Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 IRC24YIR036C 792 nt9.6□□□□□ -0.87
NMD4Q12129 SFA1YDL168W 1161 nt9.59□□□□□ -0.87
NMD4Q12129 SHH4YLR164W 507 nt9.59□□□□□ -0.87
NMD4Q12129 PLB1YMR008C 1995 nt9.58□□□□□ -0.88
NMD4Q12129 XYL2YLR070C 1071 nt9.58□□□□□ -0.88
NMD4Q12129 MRP20YDR405W 792 nt9.57□□□□□ -0.88
NMD4Q12129 POM34YLR018C 900 nt9.56□□□□□ -0.88
NMD4Q12129 PRO1YDR300C 1287 nt9.55□□□□□ -0.88
NMD4Q12129 YML089CYML089C 369 nt9.54□□□□□ -0.88
NMD4Q12129 SNF1YDR477W 1902 nt9.53□□□□□ -0.88
NMD4Q12129 COQ2YNR041C 1119 nt9.53□□□□□ -0.88
NMD4Q12129 TOM6YOR045W 186 nt9.53□□□□□ -0.88
NMD4Q12129 GAP1YKR039W 1809 nt9.53□□□□□ -0.88
NMD4Q12129 ATG15YCR068W 1563 nt9.53□□□□□ -0.88
NMD4Q12129 PBP1YGR178C 2169 nt9.51□□□□□ -0.89
NMD4Q12129 AIM45YPR004C 1035 nt9.5□□□□□ -0.89
NMD4Q12129 BIO5YNR056C 1686 nt9.5□□□□□ -0.89
NMD4Q12129 RBG1YAL036C 1110 nt9.48□□□□□ -0.89
NMD4Q12129 PEX2YJL210W 816 nt9.47□□□□□ -0.89
NMD4Q12129 CLB6YGR109C 1143 nt9.46□□□□□ -0.9
NMD4Q12129 CYT2YKL087C 675 nt9.45□□□□□ -0.9
NMD4Q12129 RPL4BYDR012W 1089 nt9.44□□□□□ -0.9
NMD4Q12129 RPL4AYBR031W 1089 nt9.44□□□□□ -0.9
NMD4Q12129 NDI1YML120C 1542 nt9.44□□□□□ -0.9
NMD4Q12129 UTR1YJR049C 1593 nt9.44□□□□□ -0.9
NMD4Q12129 HIP1YGR191W 1812 nt9.43□□□□□ -0.9
NMD4Q12129 SAM35YHR083W 990 nt9.41□□□□□ -0.9
NMD4Q12129 UTH1YKR042W 1098 nt9.41□□□□□ -0.9
NMD4Q12129 TIF6YPR016C 738 nt9.41□□□□□ -0.9
NMD4Q12129 PRM5YIL117C 957 nt9.4□□□□□ -0.9
NMD4Q12129 MET28YIR017C 564 nt9.39□□□□□ -0.91
NMD4Q12129 NRT1YOR071C 1797 nt9.39□□□□□ -0.91
NMD4Q12129 HSL7YBR133C 2484 nt9.37□□□□□ -0.91
NMD4Q12129 RPS14BYJL191W 417 nt9.36□□□□□ -0.91
NMD4Q12129 DIF1YLR437C 402 nt9.35□□□□□ -0.91
NMD4Q12129 ALD4YOR374W 1560 nt9.35□□□□□ -0.91
NMD4Q12129 CMP2YML057W 1815 nt9.35□□□□□ -0.91
NMD4Q12129 SBA1YKL117W 651 nt9.34□□□□□ -0.91
NMD4Q12129 GLR1YPL091W 1452 nt9.33□□□□□ -0.92
NMD4Q12129 HIF1YLL022C 1158 nt9.3□□□□□ -0.92
NMD4Q12129 SDH5YOL071W 489 nt9.3□□□□□ -0.92
NMD4Q12129 FIT3YOR383C 615 nt9.3□□□□□ -0.92
NMD4Q12129 YAR028WYAR028W 705 nt9.29□□□□□ -0.92
NMD4Q12129 TSC10YBR265W 963 nt9.27□□□□□ -0.93
NMD4Q12129 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.26□□□□□ -0.93
NMD4Q12129 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.26□□□□□ -0.93
NMD4Q12129 ALP1YNL270C 1722 nt9.23□□□□□ -0.93
NMD4Q12129 MTG2YHR168W 1557 nt9.22□□□□□ -0.93
NMD4Q12129 YMR244WYMR244W 1068 nt9.22□□□□□ -0.93
NMD4Q12129 AKR2YOR034C 2250 nt9.21□□□□□ -0.94
NMD4Q12129 HXT1YHR094C 1713 nt9.2□□□□□ -0.94
NMD4Q12129 SED1YDR077W 1017 nt9.2□□□□□ -0.94
