Protein–RNA interactions for Protein: Q06623

HDA3, HDA1 complex subunit 3, yeastyeast

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3Q06623 AQY2YLL052C 450 nt10.23□□□□□ -0.77
HDA3Q06623 BMT6YLR063W 1098 nt10.23□□□□□ -0.77
HDA3Q06623 AAC1YMR056C 930 nt10.23□□□□□ -0.77
HDA3Q06623 PEX25YPL112C 1185 nt10.22□□□□□ -0.77
HDA3Q06623 YFL066CYFL066C 1179 nt10.21□□□□□ -0.77
HDA3Q06623 NIT1YIL164C 600 nt10.21□□□□□ -0.77
HDA3Q06623 Q0144Q0144 330 nt10.2□□□□□ -0.78
HDA3Q06623 YFR018CYFR018C 1092 nt10.19□□□□□ -0.78
HDA3Q06623 RRT5YFR032C 870 nt10.19□□□□□ -0.78
HDA3Q06623 FRE6YLL051C 2139 nt10.18□□□□□ -0.78
HDA3Q06623 SGT2YOR007C 1041 nt10.16□□□□□ -0.78
HDA3Q06623 SNF1YDR477W 1902 nt10.15□□□□□ -0.79
HDA3Q06623 DAT1YML113W 747 nt10.14□□□□□ -0.79
HDA3Q06623 PAU16YKL224C 372 nt10.12□□□□□ -0.79
HDA3Q06623 YTH1YPR107C 627 nt10.12□□□□□ -0.79
HDA3Q06623 VPS75YNL246W 795 nt10.11□□□□□ -0.79
HDA3Q06623 IRC24YIR036C 792 nt10.1□□□□□ -0.79
HDA3Q06623 SKG1YKR100C 1068 nt10.1□□□□□ -0.79
HDA3Q06623 PRE6YOL038W 765 nt10.1□□□□□ -0.79
HDA3Q06623 YCR102CYCR102C 1107 nt10.09□□□□□ -0.79
HDA3Q06623 BIO5YNR056C 1686 nt10.09□□□□□ -0.79
HDA3Q06623 RTN2YDL204W 1182 nt10.07□□□□□ -0.8
HDA3Q06623 NBP35YGL091C 987 nt10.07□□□□□ -0.8
HDA3Q06623 MCH5YOR306C 1566 nt10.06□□□□□ -0.8
HDA3Q06623 BNS1YGR230W 414 nt10.05□□□□□ -0.8
HDA3Q06623 PET20YPL159C 762 nt10.04□□□□□ -0.8
HDA3Q06623 snR78snR78 87 nt10□□□□□ -0.81
HDA3Q06623 NAR1YNL240C 1476 nt9.98□□□□□ -0.81
HDA3Q06623 PAU7YAR020C 168 nt9.98□□□□□ -0.81
HDA3Q06623 PLB1YMR008C 1995 nt9.97□□□□□ -0.81
HDA3Q06623 PUS5YLR165C 765 nt9.97□□□□□ -0.81
HDA3Q06623 REC114YMR133W 1287 nt9.97□□□□□ -0.81
HDA3Q06623 ARP6YLR085C 1317 nt9.96□□□□□ -0.82
HDA3Q06623 YCR099CYCR099C 468 nt9.94□□□□□ -0.82
HDA3Q06623 FAF1YIL019W 1041 nt9.94□□□□□ -0.82
HDA3Q06623 NAT4YMR069W 858 nt9.93□□□□□ -0.82
HDA3Q06623 FHN1YGR131W 525 nt9.92□□□□□ -0.82
HDA3Q06623 SHH4YLR164W 507 nt9.92□□□□□ -0.82
HDA3Q06623 YDR010CYDR010C 333 nt9.91□□□□□ -0.82
HDA3Q06623 SHB17YKR043C 816 nt9.91□□□□□ -0.82
HDA3Q06623 PBP1YGR178C 2169 nt9.9□□□□□ -0.82
HDA3Q06623 TIR3YIL011W 810 nt9.9□□□□□ -0.82
HDA3Q06623 YJL107CYJL107C 1164 nt9.9□□□□□ -0.82
HDA3Q06623 SBA1YKL117W 651 nt9.9□□□□□ -0.82
HDA3Q06623 MIR1YJR077C 936 nt9.89□□□□□ -0.83
HDA3Q06623 ATG17YLR423C 1254 nt9.89□□□□□ -0.83
HDA3Q06623 CYT2YKL087C 675 nt9.87□□□□□ -0.83
HDA3Q06623 PRO1YDR300C 1287 nt9.85□□□□□ -0.83
HDA3Q06623 LSC2YGR244C 1284 nt9.85□□□□□ -0.83
HDA3Q06623 PRM5YIL117C 957 nt9.85□□□□□ -0.83
