Protein–RNA interactions for Protein: P38957

SHU2, Suppressor of hydroxyurea sensitivity protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHU2P38957 HIF1YLL022C 1158 nt9.87□□□□□ -0.83
SHU2P38957 UTR1YJR049C 1593 nt9.86□□□□□ -0.83
SHU2P38957 POM34YLR018C 900 nt9.86□□□□□ -0.83
SHU2P38957 GAP1YKR039W 1809 nt9.86□□□□□ -0.83
SHU2P38957 ALD4YOR374W 1560 nt9.85□□□□□ -0.83
SHU2P38957 PRO1YDR300C 1287 nt9.84□□□□□ -0.83
SHU2P38957 PAU7YAR020C 168 nt9.84□□□□□ -0.83
SHU2P38957 MIR1YJR077C 936 nt9.83□□□□□ -0.84
SHU2P38957 SHB17YKR043C 816 nt9.83□□□□□ -0.84
SHU2P38957 RRT5YFR032C 870 nt9.82□□□□□ -0.84
SHU2P38957 YAT1YAR035W 2064 nt9.82□□□□□ -0.84
SHU2P38957 SFA1YDL168W 1161 nt9.81□□□□□ -0.84
SHU2P38957 YML089CYML089C 369 nt9.81□□□□□ -0.84
SHU2P38957 RET2YFR051C 1641 nt9.8□□□□□ -0.84
SHU2P38957 Q0010Q0010 387 nt9.79□□□□□ -0.84
SHU2P38957 PAM17YKR065C 594 nt9.77□□□□□ -0.85
SHU2P38957 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.76□□□□□ -0.85
SHU2P38957 PAU16YKL224C 372 nt9.76□□□□□ -0.85
SHU2P38957 SAM35YHR083W 990 nt9.75□□□□□ -0.85
SHU2P38957 ATG15YCR068W 1563 nt9.75□□□□□ -0.85
SHU2P38957 UBA4YHR111W 1323 nt9.74□□□□□ -0.85
SHU2P38957 DIF1YLR437C 402 nt9.73□□□□□ -0.85
SHU2P38957 ARA2YMR041C 1008 nt9.72□□□□□ -0.85
SHU2P38957 NDI1YML120C 1542 nt9.72□□□□□ -0.85
SHU2P38957 TOM6YOR045W 186 nt9.71□□□□□ -0.86
SHU2P38957 CMP2YML057W 1815 nt9.7□□□□□ -0.86
SHU2P38957 YLR122CYLR122C 378 nt9.7□□□□□ -0.86
SHU2P38957 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.69□□□□□ -0.86
SHU2P38957 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.69□□□□□ -0.86
SHU2P38957 PHO89YBR296C 1725 nt9.68□□□□□ -0.86
SHU2P38957 THI74YDR438W 1113 nt9.68□□□□□ -0.86
SHU2P38957 TIF6YPR016C 738 nt9.68□□□□□ -0.86
SHU2P38957 ZRT3YKL175W 1512 nt9.67□□□□□ -0.86
SHU2P38957 DBP1YPL119C 1854 nt9.67□□□□□ -0.86
SHU2P38957 HIP1YGR191W 1812 nt9.66□□□□□ -0.86
SHU2P38957 RPC82YPR190C 1965 nt9.65□□□□□ -0.86
SHU2P38957 UBX6YJL048C 1191 nt9.65□□□□□ -0.86
SHU2P38957 LCP5YER127W 1074 nt9.64□□□□□ -0.87
SHU2P38957 COQ2YNR041C 1119 nt9.64□□□□□ -0.87
SHU2P38957 PAB1YER165W 1734 nt9.64□□□□□ -0.87
SHU2P38957 YSR3YKR053C 1215 nt9.63□□□□□ -0.87
SHU2P38957 SPT20YOL148C 1815 nt9.63□□□□□ -0.87
SHU2P38957 INA1YLR413W 2028 nt9.63□□□□□ -0.87
SHU2P38957 FRE6YLL051C 2139 nt9.62□□□□□ -0.87
SHU2P38957 PEX2YJL210W 816 nt9.62□□□□□ -0.87
SHU2P38957 YCR087WYCR087W 516 nt9.61□□□□□ -0.87
SHU2P38957 ABZ2YMR289W 1125 nt9.61□□□□□ -0.87
SHU2P38957 HSL7YBR133C 2484 nt9.61□□□□□ -0.87
SHU2P38957 MSF1YPR047W 1410 nt9.6□□□□□ -0.87
SHU2P38957 YAR028WYAR028W 705 nt9.58□□□□□ -0.88
SHU2P38957 NAT4YMR069W 858 nt9.58□□□□□ -0.88
