Protein–RNA interactions for Protein: P38911

FPR3, FK506-binding nuclear protein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FPR3P38911 SHH4YLR164W 507 nt12.27□□□□□ -0.45
FPR3P38911 YDR010CYDR010C 333 nt12.26□□□□□ -0.45
FPR3P38911 PRO1YDR300C 1287 nt12.26□□□□□ -0.45
FPR3P38911 MIR1YJR077C 936 nt12.26□□□□□ -0.45
FPR3P38911 SAM35YHR083W 990 nt12.25□□□□□ -0.45
FPR3P38911 SHB17YKR043C 816 nt12.25□□□□□ -0.45
FPR3P38911 YML089CYML089C 369 nt12.25□□□□□ -0.45
FPR3P38911 SBA1YKL117W 651 nt12.23□□□□□ -0.45
FPR3P38911 CMP2YML057W 1815 nt12.21□□□□□ -0.46
FPR3P38911 MSF1YPR047W 1410 nt12.2□□□□□ -0.46
FPR3P38911 RET2YFR051C 1641 nt12.2□□□□□ -0.46
FPR3P38911 ATG15YCR068W 1563 nt12.19□□□□□ -0.46
FPR3P38911 THI74YDR438W 1113 nt12.19□□□□□ -0.46
FPR3P38911 SFA1YDL168W 1161 nt12.18□□□□□ -0.46
FPR3P38911 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt12.18□□□□□ -0.46
FPR3P38911 YAT1YAR035W 2064 nt12.15□□□□□ -0.46
FPR3P38911 UBA4YHR111W 1323 nt12.14□□□□□ -0.47
FPR3P38911 TOM6YOR045W 186 nt12.12□□□□□ -0.47
FPR3P38911 NDI1YML120C 1542 nt12.11□□□□□ -0.47
FPR3P38911 PHO89YBR296C 1725 nt12.1□□□□□ -0.47
FPR3P38911 DIF1YLR437C 402 nt12.09□□□□□ -0.47
FPR3P38911 ZRT3YKL175W 1512 nt12.09□□□□□ -0.47
FPR3P38911 RDN25-1RDN25-1 3396 nt12.08□□□□□ -0.48
FPR3P38911 RDN25-2RDN25-2 3396 nt12.08□□□□□ -0.48
FPR3P38911 YSR3YKR053C 1215 nt12.05□□□□□ -0.48
FPR3P38911 INA1YLR413W 2028 nt12.04□□□□□ -0.48
FPR3P38911 TIF6YPR016C 738 nt12.04□□□□□ -0.48
FPR3P38911 YCR087WYCR087W 516 nt12.03□□□□□ -0.48
FPR3P38911 PEX2YJL210W 816 nt12.01□□□□□ -0.49
FPR3P38911 HIP1YGR191W 1812 nt12.01□□□□□ -0.49
FPR3P38911 DBP1YPL119C 1854 nt12.01□□□□□ -0.49
FPR3P38911 MRP20YDR405W 792 nt12□□□□□ -0.49
FPR3P38911 COQ2YNR041C 1119 nt12□□□□□ -0.49
FPR3P38911 SPT20YOL148C 1815 nt12□□□□□ -0.49
FPR3P38911 HXT1YHR094C 1713 nt11.98□□□□□ -0.49
FPR3P38911 YGL034CYGL034C 366 nt11.97□□□□□ -0.49
FPR3P38911 MET28YIR017C 564 nt11.97□□□□□ -0.49
FPR3P38911 HEL2YDR266C 1920 nt11.97□□□□□ -0.49
FPR3P38911 RPC82YPR190C 1965 nt11.96□□□□□ -0.5
FPR3P38911 YAR028WYAR028W 705 nt11.95□□□□□ -0.5
FPR3P38911 CLB6YGR109C 1143 nt11.93□□□□□ -0.5
FPR3P38911 XYL2YLR070C 1071 nt11.91□□□□□ -0.5
FPR3P38911 RPL4BYDR012W 1089 nt11.9□□□□□ -0.5
FPR3P38911 UTH1YKR042W 1098 nt11.9□□□□□ -0.5
FPR3P38911 RPL4AYBR031W 1089 nt11.9□□□□□ -0.5
FPR3P38911 NRT1YOR071C 1797 nt11.9□□□□□ -0.51
FPR3P38911 YJL067WYJL067W 351 nt11.89□□□□□ -0.51
FPR3P38911 LIP1YMR298W 453 nt11.89□□□□□ -0.51
FPR3P38911 AIM45YPR004C 1035 nt11.88□□□□□ -0.51
FPR3P38911 SED1YDR077W 1017 nt11.87□□□□□ -0.51
