Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt7.09□□□□□ -1.27
NCR1Q12200 YJL015CYJL015C 285 nt7.09□□□□□ -1.27
NCR1Q12200 YHK8YHR048W 1545 nt7.09□□□□□ -1.27
NCR1Q12200 VPS17YOR132W 1656 nt7.09□□□□□ -1.27
NCR1Q12200 TOS2YGR221C 1869 nt7.09□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 POL4YCR014C 1749 nt7.08□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 ARE2YNR019W 1929 nt7.08□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 NCB2YDR397C 441 nt7.08□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 UBC8YEL012W 657 nt7.08□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 RGI2YIL057C 495 nt7.08□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 YLR434CYLR434C 384 nt7.08□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 RNH201YNL072W 924 nt7.08□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 RPS11BYBR048W 471 nt7.08□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 TRS65YGR166W 1683 nt7.08□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 AIM14YGL160W 1713 nt7.07□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 PPM2YOL141W 2088 nt7.07□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 UGA2YBR006W 1494 nt7.07□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 snR9snR9 187 nt7.07□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 PMI40YER003C 1290 nt7.07□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 PAM16YJL104W 450 nt7.07□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 ISF1YMR081C 1017 nt7.07□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 SWS2YNL081C 432 nt7.07□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 ESF2YNR054C 951 nt7.07□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 ZPS1YOL154W 750 nt7.07□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 YKR078WYKR078W 1758 nt7.07□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 YGR054WYGR054W 1929 nt7.07□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 YJL045WYJL045W 1905 nt7.07□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 VHR2YER064C 1518 nt7.06□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 LAG2YOL025W 1983 nt7.06□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 RSM24YDR175C 960 nt7.06□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.06□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 PGU1YJR153W 1086 nt7.06□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 YKT6YKL196C 603 nt7.06□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt7.06□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 GTT2YLL060C 702 nt7.06□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 YOR387CYOR387C 621 nt7.06□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 CAR1YPL111W 1002 nt7.06□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 APD1YBR151W 951 nt7.06□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 RRN11YML043C 1524 nt7.06□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 UBP13YBL067C 2244 nt7.05□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 PPN1YDR452W 2025 nt7.05□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 PTC3YBL056W 1407 nt7.05□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 BFR1YOR198C 1413 nt7.05□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 APA2YDR530C 978 nt7.05□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 CYC7YEL039C 342 nt7.05□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 ISC10YER180C 804 nt7.05□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 VPS29YHR012W 849 nt7.05□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt7.05□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt7.05□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 ATP3YBR039W 936 nt7.05□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 ISN1YOR155C 1353 nt7.05□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 SEO1YAL067C 1782 nt7.05□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 YMR279CYMR279C 1623 nt7.05□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 CMK2YOL016C 1344 nt7.04□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 MUD2YKL074C 1584 nt7.04□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 DPB4YDR121W 591 nt7.04□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt7.04□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 SUF16tG(GCC)C 71 nt7.04□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt7.04□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt7.04□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt7.04□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 SUF20tG(GCC)F1 71 nt7.04□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt7.04□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt7.04□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt7.04□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt7.04□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 SUF23tG(GCC)J2 71 nt7.04□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt7.04□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt7.04□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 SUF17tG(GCC)O2 71 nt7.04□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt7.04□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt7.04□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 MIG2YGL209W 1149 nt7.04□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 ICS3YJL077C 396 nt7.04□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 KRE9YJL174W 831 nt7.04□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt7.04□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 YLR374CYLR374C 390 nt7.04□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 GSH1YJL101C 2037 nt7.04□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 RSP5YER125W 2430 nt7.03□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 HEL1YKR017C 1656 nt7.03□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 SKY1YMR216C 2229 nt7.03□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 CDC36YDL165W 576 nt7.03□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 YPD1YDL235C 504 nt7.03□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 MTR3YGR158C 753 nt7.03□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 YIL054WYIL054W 318 nt7.03□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 DJP1YIR004W 1299 nt7.03□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 VMA4YOR332W 702 nt7.03□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 ERG11YHR007C 1593 nt7.03□□□□□ -1.28
NCR1Q12200 AYT1YLL063C 1425 nt7.02□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 NSI1YDR026C 1713 nt7.02□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 FAL1YDR021W 1200 nt7.02□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 ECO1YFR027W 846 nt7.02□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 CAB4YGR277C 918 nt7.02□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 YKL070WYKL070W 510 nt7.02□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt7.02□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt7.02□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 MED7YOL135C 669 nt7.02□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 DSF1YEL070W 1509 nt7.01□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 YNR073CYNR073C 1509 nt7.01□□□□□ -1.29
NCR1Q12200 TVP15YDR100W 432 nt7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 39.8 ms