Protein–RNA interactions for Protein: P38344

REI1, Cytoplasmic 60S subunit biogenesis factor REI1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
REI1P38344 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.6□□□□□ -0.71
REI1P38344 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.6□□□□□ -0.71
REI1P38344 PRO1YDR300C 1287 nt10.58□□□□□ -0.72
REI1P38344 ZRT3YKL175W 1512 nt10.55□□□□□ -0.72
REI1P38344 SAM35YHR083W 990 nt10.55□□□□□ -0.72
REI1P38344 POM34YLR018C 900 nt10.55□□□□□ -0.72
REI1P38344 ATG15YCR068W 1563 nt10.49□□□□□ -0.73
REI1P38344 YFR018CYFR018C 1092 nt10.49□□□□□ -0.73
REI1P38344 YDR010CYDR010C 333 nt10.47□□□□□ -0.73
REI1P38344 YJL067WYJL067W 351 nt10.47□□□□□ -0.73
REI1P38344 DIF1YLR437C 402 nt10.47□□□□□ -0.73
REI1P38344 DBP1YPL119C 1854 nt10.47□□□□□ -0.73
REI1P38344 SFA1YDL168W 1161 nt10.45□□□□□ -0.74
REI1P38344 YML089CYML089C 369 nt10.45□□□□□ -0.74
REI1P38344 PAU7YAR020C 168 nt10.44□□□□□ -0.74
REI1P38344 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.42□□□□□ -0.74
REI1P38344 PRE6YOL038W 765 nt10.42□□□□□ -0.74
REI1P38344 TOM6YOR045W 186 nt10.42□□□□□ -0.74
REI1P38344 SHB17YKR043C 816 nt10.41□□□□□ -0.74
REI1P38344 HXT1YHR094C 1713 nt10.41□□□□□ -0.74
REI1P38344 MUP1YGR055W 1725 nt10.38□□□□□ -0.75
REI1P38344 HOL1YNR055C 1761 nt10.37□□□□□ -0.75
REI1P38344 SHY1YGR112W 1170 nt10.36□□□□□ -0.75
REI1P38344 RET2YFR051C 1641 nt10.36□□□□□ -0.75
REI1P38344 RIM8YGL045W 1629 nt10.34□□□□□ -0.75
REI1P38344 TIF6YPR016C 738 nt10.34□□□□□ -0.75
REI1P38344 PAU21YOR394W 495 nt10.33□□□□□ -0.76
REI1P38344 PAU22YPL282C 495 nt10.33□□□□□ -0.76
REI1P38344 HEL2YDR266C 1920 nt10.31□□□□□ -0.76
REI1P38344 YGL114WYGL114W 2178 nt10.31□□□□□ -0.76
REI1P38344 MIR1YJR077C 936 nt10.31□□□□□ -0.76
REI1P38344 PEX2YJL210W 816 nt10.3□□□□□ -0.76
REI1P38344 YBL086CYBL086C 1401 nt10.3□□□□□ -0.76
REI1P38344 ILV3YJR016C 1758 nt10.29□□□□□ -0.76
REI1P38344 HIP1YGR191W 1812 nt10.29□□□□□ -0.76
REI1P38344 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.28□□□□□ -0.76
REI1P38344 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.28□□□□□ -0.76
REI1P38344 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.28□□□□□ -0.76
REI1P38344 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.28□□□□□ -0.76
REI1P38344 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.28□□□□□ -0.76
REI1P38344 LIP1YMR298W 453 nt10.27□□□□□ -0.77
REI1P38344 YOR325WYOR325W 474 nt10.27□□□□□ -0.77
REI1P38344 PHO89YBR296C 1725 nt10.27□□□□□ -0.77
REI1P38344 YAR028WYAR028W 705 nt10.26□□□□□ -0.77
REI1P38344 UBA4YHR111W 1323 nt10.26□□□□□ -0.77
REI1P38344 SED1YDR077W 1017 nt10.24□□□□□ -0.77
