Protein–RNA interactions for Protein: P53158

KXD1, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit KXD1, yeastyeast

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
KXD1P53158 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt10.27□□□□□ -0.77
KXD1P53158 REC114YMR133W 1287 nt10.27□□□□□ -0.77
KXD1P53158 STD1YOR047C 1335 nt10.27□□□□□ -0.77
KXD1P53158 RAX1YOR301W 1308 nt10.27□□□□□ -0.77
KXD1P53158 YHP1YDR451C 1062 nt10.26□□□□□ -0.77
KXD1P53158 PRE6YOL038W 765 nt10.26□□□□□ -0.77
KXD1P53158 MIC12YBR262C 321 nt10.25□□□□□ -0.77
KXD1P53158 HOS2YGL194C 1359 nt10.25□□□□□ -0.77
KXD1P53158 YOR169CYOR169C 465 nt10.24□□□□□ -0.77
KXD1P53158 NAT5YOR253W 531 nt10.24□□□□□ -0.77
KXD1P53158 YNL115CYNL115C 1935 nt10.23□□□□□ -0.77
KXD1P53158 YFL066CYFL066C 1179 nt10.23□□□□□ -0.77
KXD1P53158 RRT5YFR032C 870 nt10.22□□□□□ -0.77
KXD1P53158 MPC1YGL080W 393 nt10.22□□□□□ -0.77
KXD1P53158 BNA2YJR078W 1362 nt10.22□□□□□ -0.77
KXD1P53158 ATG17YLR423C 1254 nt10.21□□□□□ -0.77
KXD1P53158 PAU16YKL224C 372 nt10.2□□□□□ -0.78
KXD1P53158 PUS5YLR165C 765 nt10.2□□□□□ -0.78
KXD1P53158 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt10.2□□□□□ -0.78
KXD1P53158 YLR036CYLR036C 612 nt10.19□□□□□ -0.78
KXD1P53158 MRPL36YBR122C 534 nt10.19□□□□□ -0.78
KXD1P53158 YML079WYML079W 606 nt10.18□□□□□ -0.78
KXD1P53158 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.17□□□□□ -0.78
KXD1P53158 SWE1YJL187C 2460 nt10.17□□□□□ -0.78
KXD1P53158 YBL081WYBL081W 1107 nt10.16□□□□□ -0.78
KXD1P53158 AIM41YOR215C 558 nt10.15□□□□□ -0.78
KXD1P53158 BNA3YJL060W 1335 nt10.14□□□□□ -0.79
KXD1P53158 VPS75YNL246W 795 nt10.14□□□□□ -0.79
KXD1P53158 Q0017Q0017 162 nt10.14□□□□□ -0.79
KXD1P53158 ICE2YIL090W 1476 nt10.13□□□□□ -0.79
KXD1P53158 YGR201CYGR201C 678 nt10.12□□□□□ -0.79
KXD1P53158 TIM17YJL143W 477 nt10.12□□□□□ -0.79
KXD1P53158 XDJ1YLR090W 1380 nt10.12□□□□□ -0.79
KXD1P53158 APM1YPL259C 1428 nt10.11□□□□□ -0.79
KXD1P53158 FHN1YGR131W 525 nt10.11□□□□□ -0.79
KXD1P53158 HHO1YPL127C 777 nt10.1□□□□□ -0.79
KXD1P53158 CCA1YER168C 1641 nt10.1□□□□□ -0.79
KXD1P53158 SHM2YLR058C 1410 nt10.09□□□□□ -0.79
KXD1P53158 ARP6YLR085C 1317 nt10.08□□□□□ -0.8
KXD1P53158 ARC19YKL013C 516 nt10.08□□□□□ -0.8
KXD1P53158 YMR147WYMR147W 672 nt10.08□□□□□ -0.8
KXD1P53158 PEX27YOR193W 1131 nt10.08□□□□□ -0.8
KXD1P53158 SSN3YPL042C 1668 nt10.07□□□□□ -0.8
KXD1P53158 FAF1YIL019W 1041 nt10.07□□□□□ -0.8
KXD1P53158 UBC12YLR306W 567 nt10.06□□□□□ -0.8
KXD1P53158 GDH3YAL062W 1374 nt10.04□□□□□ -0.8
KXD1P53158 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt10.04□□□□□ -0.8
