Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.42□□□□□ -0.58
LSP1Q12230 HSL7YBR133C 2484 nt11.41□□□□□ -0.58
LSP1Q12230 PRE6YOL038W 765 nt11.41□□□□□ -0.58
LSP1Q12230 YFR018CYFR018C 1092 nt11.4□□□□□ -0.58
LSP1Q12230 Q0182Q0182 405 nt11.4□□□□□ -0.58
LSP1Q12230 SHB17YKR043C 816 nt11.4□□□□□ -0.58
LSP1Q12230 TOM6YOR045W 186 nt11.4□□□□□ -0.58
LSP1Q12230 YDR010CYDR010C 333 nt11.39□□□□□ -0.59
LSP1Q12230 SFA1YDL168W 1161 nt11.38□□□□□ -0.59
LSP1Q12230 YJL067WYJL067W 351 nt11.37□□□□□ -0.59
LSP1Q12230 HXT1YHR094C 1713 nt11.36□□□□□ -0.59
LSP1Q12230 DIF1YLR437C 402 nt11.36□□□□□ -0.59
LSP1Q12230 YML089CYML089C 369 nt11.36□□□□□ -0.59
LSP1Q12230 PEX2YJL210W 816 nt11.3□□□□□ -0.6
LSP1Q12230 DBP1YPL119C 1854 nt11.29□□□□□ -0.6
LSP1Q12230 MUP1YGR055W 1725 nt11.27□□□□□ -0.61
LSP1Q12230 PHO89YBR296C 1725 nt11.27□□□□□ -0.61
LSP1Q12230 SHY1YGR112W 1170 nt11.27□□□□□ -0.61
LSP1Q12230 RPM1RPM1 483 nt11.27□□□□□ -0.61
LSP1Q12230 RET2YFR051C 1641 nt11.27□□□□□ -0.61
LSP1Q12230 RIM8YGL045W 1629 nt11.26□□□□□ -0.61
LSP1Q12230 YER190C-AYER190C-A 576 nt11.23□□□□□ -0.61
LSP1Q12230 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt11.23□□□□□ -0.61
LSP1Q12230 MIR1YJR077C 936 nt11.23□□□□□ -0.61
LSP1Q12230 YML133W-AYML133W-A 576 nt11.23□□□□□ -0.61
LSP1Q12230 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt11.23□□□□□ -0.61
LSP1Q12230 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt11.23□□□□□ -0.61
LSP1Q12230 TIF6YPR016C 738 nt11.23□□□□□ -0.61
LSP1Q12230 UBA4YHR111W 1323 nt11.22□□□□□ -0.61
LSP1Q12230 LIP1YMR298W 453 nt11.22□□□□□ -0.61
LSP1Q12230 RRT5YFR032C 870 nt11.21□□□□□ -0.61
LSP1Q12230 YNL024CYNL024C 741 nt11.21□□□□□ -0.61
LSP1Q12230 YBL086CYBL086C 1401 nt11.2□□□□□ -0.62
LSP1Q12230 RDN25-1RDN25-1 3396 nt11.19□□□□□ -0.62
LSP1Q12230 RDN25-2RDN25-2 3396 nt11.19□□□□□ -0.62
LSP1Q12230 YOR325WYOR325W 474 nt11.18□□□□□ -0.62
LSP1Q12230 HIP1YGR191W 1812 nt11.17□□□□□ -0.62
LSP1Q12230 SED1YDR077W 1017 nt11.17□□□□□ -0.62
LSP1Q12230 YAR028WYAR028W 705 nt11.17□□□□□ -0.62
LSP1Q12230 HOL1YNR055C 1761 nt11.17□□□□□ -0.62
LSP1Q12230 YSR3YKR053C 1215 nt11.16□□□□□ -0.62
LSP1Q12230 COQ2YNR041C 1119 nt11.16□□□□□ -0.62
LSP1Q12230 CWC15YDR163W 528 nt11.14□□□□□ -0.63
LSP1Q12230 MRP20YDR405W 792 nt11.13□□□□□ -0.63
LSP1Q12230 SAM1YLR180W 1149 nt11.13□□□□□ -0.63
LSP1Q12230 HEL2YDR266C 1920 nt11.13□□□□□ -0.63
LSP1Q12230 THI74YDR438W 1113 nt11.12□□□□□ -0.63
LSP1Q12230 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt11.12□□□□□ -0.63
LSP1Q12230 MET28YIR017C 564 nt11.11□□□□□ -0.63
