Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NEDD8Q15843 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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