KXD1P53158 YNL234WYNL234W 1281 nt10.04□□□□□ -0.8
KXD1P53158 BSP1YPR171W 1731 nt10.04□□□□□ -0.8
KXD1P53158 AGP1YCL025C 1902 nt10.03□□□□□ -0.8
KXD1P53158 SCO2YBR024W 906 nt10.03□□□□□ -0.8
KXD1P53158 NIT1YIL164C 600 nt10.02□□□□□ -0.81
KXD1P53158 YLR311CYLR311C 348 nt10.02□□□□□ -0.81
KXD1P53158 COX3Q0275 810 nt10.01□□□□□ -0.81
KXD1P53158 MIR1YJR077C 936 nt10.01□□□□□ -0.81
KXD1P53158 SWP1YMR149W 861 nt10.01□□□□□ -0.81
KXD1P53158 KDX1YKL161C 1302 nt10.01□□□□□ -0.81
KXD1P53158 BOR1YNL275W 1731 nt10□□□□□ -0.81
KXD1P53158 PHO92YDR374C 921 nt10□□□□□ -0.81
KXD1P53158 GET2YER083C 858 nt9.99□□□□□ -0.81
KXD1P53158 UME6YDR207C 2511 nt9.99□□□□□ -0.81
KXD1P53158 MPS2YGL075C 1164 nt9.98□□□□□ -0.81
KXD1P53158 SED5YLR026C 1023 nt9.98□□□□□ -0.81
KXD1P53158 AVT6YER119C 1347 nt9.98□□□□□ -0.81
KXD1P53158 RUF21RUF21 707 nt9.97□□□□□ -0.81
KXD1P53158 SGT2YOR007C 1041 nt9.97□□□□□ -0.81
KXD1P53158 SUA5YGL169W 1281 nt9.96□□□□□ -0.82
KXD1P53158 NAT4YMR069W 858 nt9.96□□□□□ -0.82
KXD1P53158 VPS28YPL065W 729 nt9.96□□□□□ -0.82
KXD1P53158 PCL10YGL134W 1302 nt9.96□□□□□ -0.82
KXD1P53158 GLK1YCL040W 1503 nt9.96□□□□□ -0.82
KXD1P53158 YHL044WYHL044W 708 nt9.95□□□□□ -0.82
KXD1P53158 DAT1YML113W 747 nt9.95□□□□□ -0.82
KXD1P53158 NDJ1YOL104C 1059 nt9.95□□□□□ -0.82
KXD1P53158 COX16YJL003W 357 nt9.94□□□□□ -0.82
KXD1P53158 GOR1YNL274C 1053 nt9.94□□□□□ -0.82
KXD1P53158 THI74YDR438W 1113 nt9.93□□□□□ -0.82
KXD1P53158 PAU7YAR020C 168 nt9.93□□□□□ -0.82
KXD1P53158 DUT1YBR252W 444 nt9.93□□□□□ -0.82
KXD1P53158 DIA1YMR316W 1011 nt9.91□□□□□ -0.82
KXD1P53158 MSF1YPR047W 1410 nt9.9□□□□□ -0.82
KXD1P53158 YDL157CYDL157C 357 nt9.9□□□□□ -0.82
KXD1P53158 GTT3YEL017W 1014 nt9.9□□□□□ -0.82
KXD1P53158 TAF4YMR005W 1167 nt9.89□□□□□ -0.83
KXD1P53158 SHB17YKR043C 816 nt9.88□□□□□ -0.83
KXD1P53158 YDR010CYDR010C 333 nt9.87□□□□□ -0.83
KXD1P53158 MRI1YPR118W 1236 nt9.87□□□□□ -0.83
KXD1P53158 UBA4YHR111W 1323 nt9.85□□□□□ -0.83
KXD1P53158 DUS1YML080W 1272 nt9.85□□□□□ -0.83
KXD1P53158 PEX34YCL056C 435 nt9.85□□□□□ -0.83
KXD1P53158 YCR102CYCR102C 1107 nt9.84□□□□□ -0.83
KXD1P53158 TSR2YLR435W 618 nt9.84□□□□□ -0.83
KXD1P53158 YCL074WYCL074W 927 nt9.83□□□□□ -0.84
KXD1P53158 YPR1YDR368W 939 nt9.83□□□□□ -0.84
KXD1P53158 NEJ1YLR265C 1029 nt9.83□□□□□ -0.84
KXD1P53158 FAR3YMR052W 615 nt9.83□□□□□ -0.84
KXD1P53158 COA2YPL189C-A 207 nt9.83□□□□□ -0.84
KXD1P53158 FUR4YBR021W 1902 nt9.83□□□□□ -0.84
KXD1P53158 MRS3YJL133W 945 nt9.82□□□□□ -0.84
KXD1P53158 AME1YBR211C 975 nt9.82□□□□□ -0.84
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