Protein–RNA interactions for Protein: P39548

YAR028W, DUP240 protein YAR028W, yeastyeast

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YAR028WP39548 LSC2YGR244C 1284 nt9.38□□□□□ -0.91
YAR028WP39548 TIR3YIL011W 810 nt9.37□□□□□ -0.91
YAR028WP39548 MRPL8YJL063C 717 nt9.37□□□□□ -0.91
YAR028WP39548 LCP5YER127W 1074 nt9.36□□□□□ -0.91
YAR028WP39548 ADO1YJR105W 1023 nt9.35□□□□□ -0.91
YAR028WP39548 GAP1YKR039W 1809 nt9.35□□□□□ -0.91
YAR028WP39548 SPT20YOL148C 1815 nt9.34□□□□□ -0.91
YAR028WP39548 YFL066CYFL066C 1179 nt9.34□□□□□ -0.91
YAR028WP39548 INA1YLR413W 2028 nt9.34□□□□□ -0.91
YAR028WP39548 URH1YDR400W 1023 nt9.32□□□□□ -0.92
YAR028WP39548 SHH4YLR164W 507 nt9.32□□□□□ -0.92
YAR028WP39548 ABZ2YMR289W 1125 nt9.32□□□□□ -0.92
YAR028WP39548 SAM35YHR083W 990 nt9.31□□□□□ -0.92
YAR028WP39548 RPC82YPR190C 1965 nt9.31□□□□□ -0.92
YAR028WP39548 HSL7YBR133C 2484 nt9.29□□□□□ -0.92
YAR028WP39548 PRO1YDR300C 1287 nt9.29□□□□□ -0.92
YAR028WP39548 PAB1YER165W 1734 nt9.28□□□□□ -0.92
YAR028WP39548 ZRT3YKL175W 1512 nt9.27□□□□□ -0.93
YAR028WP39548 POM34YLR018C 900 nt9.27□□□□□ -0.93
YAR028WP39548 YFR018CYFR018C 1092 nt9.26□□□□□ -0.93
YAR028WP39548 TOM20YGR082W 552 nt9.26□□□□□ -0.93
YAR028WP39548 RPM1RPM1 483 nt9.26□□□□□ -0.93
YAR028WP39548 BUR6YER159C 429 nt9.25□□□□□ -0.93
YAR028WP39548 PAU7YAR020C 168 nt9.23□□□□□ -0.93
YAR028WP39548 ATG15YCR068W 1563 nt9.23□□□□□ -0.93
YAR028WP39548 AI5_BETAQ0075 1065 nt9.22□□□□□ -0.93
YAR028WP39548 YML089CYML089C 369 nt9.22□□□□□ -0.93
YAR028WP39548 YDR010CYDR010C 333 nt9.21□□□□□ -0.94
YAR028WP39548 FRE6YLL051C 2139 nt9.21□□□□□ -0.94
YAR028WP39548 YJL118WYJL118W 660 nt9.2□□□□□ -0.94
YAR028WP39548 DIF1YLR437C 402 nt9.19□□□□□ -0.94
YAR028WP39548 SFA1YDL168W 1161 nt9.18□□□□□ -0.94
YAR028WP39548 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.18□□□□□ -0.94
YAR028WP39548 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.18□□□□□ -0.94
YAR028WP39548 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.17□□□□□ -0.94
YAR028WP39548 SHB17YKR043C 816 nt9.17□□□□□ -0.94
YAR028WP39548 DBP1YPL119C 1854 nt9.17□□□□□ -0.94
YAR028WP39548 YJL067WYJL067W 351 nt9.16□□□□□ -0.94
YAR028WP39548 PRE6YOL038W 765 nt9.16□□□□□ -0.94
YAR028WP39548 TOM6YOR045W 186 nt9.15□□□□□ -0.94
YAR028WP39548 HXT1YHR094C 1713 nt9.14□□□□□ -0.95
YAR028WP39548 RET2YFR051C 1641 nt9.13□□□□□ -0.95
YAR028WP39548 SHY1YGR112W 1170 nt9.1□□□□□ -0.95
YAR028WP39548 MIR1YJR077C 936 nt9.09□□□□□ -0.95
YAR028WP39548 TIF6YPR016C 738 nt9.09□□□□□ -0.95
YAR028WP39548 YPL041CYPL041C 624 nt9.08□□□□□ -0.96
YAR028WP39548 COG1YGL223C 1254 nt9.06□□□□□ -0.96
YAR028WP39548 PEX2YJL210W 816 nt9.06□□□□□ -0.96
YAR028WP39548 SRN2YLR119W 642 nt9.06□□□□□ -0.96
YAR028WP39548 PHO89YBR296C 1725 nt9.05□□□□□ -0.96