LSP1Q12230 TOA2YKL058W 369 nt11.11□□□□□ -0.63
LSP1Q12230 MTG2YHR168W 1557 nt11.11□□□□□ -0.63
LSP1Q12230 ILV3YJR016C 1758 nt11.11□□□□□ -0.63
LSP1Q12230 PAU16YKL224C 372 nt11.1□□□□□ -0.63
LSP1Q12230 AKR2YOR034C 2250 nt11.1□□□□□ -0.63
LSP1Q12230 YDR094WYDR094W 336 nt11.08□□□□□ -0.64
LSP1Q12230 URA6YKL024C 615 nt11.08□□□□□ -0.64
LSP1Q12230 YGL114WYGL114W 2178 nt11.08□□□□□ -0.64
LSP1Q12230 NRT1YOR071C 1797 nt11.08□□□□□ -0.64
LSP1Q12230 XYL2YLR070C 1071 nt11.07□□□□□ -0.64
LSP1Q12230 ZTA1YBR046C 1005 nt11.07□□□□□ -0.64
LSP1Q12230 BRR1YPR057W 1026 nt11.07□□□□□ -0.64
LSP1Q12230 GND2YGR256W 1479 nt11.05□□□□□ -0.64
LSP1Q12230 UFO1YML088W 2007 nt11.04□□□□□ -0.64
LSP1Q12230 YPL251WYPL251W 303 nt11.04□□□□□ -0.64
LSP1Q12230 YCR087WYCR087W 516 nt11.03□□□□□ -0.64
LSP1Q12230 OYE3YPL171C 1203 nt11.03□□□□□ -0.64
LSP1Q12230 LEU9YOR108W 1815 nt11.02□□□□□ -0.64
LSP1Q12230 UTH1YKR042W 1098 nt11.02□□□□□ -0.65
LSP1Q12230 BET2YPR176C 978 nt11.01□□□□□ -0.65
LSP1Q12230 CCT2YIL142W 1584 nt11□□□□□ -0.65
LSP1Q12230 CLB6YGR109C 1143 nt11□□□□□ -0.65
LSP1Q12230 PET8YNL003C 855 nt11□□□□□ -0.65
LSP1Q12230 ALP1YNL270C 1722 nt11□□□□□ -0.65
LSP1Q12230 RPL4BYDR012W 1089 nt10.99□□□□□ -0.65
LSP1Q12230 RPL4AYBR031W 1089 nt10.99□□□□□ -0.65
LSP1Q12230 COQ8YGL119W 1506 nt10.99□□□□□ -0.65
LSP1Q12230 OPI10YOL032W 741 nt10.98□□□□□ -0.65
LSP1Q12230 NAT4YMR069W 858 nt10.97□□□□□ -0.65
LSP1Q12230 YMR103CYMR103C 363 nt10.97□□□□□ -0.65
LSP1Q12230 ARO8YGL202W 1503 nt10.96□□□□□ -0.65
LSP1Q12230 MEP3YPR138C 1470 nt10.96□□□□□ -0.65
LSP1Q12230 MSF1YPR047W 1410 nt10.96□□□□□ -0.65
LSP1Q12230 HIS2YFR025C 1008 nt10.95□□□□□ -0.66
LSP1Q12230 YGL034CYGL034C 366 nt10.95□□□□□ -0.66
LSP1Q12230 TRT2tT(CGU)K 72 nt10.95□□□□□ -0.66
LSP1Q12230 SBA1YKL117W 651 nt10.95□□□□□ -0.66
LSP1Q12230 SPP2YOR148C 558 nt10.95□□□□□ -0.66
LSP1Q12230 YMR209CYMR209C 1374 nt10.94□□□□□ -0.66
LSP1Q12230 SAM2YDR502C 1155 nt10.94□□□□□ -0.66
LSP1Q12230 FIT3YOR383C 615 nt10.94□□□□□ -0.66
LSP1Q12230 AIM45YPR004C 1035 nt10.94□□□□□ -0.66
LSP1Q12230 KES1YPL145C 1305 nt10.91□□□□□ -0.66
LSP1Q12230 RPS14BYJL191W 417 nt10.91□□□□□ -0.66
LSP1Q12230 UGP1YKL035W 1500 nt10.9□□□□□ -0.66
LSP1Q12230 FMS1YMR020W 1527 nt10.9□□□□□ -0.66
LSP1Q12230 RSC8YFR037C 1674 nt10.89□□□□□ -0.67
LSP1Q12230 FLR1YBR008C 1647 nt10.86□□□□□ -0.67
LSP1Q12230 LSB6YJL100W 1824 nt10.86□□□□□ -0.67
LSP1Q12230 RBG1YAL036C 1110 nt10.85□□□□□ -0.67
LSP1Q12230 ACH1YBL015W 1581 nt10.85□□□□□ -0.67
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