SHU2P38957 HXT1YHR094C 1713 nt9.58□□□□□ -0.88
SHU2P38957 MET28YIR017C 564 nt9.57□□□□□ -0.88
SHU2P38957 URH1YDR400W 1023 nt9.56□□□□□ -0.88
SHU2P38957 YJL067WYJL067W 351 nt9.56□□□□□ -0.88
SHU2P38957 MRP20YDR405W 792 nt9.55□□□□□ -0.88
SHU2P38957 RPM1RPM1 483 nt9.55□□□□□ -0.88
SHU2P38957 YGL034CYGL034C 366 nt9.53□□□□□ -0.88
SHU2P38957 SHY1YGR112W 1170 nt9.53□□□□□ -0.88
SHU2P38957 XYL2YLR070C 1071 nt9.53□□□□□ -0.88
SHU2P38957 AIM45YPR004C 1035 nt9.53□□□□□ -0.88
SHU2P38957 YBL086CYBL086C 1401 nt9.53□□□□□ -0.88
SHU2P38957 MTG2YHR168W 1557 nt9.53□□□□□ -0.88
SHU2P38957 RPL4BYDR012W 1089 nt9.52□□□□□ -0.89
SHU2P38957 SED1YDR077W 1017 nt9.52□□□□□ -0.89
SHU2P38957 YJL118WYJL118W 660 nt9.52□□□□□ -0.89
SHU2P38957 UTH1YKR042W 1098 nt9.52□□□□□ -0.89
SHU2P38957 RPL4AYBR031W 1089 nt9.52□□□□□ -0.89
SHU2P38957 NRT1YOR071C 1797 nt9.5□□□□□ -0.89
SHU2P38957 LIP1YMR298W 453 nt9.5□□□□□ -0.89
SHU2P38957 RPS14BYJL191W 417 nt9.49□□□□□ -0.89
SHU2P38957 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.48□□□□□ -0.89
SHU2P38957 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.48□□□□□ -0.89
SHU2P38957 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.48□□□□□ -0.89
SHU2P38957 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.48□□□□□ -0.89
SHU2P38957 FIT3YOR383C 615 nt9.48□□□□□ -0.89
SHU2P38957 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.48□□□□□ -0.89
SHU2P38957 AI5_BETAQ0075 1065 nt9.47□□□□□ -0.89
SHU2P38957 TOM20YGR082W 552 nt9.47□□□□□ -0.89
SHU2P38957 LEU9YOR108W 1815 nt9.47□□□□□ -0.89
SHU2P38957 UFO1YML088W 2007 nt9.45□□□□□ -0.9
SHU2P38957 ZTA1YBR046C 1005 nt9.45□□□□□ -0.9
SHU2P38957 ALP1YNL270C 1722 nt9.45□□□□□ -0.9
SHU2P38957 URA6YKL024C 615 nt9.44□□□□□ -0.9
SHU2P38957 YPL041CYPL041C 624 nt9.44□□□□□ -0.9
SHU2P38957 AKR2YOR034C 2250 nt9.43□□□□□ -0.9
SHU2P38957 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.43□□□□□ -0.9
SHU2P38957 BUR6YER159C 429 nt9.42□□□□□ -0.9
SHU2P38957 YPL251WYPL251W 303 nt9.42□□□□□ -0.9
SHU2P38957 ILV3YJR016C 1758 nt9.38□□□□□ -0.91
SHU2P38957 SAM1YLR180W 1149 nt9.38□□□□□ -0.91
SHU2P38957 COG1YGL223C 1254 nt9.37□□□□□ -0.91
SHU2P38957 BRR1YPR057W 1026 nt9.37□□□□□ -0.91
SHU2P38957 FTH1YBR207W 1398 nt9.37□□□□□ -0.91
SHU2P38957 HOL1YNR055C 1761 nt9.35□□□□□ -0.91
SHU2P38957 RBG1YAL036C 1110 nt9.34□□□□□ -0.91
SHU2P38957 SBA1YKL117W 651 nt9.34□□□□□ -0.91
SHU2P38957 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt9.34□□□□□ -0.91
SHU2P38957 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt9.33□□□□□ -0.92
SHU2P38957 OYE3YPL171C 1203 nt9.33□□□□□ -0.92
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