Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 PRO1YDR300C 1287 nt9.89□□□□□ -0.83
UBX3Q12229 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.89□□□□□ -0.83
UBX3Q12229 GAP1YKR039W 1809 nt9.85□□□□□ -0.83
UBX3Q12229 YGL034CYGL034C 366 nt9.85□□□□□ -0.83
UBX3Q12229 XYL2YLR070C 1071 nt9.85□□□□□ -0.83
UBX3Q12229 COQ2YNR041C 1119 nt9.85□□□□□ -0.83
UBX3Q12229 TOM6YOR045W 186 nt9.84□□□□□ -0.83
UBX3Q12229 YML089CYML089C 369 nt9.82□□□□□ -0.84
UBX3Q12229 UTR1YJR049C 1593 nt9.82□□□□□ -0.84
UBX3Q12229 UME6YDR207C 2511 nt9.82□□□□□ -0.84
UBX3Q12229 ATG15YCR068W 1563 nt9.8□□□□□ -0.84
UBX3Q12229 YCR087WYCR087W 516 nt9.79□□□□□ -0.84
UBX3Q12229 PRM5YIL117C 957 nt9.79□□□□□ -0.84
UBX3Q12229 PBP1YGR178C 2169 nt9.79□□□□□ -0.84
UBX3Q12229 MRP20YDR405W 792 nt9.77□□□□□ -0.85
UBX3Q12229 HIP1YGR191W 1812 nt9.77□□□□□ -0.85
UBX3Q12229 PEX2YJL210W 816 nt9.76□□□□□ -0.85
UBX3Q12229 AIM45YPR004C 1035 nt9.76□□□□□ -0.85
UBX3Q12229 TIF6YPR016C 738 nt9.76□□□□□ -0.85
UBX3Q12229 MCH5YOR306C 1566 nt9.74□□□□□ -0.85
UBX3Q12229 NAR1YNL240C 1476 nt9.73□□□□□ -0.85
UBX3Q12229 DIF1YLR437C 402 nt9.72□□□□□ -0.85
UBX3Q12229 FRE6YLL051C 2139 nt9.71□□□□□ -0.86
UBX3Q12229 HIF1YLL022C 1158 nt9.7□□□□□ -0.86
UBX3Q12229 RBG1YAL036C 1110 nt9.69□□□□□ -0.86
UBX3Q12229 ALD4YOR374W 1560 nt9.68□□□□□ -0.86
UBX3Q12229 RPL4BYDR012W 1089 nt9.68□□□□□ -0.86
UBX3Q12229 CYT2YKL087C 675 nt9.68□□□□□ -0.86
UBX3Q12229 RPL4AYBR031W 1089 nt9.68□□□□□ -0.86
UBX3Q12229 MET28YIR017C 564 nt9.66□□□□□ -0.86
UBX3Q12229 RPS14BYJL191W 417 nt9.66□□□□□ -0.86
UBX3Q12229 UTH1YKR042W 1098 nt9.66□□□□□ -0.86
UBX3Q12229 CLB6YGR109C 1143 nt9.64□□□□□ -0.87
UBX3Q12229 NRT1YOR071C 1797 nt9.64□□□□□ -0.87
UBX3Q12229 NDI1YML120C 1542 nt9.63□□□□□ -0.87
UBX3Q12229 SAM35YHR083W 990 nt9.63□□□□□ -0.87
UBX3Q12229 SBA1YKL117W 651 nt9.6□□□□□ -0.87
UBX3Q12229 YAR028WYAR028W 705 nt9.59□□□□□ -0.87
UBX3Q12229 DBP1YPL119C 1854 nt9.59□□□□□ -0.87
UBX3Q12229 MTG2YHR168W 1557 nt9.58□□□□□ -0.88
UBX3Q12229 ZTA1YBR046C 1005 nt9.55□□□□□ -0.88
UBX3Q12229 FIT3YOR383C 615 nt9.54□□□□□ -0.88
UBX3Q12229 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.52□□□□□ -0.89
UBX3Q12229 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.52□□□□□ -0.89
UBX3Q12229 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.52□□□□□ -0.89
UBX3Q12229 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.52□□□□□ -0.89
UBX3Q12229 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.52□□□□□ -0.89
UBX3Q12229 YAT1YAR035W 2064 nt9.51□□□□□ -0.89
UBX3Q12229 HXT1YHR094C 1713 nt9.51□□□□□ -0.89
UBX3Q12229 ALP1YNL270C 1722 nt9.51□□□□□ -0.89