REI1P38344 YNL024CYNL024C 741 nt10.24□□□□□ -0.77
REI1P38344 MTG2YHR168W 1557 nt10.23□□□□□ -0.77
REI1P38344 URA6YKL024C 615 nt10.23□□□□□ -0.77
REI1P38344 ARO7YPR060C 771 nt10.23□□□□□ -0.77
REI1P38344 COQ2YNR041C 1119 nt10.22□□□□□ -0.77
REI1P38344 UFO1YML088W 2007 nt10.22□□□□□ -0.77
REI1P38344 RRT5YFR032C 870 nt10.21□□□□□ -0.77
REI1P38344 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt10.21□□□□□ -0.77
REI1P38344 MET28YIR017C 564 nt10.2□□□□□ -0.78
REI1P38344 LEU9YOR108W 1815 nt10.2□□□□□ -0.78
REI1P38344 YDR094WYDR094W 336 nt10.19□□□□□ -0.78
REI1P38344 MRP20YDR405W 792 nt10.17□□□□□ -0.78
REI1P38344 UBX6YJL048C 1191 nt10.16□□□□□ -0.78
REI1P38344 YSR3YKR053C 1215 nt10.16□□□□□ -0.78
REI1P38344 MET8YBR213W 825 nt10.16□□□□□ -0.78
REI1P38344 FRE6YLL051C 2139 nt10.16□□□□□ -0.78
REI1P38344 CWC15YDR163W 528 nt10.15□□□□□ -0.78
REI1P38344 THI74YDR438W 1113 nt10.15□□□□□ -0.78
REI1P38344 SAM1YLR180W 1149 nt10.15□□□□□ -0.78
REI1P38344 OPI10YOL032W 741 nt10.15□□□□□ -0.78
REI1P38344 YPL251WYPL251W 303 nt10.15□□□□□ -0.78
REI1P38344 ZTA1YBR046C 1005 nt10.14□□□□□ -0.79
REI1P38344 BRR1YPR057W 1026 nt10.13□□□□□ -0.79
REI1P38344 COQ8YGL119W 1506 nt10.12□□□□□ -0.79
REI1P38344 NRT1YOR071C 1797 nt10.12□□□□□ -0.79
REI1P38344 PAU16YKL224C 372 nt10.12□□□□□ -0.79
REI1P38344 OYE3YPL171C 1203 nt10.12□□□□□ -0.79
REI1P38344 AKR2YOR034C 2250 nt10.12□□□□□ -0.79
REI1P38344 ALP1YNL270C 1722 nt10.11□□□□□ -0.79
REI1P38344 CCT2YIL142W 1584 nt10.11□□□□□ -0.79
REI1P38344 TOA2YKL058W 369 nt10.11□□□□□ -0.79
REI1P38344 ARO8YGL202W 1503 nt10.11□□□□□ -0.79
REI1P38344 YCR087WYCR087W 516 nt10.09□□□□□ -0.79
REI1P38344 UTH1YKR042W 1098 nt10.09□□□□□ -0.79
REI1P38344 PET8YNL003C 855 nt10.09□□□□□ -0.79
REI1P38344 UGP1YKL035W 1500 nt10.08□□□□□ -0.8
REI1P38344 XYL2YLR070C 1071 nt10.08□□□□□ -0.8
REI1P38344 GND2YGR256W 1479 nt10.07□□□□□ -0.8
REI1P38344 LSB6YJL100W 1824 nt10.07□□□□□ -0.8
REI1P38344 RPL4BYDR012W 1089 nt10.06□□□□□ -0.8
REI1P38344 TRT2tT(CGU)K 72 nt10.06□□□□□ -0.8
REI1P38344 RPL4AYBR031W 1089 nt10.06□□□□□ -0.8
REI1P38344 FIT3YOR383C 615 nt10.06□□□□□ -0.8
REI1P38344 HIS2YFR025C 1008 nt10.05□□□□□ -0.8
REI1P38344 CLB6YGR109C 1143 nt10.05□□□□□ -0.8
REI1P38344 SBA1YKL117W 651 nt10.05□□□□□ -0.8
REI1P38344 MAE1YKL029C 2010 nt10.05□□□□□ -0.8
REI1P38344 ACH1YBL015W 1581 nt10.05□□□□□ -0.8
REI1P38344 KES1YPL145C 1305 nt10.04□□□□□ -0.8
REI1P38344 FMS1YMR020W 1527 nt10.03□□□□□ -0.8
REI1P38344 RPS14BYJL191W 417 nt10.03□□□□□ -0.8
REI1P38344 SGA1YIL099W 1650 nt10.02□□□□□ -0.8
REI1P38344 AIM45YPR004C 1035 nt10.02□□□□□ -0.81
REI1P38344 YMR209CYMR209C 1374 nt10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15 ms