RNAct
Search
Pairwise
Browse
Proteins
RNAs
Download
About
Search
Protein–RNA interactions for Protein: P28737
MSP1, Protein MSP1, yeast
Predictions only
Length
362 aa
.
Download Table
Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
MSP1
P28737
RIM8
YGL045W
1629 nt
11.34
□□□□□ -0.59
MSP1
P28737
RDN37-1
RDN37-1
5354 nt
11.33
□□□□□ -0.6
MSP1
P28737
RDN37-2
RDN37-2
5354 nt
11.33
□□□□□ -0.6
MSP1
P28737
ATG15
YCR068W
1563 nt
11.33
□□□□□ -0.6
MSP1
P28737
HEL2
YDR266C
1920 nt
11.29
□□□□□ -0.6
MSP1
P28737
DBP1
YPL119C
1854 nt
11.27
□□□□□ -0.6
MSP1
P28737
HOL1
YNR055C
1761 nt
11.27
□□□□□ -0.61
MSP1
P28737
DIF1
YLR437C
402 nt
11.27
□□□□□ -0.61
MSP1
P28737
HXT1
YHR094C
1713 nt
11.26
□□□□□ -0.61
MSP1
P28737
SFA1
YDL168W
1161 nt
11.26
□□□□□ -0.61
MSP1
P28737
TOM6
YOR045W
186 nt
11.26
□□□□□ -0.61
MSP1
P28737
YHL019W-A
YHL019W-A
594 nt
11.25
□□□□□ -0.61
MSP1
P28737
YDR010C
YDR010C
333 nt
11.24
□□□□□ -0.61
MSP1
P28737
PAU7
YAR020C
168 nt
11.24
□□□□□ -0.61
MSP1
P28737
SHY1
YGR112W
1170 nt
11.22
□□□□□ -0.61
MSP1
P28737
YML089C
YML089C
369 nt
11.21
□□□□□ -0.61
MSP1
P28737
PRE6
YOL038W
765 nt
11.21
□□□□□ -0.61
MSP1
P28737
YOR325W
YOR325W
474 nt
11.21
□□□□□ -0.61
MSP1
P28737
YGL114W
YGL114W
2178 nt
11.2
□□□□□ -0.62
MSP1
P28737
YNL024C
YNL024C
741 nt
11.2
□□□□□ -0.62
MSP1
P28737
SHB17
YKR043C
816 nt
11.19
□□□□□ -0.62
MSP1
P28737
RET2
YFR051C
1641 nt
11.19
□□□□□ -0.62
MSP1
P28737
YFR018C
YFR018C
1092 nt
11.17
□□□□□ -0.62
MSP1
P28737
YER190C-A
YER190C-A
576 nt
11.16
□□□□□ -0.62
MSP1
P28737
YGR296C-A
YGR296C-A
576 nt
11.16
□□□□□ -0.62
MSP1
P28737
YML133W-A
YML133W-A
576 nt
11.16
□□□□□ -0.62
MSP1
P28737
YNL339W-A
YNL339W-A
576 nt
11.16
□□□□□ -0.62
MSP1
P28737
YPL283W-A
YPL283W-A
576 nt
11.16
□□□□□ -0.62
MSP1
P28737
MRPL8
YJL063C
717 nt
11.15
□□□□□ -0.62
MSP1
P28737
ADO1
YJR105W
1023 nt
11.15
□□□□□ -0.62
MSP1
P28737
YBL086C
YBL086C
1401 nt
11.15
□□□□□ -0.62
MSP1
P28737
PEX2
YJL210W
816 nt
11.14
□□□□□ -0.63
MSP1
P28737
ILV3
YJR016C
1758 nt
11.13
□□□□□ -0.63
MSP1
P28737
TIF6
YPR016C
738 nt
11.12
□□□□□ -0.63
MSP1
P28737
LIP1
YMR298W
453 nt
11.1
□□□□□ -0.63
MSP1
P28737
YIL100C-A
YIL100C-A
339 nt
11.08
□□□□□ -0.64
MSP1
P28737
PHO89
YBR296C
1725 nt
11.06
□□□□□ -0.64
MSP1
P28737
HIP1
YGR191W
1812 nt
11.05
□□□□□ -0.64
MSP1
P28737
SED1
YDR077W
1017 nt
11.04
□□□□□ -0.64
MSP1
P28737
MRP20
YDR405W
792 nt
11.04
□□□□□ -0.64
MSP1
P28737
YAR028W
YAR028W
705 nt
11.04
□□□□□ -0.64
MSP1
P28737
UFO1
YML088W
2007 nt
11.03
□□□□□ -0.64
MSP1
P28737
CWC15
YDR163W
528 nt
11.03
□□□□□ -0.64
MSP1
P28737
MIR1
YJR077C
936 nt
11.03
□□□□□ -0.64
MSP1
P28737
URA6
YKL024C
615 nt
11.03
□□□□□ -0.64
MSP1
P28737
COQ8
YGL119W
1506 nt
11.01
□□□□□ -0.65
MSP1
P28737
MTG2
YHR168W
1557 nt
11.01
□□□□□ -0.65
MSP1
P28737
UBA4
YHR111W
1323 nt
11.01
□□□□□ -0.65
