Protein–RNA interactions for Protein: P38915

SPT8, Transcription factor SPT8, yeastyeast

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Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT8P38915 GAP1YKR039W 1809 nt10.89□□□□□ -0.67
SPT8P38915 PRO1YDR300C 1287 nt10.89□□□□□ -0.67
SPT8P38915 THI74YDR438W 1113 nt10.88□□□□□ -0.67
SPT8P38915 UTR1YJR049C 1593 nt10.87□□□□□ -0.67
SPT8P38915 PRM5YIL117C 957 nt10.87□□□□□ -0.67
SPT8P38915 YML089CYML089C 369 nt10.85□□□□□ -0.67
SPT8P38915 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.84□□□□□ -0.67
SPT8P38915 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.83□□□□□ -0.68
SPT8P38915 YAT1YAR035W 2064 nt10.82□□□□□ -0.68
SPT8P38915 PHO89YBR296C 1725 nt10.81□□□□□ -0.68
SPT8P38915 HIF1YLL022C 1158 nt10.81□□□□□ -0.68
SPT8P38915 HSL7YBR133C 2484 nt10.81□□□□□ -0.68
SPT8P38915 TOM6YOR045W 186 nt10.8□□□□□ -0.68
SPT8P38915 MSF1YPR047W 1410 nt10.8□□□□□ -0.68
SPT8P38915 ATG15YCR068W 1563 nt10.8□□□□□ -0.68
SPT8P38915 ALD4YOR374W 1560 nt10.8□□□□□ -0.68
SPT8P38915 NAT4YMR069W 858 nt10.79□□□□□ -0.68
SPT8P38915 YSR3YKR053C 1215 nt10.78□□□□□ -0.68
SPT8P38915 NDI1YML120C 1542 nt10.78□□□□□ -0.68
SPT8P38915 COQ2YNR041C 1119 nt10.76□□□□□ -0.69
SPT8P38915 DIF1YLR437C 402 nt10.74□□□□□ -0.69
SPT8P38915 TIF6YPR016C 738 nt10.74□□□□□ -0.69
SPT8P38915 HIP1YGR191W 1812 nt10.74□□□□□ -0.69
SPT8P38915 YCR087WYCR087W 516 nt10.72□□□□□ -0.69
SPT8P38915 YGL034CYGL034C 366 nt10.71□□□□□ -0.69
SPT8P38915 SAM35YHR083W 990 nt10.71□□□□□ -0.69
SPT8P38915 PEX2YJL210W 816 nt10.7□□□□□ -0.7
SPT8P38915 XYL2YLR070C 1071 nt10.7□□□□□ -0.7
SPT8P38915 MRP20YDR405W 792 nt10.68□□□□□ -0.7
SPT8P38915 AIM45YPR004C 1035 nt10.65□□□□□ -0.7
SPT8P38915 DBP1YPL119C 1854 nt10.65□□□□□ -0.7
SPT8P38915 SPT20YOL148C 1815 nt10.64□□□□□ -0.71
SPT8P38915 MET28YIR017C 564 nt10.64□□□□□ -0.71
SPT8P38915 RPL4BYDR012W 1089 nt10.61□□□□□ -0.71
SPT8P38915 RPL4AYBR031W 1089 nt10.61□□□□□ -0.71
SPT8P38915 UTH1YKR042W 1098 nt10.59□□□□□ -0.71
SPT8P38915 YAR028WYAR028W 705 nt10.59□□□□□ -0.71
SPT8P38915 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.59□□□□□ -0.71
SPT8P38915 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.59□□□□□ -0.71
SPT8P38915 ZRT3YKL175W 1512 nt10.58□□□□□ -0.72
SPT8P38915 NRT1YOR071C 1797 nt10.57□□□□□ -0.72
SPT8P38915 CLB6YGR109C 1143 nt10.57□□□□□ -0.72
SPT8P38915 RPS14BYJL191W 417 nt10.57□□□□□ -0.72
SPT8P38915 RPC82YPR190C 1965 nt10.56□□□□□ -0.72
SPT8P38915 INA1YLR413W 2028 nt10.56□□□□□ -0.72
SPT8P38915 MTG2YHR168W 1557 nt10.56□□□□□ -0.72
SPT8P38915 HXT1YHR094C 1713 nt10.55□□□□□ -0.72
SPT8P38915 SBA1YKL117W 651 nt10.52□□□□□ -0.73
SPT8P38915 SED1YDR077W 1017 nt10.51□□□□□ -0.73
