Protein–RNA interactions for Protein: Q08004

BUD20, Bud site selection protein 20, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BUD20Q08004 YHP1YDR451C 1062 nt10.65□□□□□ -0.7
BUD20Q08004 YFR018CYFR018C 1092 nt10.65□□□□□ -0.7
BUD20Q08004 MPS2YGL075C 1164 nt10.65□□□□□ -0.7
BUD20Q08004 MPC1YGL080W 393 nt10.65□□□□□ -0.7
BUD20Q08004 HHO1YPL127C 777 nt10.65□□□□□ -0.7
BUD20Q08004 YNL115CYNL115C 1935 nt10.64□□□□□ -0.71
BUD20Q08004 AGP1YCL025C 1902 nt10.64□□□□□ -0.71
BUD20Q08004 YJR154WYJR154W 1041 nt10.64□□□□□ -0.71
BUD20Q08004 PRE6YOL038W 765 nt10.64□□□□□ -0.71
BUD20Q08004 PEX25YPL112C 1185 nt10.64□□□□□ -0.71
BUD20Q08004 YML079WYML079W 606 nt10.63□□□□□ -0.71
BUD20Q08004 COG1YGL223C 1254 nt10.61□□□□□ -0.71
BUD20Q08004 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt10.61□□□□□ -0.71
BUD20Q08004 XDJ1YLR090W 1380 nt10.61□□□□□ -0.71
BUD20Q08004 FTH1YBR207W 1398 nt10.61□□□□□ -0.71
BUD20Q08004 PIC2YER053C 903 nt10.6□□□□□ -0.71
BUD20Q08004 UBC12YLR306W 567 nt10.6□□□□□ -0.71
BUD20Q08004 ARC19YKL013C 516 nt10.59□□□□□ -0.71
BUD20Q08004 GTT3YEL017W 1014 nt10.58□□□□□ -0.72
BUD20Q08004 YGR201CYGR201C 678 nt10.58□□□□□ -0.72
BUD20Q08004 SHM2YLR058C 1410 nt10.58□□□□□ -0.72
BUD20Q08004 FAR3YMR052W 615 nt10.57□□□□□ -0.72
BUD20Q08004 YBL081WYBL081W 1107 nt10.56□□□□□ -0.72
BUD20Q08004 GDH3YAL062W 1374 nt10.55□□□□□ -0.72
BUD20Q08004 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt10.55□□□□□ -0.72
BUD20Q08004 COX3Q0275 810 nt10.55□□□□□ -0.72
BUD20Q08004 DUT1YBR252W 444 nt10.55□□□□□ -0.72
BUD20Q08004 PAB1YER165W 1734 nt10.54□□□□□ -0.72
BUD20Q08004 TIM17YJL143W 477 nt10.53□□□□□ -0.72
BUD20Q08004 BNS1YGR230W 414 nt10.5□□□□□ -0.73
BUD20Q08004 PAU16YKL224C 372 nt10.5□□□□□ -0.73
BUD20Q08004 FUR4YBR021W 1902 nt10.5□□□□□ -0.73
BUD20Q08004 NIT1YIL164C 600 nt10.49□□□□□ -0.73
BUD20Q08004 VPS75YNL246W 795 nt10.49□□□□□ -0.73
BUD20Q08004 AVT6YER119C 1347 nt10.49□□□□□ -0.73
BUD20Q08004 BNA3YJL060W 1335 nt10.49□□□□□ -0.73
BUD20Q08004 ARP6YLR085C 1317 nt10.49□□□□□ -0.73
BUD20Q08004 YNL234WYNL234W 1281 nt10.48□□□□□ -0.73
BUD20Q08004 NAT5YOR253W 531 nt10.48□□□□□ -0.73
BUD20Q08004 MRPL36YBR122C 534 nt10.48□□□□□ -0.73
BUD20Q08004 RRT5YFR032C 870 nt10.47□□□□□ -0.73
BUD20Q08004 SED5YLR026C 1023 nt10.47□□□□□ -0.73
BUD20Q08004 HOS2YGL194C 1359 nt10.45□□□□□ -0.74
BUD20Q08004 DUS1YML080W 1272 nt10.45□□□□□ -0.74
BUD20Q08004 AIM41YOR215C 558 nt10.45□□□□□ -0.74
BUD20Q08004 SGT2YOR007C 1041 nt10.44□□□□□ -0.74
BUD20Q08004 RUF21RUF21 707 nt10.43□□□□□ -0.74
BUD20Q08004 GOR1YNL274C 1053 nt10.43□□□□□ -0.74
BUD20Q08004 VPS28YPL065W 729 nt10.43□□□□□ -0.74
BUD20Q08004 ICE2YIL090W 1476 nt10.42□□□□□ -0.74