MSP1
P28737
COQ2
YNR041C
1119 nt
10.99
□□□□□ -0.65
MSP1
P28737
ARO8
YGL202W
1503 nt
10.99
□□□□□ -0.65
MSP1
P28737
SAM1
YLR180W
1149 nt
10.98
□□□□□ -0.65
MSP1
P28737
YMR209C
YMR209C
1374 nt
10.98
□□□□□ -0.65
MSP1
P28737
UGP1
YKL035W
1500 nt
10.98
□□□□□ -0.65
MSP1
P28737
CCT2
YIL142W
1584 nt
10.98
□□□□□ -0.65
MSP1
P28737
LEU9
YOR108W
1815 nt
10.98
□□□□□ -0.65
MSP1
P28737
TOA2
YKL058W
369 nt
10.97
□□□□□ -0.65
MSP1
P28737
OPI10
YOL032W
741 nt
10.97
□□□□□ -0.65
MSP1
P28737
ZTA1
YBR046C
1005 nt
10.97
□□□□□ -0.65
MSP1
P28737
YPL251W
YPL251W
303 nt
10.97
□□□□□ -0.65
MSP1
P28737
MAE1
YKL029C
2010 nt
10.96
□□□□□ -0.65
MSP1
P28737
BRR1
YPR057W
1026 nt
10.96
□□□□□ -0.65
MSP1
P28737
BET2
YPR176C
978 nt
10.96
□□□□□ -0.65
MSP1
P28737
MET28
YIR017C
564 nt
10.94
□□□□□ -0.66
MSP1
P28737
OYE3
YPL171C
1203 nt
10.94
□□□□□ -0.66
MSP1
P28737
AKR2
YOR034C
2250 nt
10.94
□□□□□ -0.66
MSP1
P28737
GND2
YGR256W
1479 nt
10.93
□□□□□ -0.66
MSP1
P28737
HIS2
YFR025C
1008 nt
10.93
□□□□□ -0.66
MSP1
P28737
YSR3
YKR053C
1215 nt
10.92
□□□□□ -0.66
MSP1
P28737
LSB6
YJL100W
1824 nt
10.91
□□□□□ -0.66
MSP1
P28737
KES1
YPL145C
1305 nt
10.91
□□□□□ -0.66
MSP1
P28737
RRT5
YFR032C
870 nt
10.9
□□□□□ -0.66
MSP1
P28737
PET8
YNL003C
855 nt
10.9
□□□□□ -0.66
MSP1
P28737
NRT1
YOR071C
1797 nt
10.89
□□□□□ -0.67
MSP1
P28737
SGA1
YIL099W
1650 nt
10.89
□□□□□ -0.67
MSP1
P28737
ACH1
YBL015W
1581 nt
10.87
□□□□□ -0.67
MSP1
P28737
THI74
YDR438W
1113 nt
10.87
□□□□□ -0.67
MSP1
P28737
SPP2
YOR148C
558 nt
10.87
□□□□□ -0.67
MSP1
P28737
FMS1
YMR020W
1527 nt
10.86
□□□□□ -0.67
MSP1
P28737
TRT2
tT(CGU)K
72 nt
10.86
□□□□□ -0.67
MSP1
P28737
SBA1
YKL117W
651 nt
10.86
□□□□□ -0.67
MSP1
P28737
YMR103C
YMR103C
363 nt
10.86
□□□□□ -0.67
MSP1
P28737
ALP1
YNL270C
1722 nt
10.85
□□□□□ -0.67
MSP1
P28737
XYL2
YLR070C
1071 nt
10.85
□□□□□ -0.67
MSP1
P28737
MEP3
YPR138C
1470 nt
10.82
□□□□□ -0.68
MSP1
P28737
PAU16
YKL224C
372 nt
10.82
□□□□□ -0.68
MSP1
P28737
FLR1
YBR008C
1647 nt
10.82
□□□□□ -0.68
MSP1
P28737
RSC8
YFR037C
1674 nt
10.82
□□□□□ -0.68
MSP1
P28737
ACO2
YJL200C
2370 nt
10.81
□□□□□ -0.68
MSP1
P28737
UTH1
YKR042W
1098 nt
10.81
□□□□□ -0.68
MSP1
P28737
ZAP1
YJL056C
2643 nt
10.8
□□□□□ -0.68
MSP1
P28737
UBX6
YJL048C
1191 nt
10.79
□□□□□ -0.68
MSP1
P28737
YCR087W
YCR087W
516 nt
10.78
□□□□□ -0.68
MSP1
P28737
RPL4B
YDR012W
1089 nt
10.78
□□□□□ -0.68
MSP1
P28737
YDR094W
YDR094W
336 nt
10.78
□□□□□ -0.68
MSP1
P28737
RPL4A
YBR031W
1089 nt
10.78
□□□□□ -0.68
MSP1
P28737
YPS3
YLR121C
1527 nt
10.78
□□□□□ -0.68
MSP1
P28737
QDR2
YIL121W
1629 nt
10.76
□□□□□ -0.69
MSP1
P28737
CLB6
YGR109C
1143 nt
10.76
□□□□□ -0.69
MSP1
P28737
RPS14B
YJL191W
417 nt
10.76
□□□□□ -0.69
MSP1
P28737
FIT3
YOR383C
615 nt
10.76
□□□□□ -0.69
First
Previous
4
Next
Last
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.4 ms