Protein–RNA interactions for Protein: Q12192

RFM1, Repression factor of MSEs protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RFM1Q12192 POM34YLR018C 900 nt8.36□□□□□ -1.07
RFM1Q12192 YCR087WYCR087W 516 nt8.35□□□□□ -1.07
RFM1Q12192 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt8.35□□□□□ -1.07
RFM1Q12192 NAR1YNL240C 1476 nt8.34□□□□□ -1.07
RFM1Q12192 YML089CYML089C 369 nt8.34□□□□□ -1.07
RFM1Q12192 YGL034CYGL034C 366 nt8.33□□□□□ -1.08
RFM1Q12192 PRO1YDR300C 1287 nt8.32□□□□□ -1.08
RFM1Q12192 GAP1YKR039W 1809 nt8.31□□□□□ -1.08
RFM1Q12192 XYL2YLR070C 1071 nt8.3□□□□□ -1.08
RFM1Q12192 COQ2YNR041C 1119 nt8.3□□□□□ -1.08
RFM1Q12192 FRE6YLL051C 2139 nt8.3□□□□□ -1.08
RFM1Q12192 MRP20YDR405W 792 nt8.29□□□□□ -1.08
RFM1Q12192 BIO5YNR056C 1686 nt8.28□□□□□ -1.08
RFM1Q12192 TOM6YOR045W 186 nt8.28□□□□□ -1.08
RFM1Q12192 AIM45YPR004C 1035 nt8.28□□□□□ -1.08
RFM1Q12192 ATG15YCR068W 1563 nt8.27□□□□□ -1.09
RFM1Q12192 HIP1YGR191W 1812 nt8.24□□□□□ -1.09
RFM1Q12192 UTR1YJR049C 1593 nt8.24□□□□□ -1.09
RFM1Q12192 RPL4BYDR012W 1089 nt8.23□□□□□ -1.09
RFM1Q12192 RPL4AYBR031W 1089 nt8.23□□□□□ -1.09
RFM1Q12192 TIF6YPR016C 738 nt8.23□□□□□ -1.09
RFM1Q12192 PEX2YJL210W 816 nt8.21□□□□□ -1.1
RFM1Q12192 CLB6YGR109C 1143 nt8.2□□□□□ -1.1
RFM1Q12192 PRM5YIL117C 957 nt8.2□□□□□ -1.1
RFM1Q12192 MET28YIR017C 564 nt8.19□□□□□ -1.1
RFM1Q12192 UTH1YKR042W 1098 nt8.19□□□□□ -1.1
RFM1Q12192 DIF1YLR437C 402 nt8.19□□□□□ -1.1
RFM1Q12192 SAM35YHR083W 990 nt8.18□□□□□ -1.1
RFM1Q12192 RPS14BYJL191W 417 nt8.18□□□□□ -1.1
RFM1Q12192 RBG1YAL036C 1110 nt8.18□□□□□ -1.1
RFM1Q12192 PBP1YGR178C 2169 nt8.18□□□□□ -1.1
RFM1Q12192 ALD4YOR374W 1560 nt8.17□□□□□ -1.1
RFM1Q12192 CMP2YML057W 1815 nt8.15□□□□□ -1.1
RFM1Q12192 NRT1YOR071C 1797 nt8.15□□□□□ -1.1
RFM1Q12192 NDI1YML120C 1542 nt8.15□□□□□ -1.1
RFM1Q12192 HIF1YLL022C 1158 nt8.14□□□□□ -1.11
RFM1Q12192 CYT2YKL087C 675 nt8.13□□□□□ -1.11
RFM1Q12192 YAR028WYAR028W 705 nt8.12□□□□□ -1.11
RFM1Q12192 FIT3YOR383C 615 nt8.12□□□□□ -1.11
RFM1Q12192 SBA1YKL117W 651 nt8.11□□□□□ -1.11
RFM1Q12192 GLR1YPL091W 1452 nt8.07□□□□□ -1.12
RFM1Q12192 TSC10YBR265W 963 nt8.07□□□□□ -1.12
RFM1Q12192 DBP1YPL119C 1854 nt8.06□□□□□ -1.12
RFM1Q12192 MTG2YHR168W 1557 nt8.05□□□□□ -1.12
RFM1Q12192 ALP1YNL270C 1722 nt8.05□□□□□ -1.12
RFM1Q12192 SED1YDR077W 1017 nt8.03□□□□□ -1.12
RFM1Q12192 YMR244WYMR244W 1068 nt8.02□□□□□ -1.13
RFM1Q12192 HXT1YHR094C 1713 nt8.01□□□□□ -1.13
RFM1Q12192 YLR279WYLR279W 390 nt8.01□□□□□ -1.13
RFM1Q12192 AKR2YOR034C 2250 nt8.01□□□□□ -1.13
RFM1Q12192 YGR012WYGR012W 1182 nt8□□□□□ -1.13