NMD4Q12129 YLR111WYLR111W 333 nt9.2□□□□□ -0.94
NMD4Q12129 YGR012WYGR012W 1182 nt9.19□□□□□ -0.94
NMD4Q12129 DBP1YPL119C 1854 nt9.19□□□□□ -0.94
NMD4Q12129 YAT1YAR035W 2064 nt9.19□□□□□ -0.94
NMD4Q12129 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.18□□□□□ -0.94
NMD4Q12129 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.18□□□□□ -0.94
NMD4Q12129 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.18□□□□□ -0.94
NMD4Q12129 LIP1YMR298W 453 nt9.18□□□□□ -0.94
NMD4Q12129 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.18□□□□□ -0.94
NMD4Q12129 ZTA1YBR046C 1005 nt9.18□□□□□ -0.94
NMD4Q12129 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.18□□□□□ -0.94
NMD4Q12129 RAD23YEL037C 1197 nt9.17□□□□□ -0.94
NMD4Q12129 YLR279WYLR279W 390 nt9.17□□□□□ -0.94
NMD4Q12129 YMR226CYMR226C 804 nt9.16□□□□□ -0.94
NMD4Q12129 ZRT3YKL175W 1512 nt9.14□□□□□ -0.95
NMD4Q12129 MSB4YOL112W 1479 nt9.12□□□□□ -0.95
NMD4Q12129 SAM1YLR180W 1149 nt9.11□□□□□ -0.95
NMD4Q12129 YBL086CYBL086C 1401 nt9.11□□□□□ -0.95
NMD4Q12129 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.1□□□□□ -0.95
NMD4Q12129 BSP1YPR171W 1731 nt9.09□□□□□ -0.95
NMD4Q12129 SHY1YGR112W 1170 nt9.08□□□□□ -0.96
NMD4Q12129 RBG2YGR173W 1107 nt9.08□□□□□ -0.96
NMD4Q12129 TOA2YKL058W 369 nt9.07□□□□□ -0.96
NMD4Q12129 RIB3YDR487C 627 nt9.06□□□□□ -0.96
NMD4Q12129 BRR1YPR057W 1026 nt9.06□□□□□ -0.96
NMD4Q12129 LEU9YOR108W 1815 nt9.05□□□□□ -0.96
NMD4Q12129 SPT20YOL148C 1815 nt9.04□□□□□ -0.96
NMD4Q12129 YPL251WYPL251W 303 nt9.03□□□□□ -0.96
NMD4Q12129 HEL2YDR266C 1920 nt9.02□□□□□ -0.97
NMD4Q12129 MEP3YPR138C 1470 nt9.02□□□□□ -0.97
NMD4Q12129 URA6YKL024C 615 nt9□□□□□ -0.97
NMD4Q12129 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt9□□□□□ -0.97
NMD4Q12129 YMR103CYMR103C 363 nt9□□□□□ -0.97
NMD4Q12129 CAB5YDR196C 726 nt8.99□□□□□ -0.97
NMD4Q12129 YJL067WYJL067W 351 nt8.99□□□□□ -0.97
NMD4Q12129 GND2YGR256W 1479 nt8.99□□□□□ -0.97
NMD4Q12129 GND1YHR183W 1470 nt8.98□□□□□ -0.97
NMD4Q12129 APT2YDR441C 546 nt8.98□□□□□ -0.97
NMD4Q12129 INA1YLR413W 2028 nt8.98□□□□□ -0.97
NMD4Q12129 FCY21YER060W 1587 nt8.98□□□□□ -0.97
NMD4Q12129 UGA4YDL210W 1716 nt8.97□□□□□ -0.97
NMD4Q12129 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.97□□□□□ -0.97
NMD4Q12129 UFO1YML088W 2007 nt8.97□□□□□ -0.97
NMD4Q12129 SAM2YDR502C 1155 nt8.95□□□□□ -0.98
NMD4Q12129 OYE3YPL171C 1203 nt8.95□□□□□ -0.98
NMD4Q12129 RPC82YPR190C 1965 nt8.95□□□□□ -0.98
NMD4Q12129 LOT5YKL183W 921 nt8.94□□□□□ -0.98
NMD4Q12129 PET8YNL003C 855 nt8.94□□□□□ -0.98
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