Protein–RNA interactions for Protein: P14242

PMS1, DNA mismatch repair protein PMS1, yeastyeast

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PMS1P14242 PRO1YDR300C 1287 nt10.4□□□□□ -0.74
PMS1P14242 MCH5YOR306C 1566 nt10.39□□□□□ -0.75
PMS1P14242 POM34YLR018C 900 nt10.39□□□□□ -0.75
PMS1P14242 GAP1YKR039W 1809 nt10.39□□□□□ -0.75
PMS1P14242 ATG15YCR068W 1563 nt10.37□□□□□ -0.75
PMS1P14242 YCR087WYCR087W 516 nt10.37□□□□□ -0.75
PMS1P14242 YML089CYML089C 369 nt10.37□□□□□ -0.75
PMS1P14242 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.35□□□□□ -0.75
PMS1P14242 TOM6YOR045W 186 nt10.34□□□□□ -0.75
PMS1P14242 MRP20YDR405W 792 nt10.33□□□□□ -0.76
PMS1P14242 YGL034CYGL034C 366 nt10.33□□□□□ -0.76
PMS1P14242 UTR1YJR049C 1593 nt10.32□□□□□ -0.76
PMS1P14242 XYL2YLR070C 1071 nt10.32□□□□□ -0.76
PMS1P14242 NAR1YNL240C 1476 nt10.31□□□□□ -0.76
PMS1P14242 PRM5YIL117C 957 nt10.31□□□□□ -0.76
PMS1P14242 COQ2YNR041C 1119 nt10.31□□□□□ -0.76
PMS1P14242 SAM35YHR083W 990 nt10.3□□□□□ -0.76
PMS1P14242 FRE6YLL051C 2139 nt10.3□□□□□ -0.76
PMS1P14242 PEX2YJL210W 816 nt10.27□□□□□ -0.77
PMS1P14242 ALD4YOR374W 1560 nt10.26□□□□□ -0.77
PMS1P14242 PBP1YGR178C 2169 nt10.26□□□□□ -0.77
PMS1P14242 AIM45YPR004C 1035 nt10.25□□□□□ -0.77
PMS1P14242 SSN3YPL042C 1668 nt10.25□□□□□ -0.77
PMS1P14242 CYT2YKL087C 675 nt10.24□□□□□ -0.77
PMS1P14242 HIP1YGR191W 1812 nt10.23□□□□□ -0.77
PMS1P14242 CLB6YGR109C 1143 nt10.23□□□□□ -0.77
PMS1P14242 HIF1YLL022C 1158 nt10.22□□□□□ -0.77
PMS1P14242 TIF6YPR016C 738 nt10.22□□□□□ -0.77
PMS1P14242 RPL4BYDR012W 1089 nt10.21□□□□□ -0.77
PMS1P14242 DIF1YLR437C 402 nt10.21□□□□□ -0.77
PMS1P14242 RPL4AYBR031W 1089 nt10.21□□□□□ -0.77
PMS1P14242 UTH1YKR042W 1098 nt10.2□□□□□ -0.78
PMS1P14242 MET28YIR017C 564 nt10.19□□□□□ -0.78
PMS1P14242 RBG1YAL036C 1110 nt10.19□□□□□ -0.78
PMS1P14242 NRT1YOR071C 1797 nt10.17□□□□□ -0.78
PMS1P14242 NDI1YML120C 1542 nt10.13□□□□□ -0.79
PMS1P14242 RPS14BYJL191W 417 nt10.12□□□□□ -0.79
PMS1P14242 YAR028WYAR028W 705 nt10.12□□□□□ -0.79
PMS1P14242 FIT3YOR383C 615 nt10.09□□□□□ -0.79
PMS1P14242 HXT1YHR094C 1713 nt10.07□□□□□ -0.8
PMS1P14242 DBP1YPL119C 1854 nt10.06□□□□□ -0.8
PMS1P14242 ZRT3YKL175W 1512 nt10.04□□□□□ -0.8
PMS1P14242 SED1YDR077W 1017 nt10.04□□□□□ -0.8
PMS1P14242 MTG2YHR168W 1557 nt10.04□□□□□ -0.8
PMS1P14242 LIP1YMR298W 453 nt10.03□□□□□ -0.8
PMS1P14242 ALP1YNL270C 1722 nt10.03□□□□□ -0.8
PMS1P14242 AKR2YOR034C 2250 nt10.03□□□□□ -0.8
PMS1P14242 SDH5YOL071W 489 nt10.02□□□□□ -0.81
PMS1P14242 TSC10YBR265W 963 nt10.02□□□□□ -0.81
PMS1P14242 YER190C-AYER190C-A 576 nt10□□□□□ -0.81
