Protein–RNA interactions for Protein: Q06070

YLR407W, Uncharacterized protein YLR407W, yeastyeast

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR407WQ06070 BIO5YNR056C 1686 nt11.36□□□□□ -0.59
YLR407WQ06070 MRP20YDR405W 792 nt11.36□□□□□ -0.59
YLR407WQ06070 ATG15YCR068W 1563 nt11.36□□□□□ -0.59
YLR407WQ06070 GAP1YKR039W 1809 nt11.35□□□□□ -0.59
YLR407WQ06070 PEX2YJL210W 816 nt11.35□□□□□ -0.59
YLR407WQ06070 LSC2YGR244C 1284 nt11.34□□□□□ -0.59
YLR407WQ06070 RBG1YAL036C 1110 nt11.34□□□□□ -0.59
YLR407WQ06070 YCR087WYCR087W 516 nt11.33□□□□□ -0.6
YLR407WQ06070 UTR1YJR049C 1593 nt11.31□□□□□ -0.6
YLR407WQ06070 PRM5YIL117C 957 nt11.3□□□□□ -0.6
YLR407WQ06070 AIM45YPR004C 1035 nt11.3□□□□□ -0.6
YLR407WQ06070 SBA1YKL117W 651 nt11.28□□□□□ -0.6
YLR407WQ06070 YML089CYML089C 369 nt11.27□□□□□ -0.61
YLR407WQ06070 NDI1YML120C 1542 nt11.25□□□□□ -0.61
YLR407WQ06070 HIP1YGR191W 1812 nt11.25□□□□□ -0.61
YLR407WQ06070 TIF6YPR016C 738 nt11.23□□□□□ -0.61
YLR407WQ06070 RPL4BYDR012W 1089 nt11.2□□□□□ -0.62
YLR407WQ06070 RPL4AYBR031W 1089 nt11.2□□□□□ -0.62
YLR407WQ06070 DIF1YLR437C 402 nt11.17□□□□□ -0.62
YLR407WQ06070 NRT1YOR071C 1797 nt11.16□□□□□ -0.62
YLR407WQ06070 RPS14BYJL191W 417 nt11.16□□□□□ -0.62
YLR407WQ06070 CLB6YGR109C 1143 nt11.15□□□□□ -0.62
YLR407WQ06070 UTH1YKR042W 1098 nt11.15□□□□□ -0.62
YLR407WQ06070 NAR1YNL240C 1476 nt11.14□□□□□ -0.63
YLR407WQ06070 MET28YIR017C 564 nt11.14□□□□□ -0.63
YLR407WQ06070 HIF1YLL022C 1158 nt11.14□□□□□ -0.63
YLR407WQ06070 ALD4YOR374W 1560 nt11.12□□□□□ -0.63
YLR407WQ06070 MCH5YOR306C 1566 nt11.1□□□□□ -0.63
YLR407WQ06070 PBP1YGR178C 2169 nt11.1□□□□□ -0.63
YLR407WQ06070 GLR1YPL091W 1452 nt11.09□□□□□ -0.63
YLR407WQ06070 SAM35YHR083W 990 nt11.09□□□□□ -0.63
YLR407WQ06070 YER190C-AYER190C-A 576 nt11.06□□□□□ -0.64
YLR407WQ06070 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt11.06□□□□□ -0.64
YLR407WQ06070 YML133W-AYML133W-A 576 nt11.06□□□□□ -0.64
YLR407WQ06070 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt11.06□□□□□ -0.64
YLR407WQ06070 SDH5YOL071W 489 nt11.06□□□□□ -0.64
YLR407WQ06070 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt11.06□□□□□ -0.64
YLR407WQ06070 ZTA1YBR046C 1005 nt11.05□□□□□ -0.64
YLR407WQ06070 UME6YDR207C 2511 nt11.04□□□□□ -0.64
YLR407WQ06070 YAR028WYAR028W 705 nt11.04□□□□□ -0.64
YLR407WQ06070 YMR244WYMR244W 1068 nt11.03□□□□□ -0.64
YLR407WQ06070 MTG2YHR168W 1557 nt11.03□□□□□ -0.64
YLR407WQ06070 AKR2YOR034C 2250 nt11.01□□□□□ -0.65
YLR407WQ06070 CYT2YKL087C 675 nt11□□□□□ -0.65
YLR407WQ06070 TSC10YBR265W 963 nt10.98□□□□□ -0.65
YLR407WQ06070 DBP1YPL119C 1854 nt10.96□□□□□ -0.65
YLR407WQ06070 HXT1YHR094C 1713 nt10.96□□□□□ -0.65
YLR407WQ06070 YGR012WYGR012W 1182 nt10.96□□□□□ -0.65
YLR407WQ06070 YLR279WYLR279W 390 nt10.96□□□□□ -0.65