FPR3P38911 SHY1YGR112W 1170 nt11.87□□□□□ -0.51
FPR3P38911 MTG2YHR168W 1557 nt11.85□□□□□ -0.51
FPR3P38911 FIT3YOR383C 615 nt11.85□□□□□ -0.51
FPR3P38911 YMR244WYMR244W 1068 nt11.84□□□□□ -0.51
FPR3P38911 FRE6YLL051C 2139 nt11.84□□□□□ -0.51
FPR3P38911 YBL086CYBL086C 1401 nt11.83□□□□□ -0.52
FPR3P38911 GLR1YPL091W 1452 nt11.83□□□□□ -0.52
FPR3P38911 YER190C-AYER190C-A 576 nt11.82□□□□□ -0.52
FPR3P38911 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt11.82□□□□□ -0.52
FPR3P38911 YML133W-AYML133W-A 576 nt11.82□□□□□ -0.52
FPR3P38911 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt11.82□□□□□ -0.52
FPR3P38911 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt11.82□□□□□ -0.52
FPR3P38911 ALP1YNL270C 1722 nt11.82□□□□□ -0.52
FPR3P38911 RPS14BYJL191W 417 nt11.8□□□□□ -0.52
FPR3P38911 URA6YKL024C 615 nt11.78□□□□□ -0.52
FPR3P38911 RBG1YAL036C 1110 nt11.77□□□□□ -0.53
FPR3P38911 AKR2YOR034C 2250 nt11.77□□□□□ -0.53
FPR3P38911 LEU9YOR108W 1815 nt11.76□□□□□ -0.53
FPR3P38911 SAM1YLR180W 1149 nt11.75□□□□□ -0.53
FPR3P38911 ZTA1YBR046C 1005 nt11.72□□□□□ -0.53
FPR3P38911 UFO1YML088W 2007 nt11.7□□□□□ -0.54
FPR3P38911 BRR1YPR057W 1026 nt11.7□□□□□ -0.54
FPR3P38911 TOA2YKL058W 369 nt11.69□□□□□ -0.54
FPR3P38911 YPL251WYPL251W 303 nt11.67□□□□□ -0.54
FPR3P38911 TSC10YBR265W 963 nt11.66□□□□□ -0.54
FPR3P38911 ILV3YJR016C 1758 nt11.65□□□□□ -0.54
FPR3P38911 PET8YNL003C 855 nt11.65□□□□□ -0.54
FPR3P38911 RBG2YGR173W 1107 nt11.64□□□□□ -0.55
FPR3P38911 OYE3YPL171C 1203 nt11.64□□□□□ -0.55
FPR3P38911 CWC15YDR163W 528 nt11.63□□□□□ -0.55
FPR3P38911 SSN3YPL042C 1668 nt11.62□□□□□ -0.55
FPR3P38911 TRT2tT(CGU)K 72 nt11.62□□□□□ -0.55
FPR3P38911 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt11.61□□□□□ -0.55
FPR3P38911 MUP1YGR055W 1725 nt11.6□□□□□ -0.55
FPR3P38911 GND2YGR256W 1479 nt11.6□□□□□ -0.55
FPR3P38911 YMR226CYMR226C 804 nt11.6□□□□□ -0.55
FPR3P38911 RIM8YGL045W 1629 nt11.58□□□□□ -0.56
FPR3P38911 HOL1YNR055C 1761 nt11.58□□□□□ -0.56
FPR3P38911 MET2YNL277W 1461 nt11.57□□□□□ -0.56
FPR3P38911 MEP3YPR138C 1470 nt11.57□□□□□ -0.56
FPR3P38911 YLR279WYLR279W 390 nt11.57□□□□□ -0.56
FPR3P38911 YMR103CYMR103C 363 nt11.56□□□□□ -0.56
FPR3P38911 YNL024CYNL024C 741 nt11.56□□□□□ -0.56
FPR3P38911 YOR325WYOR325W 474 nt11.56□□□□□ -0.56
FPR3P38911 SFP1YLR403W 2052 nt11.55□□□□□ -0.56
FPR3P38911 SDH5YOL071W 489 nt11.54□□□□□ -0.56
FPR3P38911 OPI10YOL032W 741 nt11.53□□□□□ -0.56
FPR3P38911 SAM2YDR502C 1155 nt11.52□□□□□ -0.57
FPR3P38911 YGR012WYGR012W 1182 nt11.52□□□□□ -0.57
FPR3P38911 MAE1YKL029C 2010 nt11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31 ms