PMS1P14242 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10□□□□□ -0.81
PMS1P14242 YML133W-AYML133W-A 576 nt10□□□□□ -0.81
PMS1P14242 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10□□□□□ -0.81
PMS1P14242 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10□□□□□ -0.81
PMS1P14242 GID7YCL039W 2238 nt10□□□□□ -0.81
PMS1P14242 ZTA1YBR046C 1005 nt9.99□□□□□ -0.81
PMS1P14242 YAT1YAR035W 2064 nt9.98□□□□□ -0.81
PMS1P14242 GLR1YPL091W 1452 nt9.97□□□□□ -0.81
PMS1P14242 YBL086CYBL086C 1401 nt9.95□□□□□ -0.82
PMS1P14242 SHY1YGR112W 1170 nt9.94□□□□□ -0.82
PMS1P14242 SAM1YLR180W 1149 nt9.94□□□□□ -0.82
PMS1P14242 YGR012WYGR012W 1182 nt9.93□□□□□ -0.82
PMS1P14242 YLR279WYLR279W 390 nt9.93□□□□□ -0.82
PMS1P14242 BSP1YPR171W 1731 nt9.93□□□□□ -0.82
PMS1P14242 INA1YLR413W 2028 nt9.92□□□□□ -0.82
PMS1P14242 SBA1YKL117W 651 nt9.9□□□□□ -0.82
PMS1P14242 YJL067WYJL067W 351 nt9.89□□□□□ -0.83
PMS1P14242 TOA2YKL058W 369 nt9.89□□□□□ -0.83
PMS1P14242 LEU9YOR108W 1815 nt9.89□□□□□ -0.83
PMS1P14242 YLR111WYLR111W 333 nt9.88□□□□□ -0.83
PMS1P14242 BRR1YPR057W 1026 nt9.88□□□□□ -0.83
PMS1P14242 MSB4YOL112W 1479 nt9.87□□□□□ -0.83
PMS1P14242 RAD23YEL037C 1197 nt9.87□□□□□ -0.83
PMS1P14242 YPL251WYPL251W 303 nt9.87□□□□□ -0.83
PMS1P14242 CMP2YML057W 1815 nt9.86□□□□□ -0.83
PMS1P14242 URA6YKL024C 615 nt9.85□□□□□ -0.83
PMS1P14242 YMR244WYMR244W 1068 nt9.84□□□□□ -0.83
PMS1P14242 MEP3YPR138C 1470 nt9.83□□□□□ -0.84
PMS1P14242 YMR226CYMR226C 804 nt9.82□□□□□ -0.84
PMS1P14242 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.82□□□□□ -0.84
PMS1P14242 RPC82YPR190C 1965 nt9.82□□□□□ -0.84
PMS1P14242 UFO1YML088W 2007 nt9.82□□□□□ -0.84
PMS1P14242 YMR103CYMR103C 363 nt9.81□□□□□ -0.84
PMS1P14242 SPT20YOL148C 1815 nt9.81□□□□□ -0.84
PMS1P14242 GND2YGR256W 1479 nt9.8□□□□□ -0.84
PMS1P14242 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.79□□□□□ -0.84
PMS1P14242 OYE3YPL171C 1203 nt9.79□□□□□ -0.84
PMS1P14242 MET2YNL277W 1461 nt9.79□□□□□ -0.84
PMS1P14242 PET8YNL003C 855 nt9.78□□□□□ -0.84
PMS1P14242 UGA4YDL210W 1716 nt9.76□□□□□ -0.85
PMS1P14242 RIB3YDR487C 627 nt9.76□□□□□ -0.85
PMS1P14242 SAM2YDR502C 1155 nt9.76□□□□□ -0.85
PMS1P14242 ESBP6YNL125C 2022 nt9.76□□□□□ -0.85
PMS1P14242 NPP1YCR026C 2229 nt9.76□□□□□ -0.85
PMS1P14242 CWC15YDR163W 528 nt9.74□□□□□ -0.85
PMS1P14242 APT2YDR441C 546 nt9.74□□□□□ -0.85
PMS1P14242 FCY21YER060W 1587 nt9.74□□□□□ -0.85
PMS1P14242 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.72□□□□□ -0.85
PMS1P14242 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.72□□□□□ -0.85
PMS1P14242 SFP1YLR403W 2052 nt9.72□□□□□ -0.85
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