SPT8P38915 RBG1YAL036C 1110 nt10.51□□□□□ -0.73
SPT8P38915 FIT3YOR383C 615 nt10.51□□□□□ -0.73
SPT8P38915 YBL086CYBL086C 1401 nt10.5□□□□□ -0.73
SPT8P38915 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.49□□□□□ -0.73
SPT8P38915 SHY1YGR112W 1170 nt10.49□□□□□ -0.73
SPT8P38915 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.49□□□□□ -0.73
SPT8P38915 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.49□□□□□ -0.73
SPT8P38915 LIP1YMR298W 453 nt10.49□□□□□ -0.73
SPT8P38915 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.49□□□□□ -0.73
SPT8P38915 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.49□□□□□ -0.73
SPT8P38915 ALP1YNL270C 1722 nt10.48□□□□□ -0.73
SPT8P38915 ZTA1YBR046C 1005 nt10.48□□□□□ -0.73
SPT8P38915 YJL067WYJL067W 351 nt10.47□□□□□ -0.73
SPT8P38915 HEL2YDR266C 1920 nt10.45□□□□□ -0.74
SPT8P38915 LEU9YOR108W 1815 nt10.44□□□□□ -0.74
SPT8P38915 AKR2YOR034C 2250 nt10.44□□□□□ -0.74
SPT8P38915 UFO1YML088W 2007 nt10.41□□□□□ -0.74
SPT8P38915 YPL251WYPL251W 303 nt10.4□□□□□ -0.74
SPT8P38915 TSC10YBR265W 963 nt10.4□□□□□ -0.74
SPT8P38915 RIM8YGL045W 1629 nt10.38□□□□□ -0.75
SPT8P38915 URA6YKL024C 615 nt10.38□□□□□ -0.75
SPT8P38915 YLR279WYLR279W 390 nt10.38□□□□□ -0.75
SPT8P38915 BRR1YPR057W 1026 nt10.35□□□□□ -0.75
SPT8P38915 SAM1YLR180W 1149 nt10.34□□□□□ -0.75
SPT8P38915 YGL114WYGL114W 2178 nt10.33□□□□□ -0.76
SPT8P38915 YGR012WYGR012W 1182 nt10.32□□□□□ -0.76
SPT8P38915 MUP1YGR055W 1725 nt10.32□□□□□ -0.76
SPT8P38915 MSB4YOL112W 1479 nt10.31□□□□□ -0.76
SPT8P38915 TOA2YKL058W 369 nt10.3□□□□□ -0.76
SPT8P38915 FRE6YLL051C 2139 nt10.3□□□□□ -0.76
SPT8P38915 TRT2tT(CGU)K 72 nt10.27□□□□□ -0.77
SPT8P38915 SDH5YOL071W 489 nt10.27□□□□□ -0.77
SPT8P38915 OYE3YPL171C 1203 nt10.27□□□□□ -0.77
SPT8P38915 GND2YGR256W 1479 nt10.25□□□□□ -0.77
SPT8P38915 UGA4YDL210W 1716 nt10.25□□□□□ -0.77
SPT8P38915 HOL1YNR055C 1761 nt10.25□□□□□ -0.77
SPT8P38915 RAD23YEL037C 1197 nt10.25□□□□□ -0.77
SPT8P38915 YMR103CYMR103C 363 nt10.25□□□□□ -0.77
SPT8P38915 GLR1YPL091W 1452 nt10.24□□□□□ -0.77
SPT8P38915 MEP3YPR138C 1470 nt10.24□□□□□ -0.77
SPT8P38915 FCY21YER060W 1587 nt10.24□□□□□ -0.77
SPT8P38915 PET8YNL003C 855 nt10.24□□□□□ -0.77
SPT8P38915 ILV3YJR016C 1758 nt10.23□□□□□ -0.77
SPT8P38915 APT2YDR441C 546 nt10.21□□□□□ -0.77
SPT8P38915 CAB5YDR196C 726 nt10.2□□□□□ -0.78
SPT8P38915 OXA1YER154W 1209 nt10.18□□□□□ -0.78
SPT8P38915 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt10.18□□□□□ -0.78
SPT8P38915 CWC15YDR163W 528 nt10.17□□□□□ -0.78
SPT8P38915 RIB3YDR487C 627 nt10.17□□□□□ -0.78
SPT8P38915 YMR244WYMR244W 1068 nt10.17□□□□□ -0.78
SPT8P38915 YOR325WYOR325W 474 nt10.17□□□□□ -0.78
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