YAR028WP39548 UBA4YHR111W 1323 nt9.05□□□□□ -0.96
YAR028WP39548 RRT5YFR032C 870 nt9.04□□□□□ -0.96
YAR028WP39548 BMT5YIL096C 1011 nt9.04□□□□□ -0.96
YAR028WP39548 YAR028WYAR028W 705 nt9.04□□□□□ -0.96
YAR028WP39548 MUP1YGR055W 1725 nt9.04□□□□□ -0.96
YAR028WP39548 YBL086CYBL086C 1401 nt9.04□□□□□ -0.96
YAR028WP39548 HIP1YGR191W 1812 nt9.03□□□□□ -0.96
YAR028WP39548 FTH1YBR207W 1398 nt9.03□□□□□ -0.96
YAR028WP39548 LIP1YMR298W 453 nt9.03□□□□□ -0.96
YAR028WP39548 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt9.03□□□□□ -0.96
YAR028WP39548 HOL1YNR055C 1761 nt9.02□□□□□ -0.97
YAR028WP39548 SED1YDR077W 1017 nt9.02□□□□□ -0.97
YAR028WP39548 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt9.02□□□□□ -0.97
YAR028WP39548 ILV3YJR016C 1758 nt9.01□□□□□ -0.97
YAR028WP39548 YDR094WYDR094W 336 nt9□□□□□ -0.97
YAR028WP39548 YER190C-AYER190C-A 576 nt9□□□□□ -0.97
YAR028WP39548 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9□□□□□ -0.97
YAR028WP39548 YML133W-AYML133W-A 576 nt9□□□□□ -0.97
YAR028WP39548 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9□□□□□ -0.97
YAR028WP39548 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9□□□□□ -0.97
YAR028WP39548 RIM8YGL045W 1629 nt9□□□□□ -0.97
YAR028WP39548 MET28YIR017C 564 nt8.99□□□□□ -0.97
YAR028WP39548 URA6YKL024C 615 nt8.99□□□□□ -0.97
YAR028WP39548 COQ2YNR041C 1119 nt8.99□□□□□ -0.97
YAR028WP39548 YGL114WYGL114W 2178 nt8.98□□□□□ -0.97
YAR028WP39548 YSR3YKR053C 1215 nt8.97□□□□□ -0.97
YAR028WP39548 YNL024CYNL024C 741 nt8.97□□□□□ -0.97
YAR028WP39548 YOR325WYOR325W 474 nt8.97□□□□□ -0.97
YAR028WP39548 MTG2YHR168W 1557 nt8.97□□□□□ -0.97
YAR028WP39548 THI74YDR438W 1113 nt8.96□□□□□ -0.98
YAR028WP39548 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.96□□□□□ -0.98
YAR028WP39548 HEL2YDR266C 1920 nt8.95□□□□□ -0.98
YAR028WP39548 UFO1YML088W 2007 nt8.95□□□□□ -0.98
YAR028WP39548 LEU9YOR108W 1815 nt8.94□□□□□ -0.98
YAR028WP39548 YCR087WYCR087W 516 nt8.94□□□□□ -0.98
YAR028WP39548 MRP20YDR405W 792 nt8.94□□□□□ -0.98
YAR028WP39548 PAU16YKL224C 372 nt8.93□□□□□ -0.98
YAR028WP39548 SAM1YLR180W 1149 nt8.93□□□□□ -0.98
YAR028WP39548 YHM2YMR241W 945 nt8.93□□□□□ -0.98
YAR028WP39548 YTH1YPR107C 627 nt8.93□□□□□ -0.98
YAR028WP39548 NRT1YOR071C 1797 nt8.92□□□□□ -0.98
YAR028WP39548 AKR2YOR034C 2250 nt8.92□□□□□ -0.98
YAR028WP39548 CWC15YDR163W 528 nt8.91□□□□□ -0.98
YAR028WP39548 UTH1YKR042W 1098 nt8.91□□□□□ -0.98
YAR028WP39548 OPI10YOL032W 741 nt8.91□□□□□ -0.98
YAR028WP39548 ZTA1YBR046C 1005 nt8.9□□□□□ -0.98
YAR028WP39548 YPL251WYPL251W 303 nt8.9□□□□□ -0.98
YAR028WP39548 BRR1YPR057W 1026 nt8.9□□□□□ -0.98
YAR028WP39548 ALP1YNL270C 1722 nt8.89□□□□□ -0.99
YAR028WP39548 RPL4BYDR012W 1089 nt8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13 ms