HDA3Q06623 THP3YPR045C 1413 nt9.83□□□□□ -0.84
HDA3Q06623 SFA1YDL168W 1161 nt9.83□□□□□ -0.84
HDA3Q06623 YNR068CYNR068C 819 nt9.83□□□□□ -0.84
HDA3Q06623 RSM23YGL129C 1353 nt9.83□□□□□ -0.84
HDA3Q06623 GAP1YKR039W 1809 nt9.82□□□□□ -0.84
HDA3Q06623 POM34YLR018C 900 nt9.82□□□□□ -0.84
HDA3Q06623 UTR1YJR049C 1593 nt9.82□□□□□ -0.84
HDA3Q06623 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt9.81□□□□□ -0.84
HDA3Q06623 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.81□□□□□ -0.84
HDA3Q06623 AST1YBL069W 1290 nt9.81□□□□□ -0.84
HDA3Q06623 RET2YFR051C 1641 nt9.81□□□□□ -0.84
HDA3Q06623 UBA4YHR111W 1323 nt9.81□□□□□ -0.84
HDA3Q06623 URE2YNL229C 1065 nt9.8□□□□□ -0.84
HDA3Q06623 THI74YDR438W 1113 nt9.79□□□□□ -0.84
HDA3Q06623 MSF1YPR047W 1410 nt9.79□□□□□ -0.84
HDA3Q06623 HIF1YLL022C 1158 nt9.78□□□□□ -0.84
HDA3Q06623 TOM6YOR045W 186 nt9.78□□□□□ -0.84
HDA3Q06623 ATG15YCR068W 1563 nt9.78□□□□□ -0.84
HDA3Q06623 PHO89YBR296C 1725 nt9.78□□□□□ -0.84
HDA3Q06623 RSC4YKR008W 1878 nt9.77□□□□□ -0.85
HDA3Q06623 NAS6YGR232W 687 nt9.77□□□□□ -0.85
HDA3Q06623 ALD4YOR374W 1560 nt9.76□□□□□ -0.85
HDA3Q06623 RPM1RPM1 483 nt9.76□□□□□ -0.85
HDA3Q06623 KDX1YKL161C 1302 nt9.76□□□□□ -0.85
HDA3Q06623 HOS2YGL194C 1359 nt9.75□□□□□ -0.85
HDA3Q06623 YSR3YKR053C 1215 nt9.74□□□□□ -0.85
HDA3Q06623 YML089CYML089C 369 nt9.74□□□□□ -0.85
HDA3Q06623 YGL118CYGL118C 438 nt9.73□□□□□ -0.85
HDA3Q06623 AI3Q0060 1248 nt9.71□□□□□ -0.86
HDA3Q06623 COQ2YNR041C 1119 nt9.7□□□□□ -0.86
HDA3Q06623 PEX2YJL210W 816 nt9.69□□□□□ -0.86
HDA3Q06623 YEL074WYEL074W 339 nt9.68□□□□□ -0.86
HDA3Q06623 SAM35YHR083W 990 nt9.68□□□□□ -0.86
HDA3Q06623 XYL2YLR070C 1071 nt9.68□□□□□ -0.86
HDA3Q06623 PIC2YER053C 903 nt9.67□□□□□ -0.86
HDA3Q06623 DIF1YLR437C 402 nt9.67□□□□□ -0.86
HDA3Q06623 YAT1YAR035W 2064 nt9.67□□□□□ -0.86
HDA3Q06623 SWP1YMR149W 861 nt9.66□□□□□ -0.86
HDA3Q06623 TIF6YPR016C 738 nt9.66□□□□□ -0.86
HDA3Q06623 MRP20YDR405W 792 nt9.65□□□□□ -0.86
HDA3Q06623 APM1YPL259C 1428 nt9.65□□□□□ -0.87
HDA3Q06623 YGL034CYGL034C 366 nt9.64□□□□□ -0.87
HDA3Q06623 MOD5YOR274W 1287 nt9.64□□□□□ -0.87
HDA3Q06623 YPL168WYPL168W 1293 nt9.64□□□□□ -0.87
HDA3Q06623 HIP1YGR191W 1812 nt9.63□□□□□ -0.87
HDA3Q06623 YCR087WYCR087W 516 nt9.63□□□□□ -0.87
HDA3Q06623 COX16YJL003W 357 nt9.63□□□□□ -0.87
HDA3Q06623 YMR147WYMR147W 672 nt9.63□□□□□ -0.87
HDA3Q06623 NAT5YOR253W 531 nt9.63□□□□□ -0.87
HDA3Q06623 YBL081WYBL081W 1107 nt9.61□□□□□ -0.87
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