RFM1Q12192 LIP1YMR298W 453 nt8□□□□□ -1.13
RFM1Q12192 ZTA1YBR046C 1005 nt8□□□□□ -1.13
RFM1Q12192 ZRT3YKL175W 1512 nt7.99□□□□□ -1.13
RFM1Q12192 RAD23YEL037C 1197 nt7.99□□□□□ -1.13
RFM1Q12192 SDH5YOL071W 489 nt7.99□□□□□ -1.13
RFM1Q12192 YER190C-AYER190C-A 576 nt7.98□□□□□ -1.13
RFM1Q12192 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt7.98□□□□□ -1.13
RFM1Q12192 YML133W-AYML133W-A 576 nt7.98□□□□□ -1.13
RFM1Q12192 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt7.98□□□□□ -1.13
RFM1Q12192 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt7.98□□□□□ -1.13
RFM1Q12192 YBL086CYBL086C 1401 nt7.97□□□□□ -1.13
RFM1Q12192 YMR226CYMR226C 804 nt7.97□□□□□ -1.13
RFM1Q12192 MSB4YOL112W 1479 nt7.95□□□□□ -1.14
RFM1Q12192 HSL7YBR133C 2484 nt7.94□□□□□ -1.14
RFM1Q12192 LEU9YOR108W 1815 nt7.94□□□□□ -1.14
RFM1Q12192 YLR111WYLR111W 333 nt7.94□□□□□ -1.14
RFM1Q12192 SHY1YGR112W 1170 nt7.93□□□□□ -1.14
RFM1Q12192 YPL251WYPL251W 303 nt7.91□□□□□ -1.14
RFM1Q12192 YAT1YAR035W 2064 nt7.9□□□□□ -1.14
RFM1Q12192 RIB3YDR487C 627 nt7.9□□□□□ -1.14
RFM1Q12192 SAM1YLR180W 1149 nt7.9□□□□□ -1.14
RFM1Q12192 RDN25-1RDN25-1 3396 nt7.89□□□□□ -1.15
RFM1Q12192 RDN25-2RDN25-2 3396 nt7.89□□□□□ -1.15
RFM1Q12192 RBG2YGR173W 1107 nt7.89□□□□□ -1.15
RFM1Q12192 BRR1YPR057W 1026 nt7.89□□□□□ -1.15
RFM1Q12192 UFO1YML088W 2007 nt7.88□□□□□ -1.15
RFM1Q12192 APT2YDR441C 546 nt7.88□□□□□ -1.15
RFM1Q12192 URA6YKL024C 615 nt7.88□□□□□ -1.15
RFM1Q12192 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt7.88□□□□□ -1.15
RFM1Q12192 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt7.88□□□□□ -1.15
RFM1Q12192 BSP1YPR171W 1731 nt7.88□□□□□ -1.15
RFM1Q12192 FCY21YER060W 1587 nt7.88□□□□□ -1.15
RFM1Q12192 CAB5YDR196C 726 nt7.87□□□□□ -1.15
RFM1Q12192 YJL067WYJL067W 351 nt7.87□□□□□ -1.15
RFM1Q12192 HEL2YDR266C 1920 nt7.86□□□□□ -1.15
RFM1Q12192 TOA2YKL058W 369 nt7.85□□□□□ -1.15
RFM1Q12192 SSN3YPL042C 1668 nt7.85□□□□□ -1.15
RFM1Q12192 INA1YLR413W 2028 nt7.84□□□□□ -1.15
RFM1Q12192 UGA4YDL210W 1716 nt7.83□□□□□ -1.16
RFM1Q12192 TRT2tT(CGU)K 72 nt7.83□□□□□ -1.16
RFM1Q12192 MEP3YPR138C 1470 nt7.82□□□□□ -1.16
RFM1Q12192 YMR103CYMR103C 363 nt7.81□□□□□ -1.16
RFM1Q12192 GND1YHR183W 1470 nt7.81□□□□□ -1.16
RFM1Q12192 RPC82YPR190C 1965 nt7.8□□□□□ -1.16
RFM1Q12192 OYE3YPL171C 1203 nt7.8□□□□□ -1.16
RFM1Q12192 GND2YGR256W 1479 nt7.8□□□□□ -1.16
RFM1Q12192 PET8YNL003C 855 nt7.79□□□□□ -1.16
RFM1Q12192 SPT20YOL148C 1815 nt7.78□□□□□ -1.16
RFM1Q12192 OXA1YER154W 1209 nt7.77□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.9 ms