YLR407WQ06070 FIT3YOR383C 615 nt10.96□□□□□ -0.65
YLR407WQ06070 LIP1YMR298W 453 nt10.94□□□□□ -0.66
YLR407WQ06070 ALP1YNL270C 1722 nt10.94□□□□□ -0.66
YLR407WQ06070 MSB4YOL112W 1479 nt10.93□□□□□ -0.66
YLR407WQ06070 SED1YDR077W 1017 nt10.93□□□□□ -0.66
YLR407WQ06070 CAB5YDR196C 726 nt10.92□□□□□ -0.66
YLR407WQ06070 YBL086CYBL086C 1401 nt10.91□□□□□ -0.66
YLR407WQ06070 YLR111WYLR111W 333 nt10.9□□□□□ -0.66
YLR407WQ06070 YAT1YAR035W 2064 nt10.89□□□□□ -0.67
YLR407WQ06070 SHY1YGR112W 1170 nt10.86□□□□□ -0.67
YLR407WQ06070 YPL251WYPL251W 303 nt10.86□□□□□ -0.67
YLR407WQ06070 RAD23YEL037C 1197 nt10.84□□□□□ -0.67
YLR407WQ06070 TOA2YKL058W 369 nt10.83□□□□□ -0.68
YLR407WQ06070 SAM1YLR180W 1149 nt10.83□□□□□ -0.68
YLR407WQ06070 BRR1YPR057W 1026 nt10.83□□□□□ -0.68
YLR407WQ06070 YJL225CYJL225C 5277 nt10.83□□□□□ -0.68
YLR407WQ06070 ZRT3YKL175W 1512 nt10.83□□□□□ -0.68
YLR407WQ06070 RBG2YGR173W 1107 nt10.81□□□□□ -0.68
YLR407WQ06070 YMR103CYMR103C 363 nt10.81□□□□□ -0.68
YLR407WQ06070 UGA4YDL210W 1716 nt10.8□□□□□ -0.68
YLR407WQ06070 YMR226CYMR226C 804 nt10.79□□□□□ -0.68
YLR407WQ06070 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.79□□□□□ -0.68
YLR407WQ06070 LEU9YOR108W 1815 nt10.79□□□□□ -0.68
YLR407WQ06070 YJL067WYJL067W 351 nt10.78□□□□□ -0.68
YLR407WQ06070 GND2YGR256W 1479 nt10.78□□□□□ -0.68
YLR407WQ06070 MEP3YPR138C 1470 nt10.78□□□□□ -0.68
YLR407WQ06070 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.77□□□□□ -0.69
YLR407WQ06070 RIB3YDR487C 627 nt10.76□□□□□ -0.69
YLR407WQ06070 UFO1YML088W 2007 nt10.74□□□□□ -0.69
YLR407WQ06070 TRT2tT(CGU)K 72 nt10.69□□□□□ -0.7
YLR407WQ06070 SMM1YNR015W 1155 nt10.69□□□□□ -0.7
YLR407WQ06070 FCY21YER060W 1587 nt10.69□□□□□ -0.7
YLR407WQ06070 URA6YKL024C 615 nt10.68□□□□□ -0.7
YLR407WQ06070 OYE3YPL171C 1203 nt10.68□□□□□ -0.7
YLR407WQ06070 RPC82YPR190C 1965 nt10.68□□□□□ -0.7
YLR407WQ06070 LOT5YKL183W 921 nt10.67□□□□□ -0.7
YLR407WQ06070 GND1YHR183W 1470 nt10.67□□□□□ -0.7
YLR407WQ06070 INA1YLR413W 2028 nt10.67□□□□□ -0.7
YLR407WQ06070 APT2YDR441C 546 nt10.65□□□□□ -0.7
YLR407WQ06070 PRY1YJL079C 900 nt10.64□□□□□ -0.71
YLR407WQ06070 SSN3YPL042C 1668 nt10.63□□□□□ -0.71
YLR407WQ06070 SAM2YDR502C 1155 nt10.62□□□□□ -0.71
YLR407WQ06070 PET8YNL003C 855 nt10.61□□□□□ -0.71
YLR407WQ06070 BNI5YNL166C 1347 nt10.59□□□□□ -0.71
YLR407WQ06070 CMP2YML057W 1815 nt10.59□□□□□ -0.71
YLR407WQ06070 CWC15YDR163W 528 nt10.58□□□□□ -0.72
YLR407WQ06070 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.58□□□□□ -0.72
YLR407WQ06070 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.58□□□□□ -0.72
YLR407WQ06070 FLR1YBR008C 1647 nt10.58□□□□□ -0.72
YLR407WQ06070 CSM1YCR086W 573 nt10.56□□□□□ -0.72
YLR407WQ06070 YJL055WYJL055W 738 nt10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 72.9 ms