BUD20Q08004 HSP60YLR259C 1719 nt10.41□□□□□ -0.74
BUD20Q08004 YPR1YDR368W 939 nt10.4□□□□□ -0.74
BUD20Q08004 YLR311CYLR311C 348 nt10.4□□□□□ -0.74
BUD20Q08004 YTH1YPR107C 627 nt10.4□□□□□ -0.74
BUD20Q08004 YCL074WYCL074W 927 nt10.39□□□□□ -0.75
BUD20Q08004 NEJ1YLR265C 1029 nt10.39□□□□□ -0.75
BUD20Q08004 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt10.39□□□□□ -0.75
BUD20Q08004 DIA1YMR316W 1011 nt10.39□□□□□ -0.75
BUD20Q08004 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.39□□□□□ -0.75
BUD20Q08004 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.39□□□□□ -0.75
BUD20Q08004 STR3YGL184C 1398 nt10.39□□□□□ -0.75
BUD20Q08004 GLK1YCL040W 1503 nt10.38□□□□□ -0.75
BUD20Q08004 YDL157CYDL157C 357 nt10.38□□□□□ -0.75
BUD20Q08004 APM1YPL259C 1428 nt10.38□□□□□ -0.75
BUD20Q08004 YNL040WYNL040W 1371 nt10.38□□□□□ -0.75
BUD20Q08004 TSR2YLR435W 618 nt10.37□□□□□ -0.75
BUD20Q08004 DAT1YML113W 747 nt10.37□□□□□ -0.75
BUD20Q08004 REC114YMR133W 1287 nt10.36□□□□□ -0.75
BUD20Q08004 BOR1YNL275W 1731 nt10.36□□□□□ -0.75
BUD20Q08004 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.35□□□□□ -0.75
BUD20Q08004 MIR1YJR077C 936 nt10.35□□□□□ -0.75
BUD20Q08004 YHR054CYHR054C 1065 nt10.34□□□□□ -0.75
BUD20Q08004 YJL225CYJL225C 5277 nt10.33□□□□□ -0.76
BUD20Q08004 PEX34YCL056C 435 nt10.32□□□□□ -0.76
BUD20Q08004 AQY2YLL052C 450 nt10.31□□□□□ -0.76
BUD20Q08004 YMR147WYMR147W 672 nt10.31□□□□□ -0.76
BUD20Q08004 PAU7YAR020C 168 nt10.3□□□□□ -0.76
BUD20Q08004 SUA5YGL169W 1281 nt10.29□□□□□ -0.76
BUD20Q08004 YGR011WYGR011W 327 nt10.29□□□□□ -0.76
BUD20Q08004 YCR102CYCR102C 1107 nt10.28□□□□□ -0.76
BUD20Q08004 YDR010CYDR010C 333 nt10.28□□□□□ -0.76
BUD20Q08004 RSA3YLR221C 663 nt10.28□□□□□ -0.76
BUD20Q08004 AME1YBR211C 975 nt10.28□□□□□ -0.76
BUD20Q08004 SHB17YKR043C 816 nt10.27□□□□□ -0.77
BUD20Q08004 PRP4YPR178W 1398 nt10.26□□□□□ -0.77
BUD20Q08004 YKR005CYKR005C 1578 nt10.26□□□□□ -0.77
BUD20Q08004 NBP35YGL091C 987 nt10.26□□□□□ -0.77
BUD20Q08004 THI74YDR438W 1113 nt10.25□□□□□ -0.77
BUD20Q08004 NDJ1YOL104C 1059 nt10.25□□□□□ -0.77
BUD20Q08004 TAZ1YPR140W 1146 nt10.25□□□□□ -0.77
BUD20Q08004 YDL158CYDL158C 309 nt10.24□□□□□ -0.77
BUD20Q08004 ATG17YLR423C 1254 nt10.24□□□□□ -0.77
BUD20Q08004 GET2YER083C 858 nt10.23□□□□□ -0.77
BUD20Q08004 PUS5YLR165C 765 nt10.23□□□□□ -0.77
BUD20Q08004 SCO2YBR024W 906 nt10.23□□□□□ -0.77
BUD20Q08004 NAT4YMR069W 858 nt10.22□□□□□ -0.77
BUD20Q08004 YGR259CYGR259C 441 nt10.21□□□□□ -0.77
BUD20Q08004 YMR074CYMR074C 438 nt10.21□□□□□ -0.77
BUD20Q08004 UBA4YHR111W 1323 nt10.21□□□□□ -0.78
BUD20Q08004 DPS1YLL018C 1674 nt10.21□□□□□ -0.78
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