12.46□□□□□ -0.41
MSB4Q12317 DUT1YBR252W 444 nt12.46□□□□□ -0.41
MSB4Q12317 PEX27YOR193W 1131 nt12.45□□□□□ -0.42
MSB4Q12317 GPN2YOR262W 1044 nt12.45□□□□□ -0.42
MSB4Q12317 LCP5YER127W 1074 nt12.43□□□□□ -0.42
MSB4Q12317 TIR3YIL011W 810 nt12.43□□□□□ -0.42
MSB4Q12317 PEX2YJL210W 816 nt12.43□□□□□ -0.42
MSB4Q12317 ADH1YOL086C 1047 nt12.43□□□□□ -0.42
MSB4Q12317 NRT1YOR071C 1797 nt12.42□□□□□ -0.42
MSB4Q12317 HIP1YGR191W 1812 nt12.41□□□□□ -0.42
MSB4Q12317 ESS1YJR017C 513 nt12.39□□□□□ -0.43
MSB4Q12317 NBP35YGL091C 987 nt12.38□□□□□ -0.43
MSB4Q12317 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt12.38□□□□□ -0.43
MSB4Q12317 YEL008WYEL008W 381 nt12.36□□□□□ -0.43
MSB4Q12317 CPD1YGR247W 720 nt12.36□□□□□ -0.43
MSB4Q12317 AGP1YCL025C 1902 nt12.35□□□□□ -0.43
MSB4Q12317 YPI1YFR003C 468 nt12.34□□□□□ -0.43
MSB4Q12317 POM34YLR018C 900 nt12.34□□□□□ -0.43
MSB4Q12317 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt12.34□□□□□ -0.43
MSB4Q12317 GTT3YEL017W 1014 nt12.33□□□□□ -0.44
MSB4Q12317 FAR3YMR052W 615 nt12.33□□□□□ -0.44
MSB4Q12317 BOR1YNL275W 1731 nt12.33□□□□□ -0.44
MSB4Q12317 URH1YDR400W 1023 nt12.32□□□□□ -0.44
MSB4Q12317 SWE1YJL187C 2460 nt12.32□□□□□ -0.44
MSB4Q12317 LSM12YHR121W 564 nt12.31□□□□□ -0.44
MSB4Q12317 MET28YIR017C 564 nt12.31□□□□□ -0.44
MSB4Q12317 YML089CYML089C 369 nt12.31□□□□□ -0.44
MSB4Q12317 MSB4YOL112W 1479 nt12.28□□□□□ -0.44
MSB4Q12317 PRO1YDR300C 1287 nt12.25□□□□□ -0.45
MSB4Q12317 TIF6YPR016C 738 nt12.25□□□□□ -0.45
MSB4Q12317 CCA1YER168C 1641 nt12.24□□□□□ -0.45
MSB4Q12317 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt12.23□□□□□ -0.45
MSB4Q12317 LSC2YGR244C 1284 nt12.22□□□□□ -0.45
MSB4Q12317 LOT5YKL183W 921 nt12.22□□□□□ -0.45
MSB4Q12317 NAP1YKR048C 1254 nt12.22□□□□□ -0.45
MSB4Q12317 YLR036CYLR036C 612 nt12.21□□□□□ -0.45
MSB4Q12317 SEN2YLR105C 1134 nt12.21□□□□□ -0.45
MSB4Q12317 AAC1YMR056C 930 nt12.21□□□□□ -0.45
MSB4Q12317 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt12.2□□□□□ -0.46
MSB4Q12317 FIT3YOR383C 615 nt12.2□□□□□ -0.46
MSB4Q12317 GND1YHR183W 1470 nt12.2□□□□□ -0.46
MSB4Q12317 ATG15YCR068W 1563 nt12.19□□□□□ -0.46
MSB4Q12317 PUP1YOR157C 786 nt12.19□□□□□ -0.46
MSB4Q12317 YEL074WYEL074W 339 nt12.17□□□□□ -0.46
MSB4Q12317 HSP60YLR259C 1719 nt12.15□□□□□ -0.46
MSB4Q12317 ARC19YKL013C 516 nt12.15□□□□□ -0.46
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