UBX3Q12229 TSC10YBR265W 963 nt9.5□□□□□ -0.89
UBX3Q12229 AKR2YOR034C 2250 nt9.49□□□□□ -0.89
UBX3Q12229 GLR1YPL091W 1452 nt9.49□□□□□ -0.89
UBX3Q12229 SED1YDR077W 1017 nt9.49□□□□□ -0.89
UBX3Q12229 YLR279WYLR279W 390 nt9.49□□□□□ -0.89
UBX3Q12229 YBL086CYBL086C 1401 nt9.48□□□□□ -0.89
UBX3Q12229 LIP1YMR298W 453 nt9.48□□□□□ -0.89
UBX3Q12229 YMR244WYMR244W 1068 nt9.47□□□□□ -0.89
UBX3Q12229 ZRT3YKL175W 1512 nt9.46□□□□□ -0.89
UBX3Q12229 YGR012WYGR012W 1182 nt9.45□□□□□ -0.9
UBX3Q12229 SHY1YGR112W 1170 nt9.45□□□□□ -0.9
UBX3Q12229 SDH5YOL071W 489 nt9.45□□□□□ -0.9
UBX3Q12229 MSB4YOL112W 1479 nt9.44□□□□□ -0.9
UBX3Q12229 LEU9YOR108W 1815 nt9.42□□□□□ -0.9
UBX3Q12229 YPL251WYPL251W 303 nt9.42□□□□□ -0.9
UBX3Q12229 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.42□□□□□ -0.9
UBX3Q12229 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.42□□□□□ -0.9
UBX3Q12229 CAB5YDR196C 726 nt9.41□□□□□ -0.9
UBX3Q12229 RAD23YEL037C 1197 nt9.39□□□□□ -0.91
UBX3Q12229 YJL067WYJL067W 351 nt9.39□□□□□ -0.91
UBX3Q12229 UFO1YML088W 2007 nt9.38□□□□□ -0.91
UBX3Q12229 BRR1YPR057W 1026 nt9.37□□□□□ -0.91
UBX3Q12229 SAM1YLR180W 1149 nt9.36□□□□□ -0.91
UBX3Q12229 RPC82YPR190C 1965 nt9.35□□□□□ -0.91
UBX3Q12229 URA6YKL024C 615 nt9.34□□□□□ -0.91
UBX3Q12229 UGA4YDL210W 1716 nt9.34□□□□□ -0.92
UBX3Q12229 TOA2YKL058W 369 nt9.33□□□□□ -0.92
UBX3Q12229 YLR111WYLR111W 333 nt9.33□□□□□ -0.92
UBX3Q12229 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt9.33□□□□□ -0.92
UBX3Q12229 YMR226CYMR226C 804 nt9.33□□□□□ -0.92
UBX3Q12229 RIB3YDR487C 627 nt9.32□□□□□ -0.92
UBX3Q12229 INA1YLR413W 2028 nt9.32□□□□□ -0.92
UBX3Q12229 FCY21YER060W 1587 nt9.32□□□□□ -0.92
UBX3Q12229 YMR103CYMR103C 363 nt9.3□□□□□ -0.92
UBX3Q12229 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.3□□□□□ -0.92
UBX3Q12229 GND2YGR256W 1479 nt9.29□□□□□ -0.92
UBX3Q12229 MEP3YPR138C 1470 nt9.29□□□□□ -0.92
UBX3Q12229 RBG2YGR173W 1107 nt9.29□□□□□ -0.92
UBX3Q12229 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.28□□□□□ -0.92
UBX3Q12229 OYE3YPL171C 1203 nt9.27□□□□□ -0.93
UBX3Q12229 CMP2YML057W 1815 nt9.26□□□□□ -0.93
UBX3Q12229 SPT20YOL148C 1815 nt9.26□□□□□ -0.93
UBX3Q12229 APT2YDR441C 546 nt9.24□□□□□ -0.93
UBX3Q12229 GND1YHR183W 1470 nt9.22□□□□□ -0.93
UBX3Q12229 PET8YNL003C 855 nt9.22□□□□□ -0.93
UBX3Q12229 SMM1YNR015W 1155 nt9.21□□□□□ -0.94
UBX3Q12229 SSN3YPL042C 1668 nt9.19□□□□□ -0.94
UBX3Q12229 PRY1YJL079C 900 nt9.18□□□□□ -0.94
UBX3Q12229 LOT5YKL183W 921 nt9.18□□□□□ -0.94
UBX3Q12229 FLR1YBR008C 1647 nt9.17□□□□□ -0.94
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